Serotype-specific cell based assays for the characterization of Clostridia botulinum neurotoxins and genetically modified cells utilized in such assays are described. Such assays and genetically modified cells can discriminate between different serotypes of clostridium neurotoxins having the same SNARE protein substrate specificity, despite a lack of such discrimination in the parental cell line. This discrimination is achieved without the use of serotype-specific neutralizing antibodies and without the use of competing heavy chains derived from a Clostridia botulinum neurotoxin.
G01N 33/50 - Analyse chimique de matériau biologique, p. ex. de sang ou d'urineTest par des méthodes faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiques par ligandsTest immunologique
G01N 33/58 - Analyse chimique de matériau biologique, p. ex. de sang ou d'urineTest par des méthodes faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiques par ligandsTest immunologique faisant intervenir des substances marquées
2.
COMPOSITIONS AND METHODS FOR CHARACTERIZING BOTULINUM NEUROTOXINS
Clostridia botulinumbotulinumbotulinum neurotoxin having the same serotype, for example serotype E. Methods are also provided for generating and identifying cell lines that can be utilized in such cell based assays.
C12Q 1/37 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir une hydrolase faisant intervenir une peptidase ou une protéinase
C12Q 1/37 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir une hydrolase faisant intervenir une peptidase ou une protéinase
G01N 33/542 - Tests immunologiquesTests faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiquesMatériaux à cet effet avec formation d'un complexe immunologique en phase liquide avec inhibition stérique ou modification du signal, p. ex. extinction de fluorescence
Cells are described that are useful in rapid, sensitive, and accurate cell-based assays for enzyme activity, particularly for enzyme activities associated with botulinum toxins. Such cell expresses a construct that includes an anchor region, a cleavage site, and a reporting region having two or more identical reporter peptides. Enzymatic activity at the cleavage site releases the reporter region into the cytosol of the cell, where multiple degradation events occur. The observed change in the signal is proportional to the enzymatic activity.
C07K 14/435 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant d'animauxPeptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant d'humains
C12Q 1/37 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir une hydrolase faisant intervenir une peptidase ou une protéinase
5.
Cells for characterization of botulinum neurotoxins
C12Q 1/37 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir une hydrolase faisant intervenir une peptidase ou une protéinase
G01N 33/542 - Tests immunologiquesTests faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiquesMatériaux à cet effet avec formation d'un complexe immunologique en phase liquide avec inhibition stérique ou modification du signal, p. ex. extinction de fluorescence
Serotype-specific cell based assays for the characterization of Clostridia botulinum neurotoxins and genetically modified cells utilized in such assays are described. Such assays and genetically modified cells can discriminate between different serotypes of clostridium neurotoxins having the same SNARE protein substrate specificity, despite a lack of such discrimination in the parental cell line. This discrimination is achieved without the use of serotype-specific neutralizing antibodies and without the use of competing heavy chains derived from a Clostridia botulinum neurotoxin.
C07K 14/33 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant de bactéries provenant de Clostridium (G)
G01N 33/50 - Analyse chimique de matériau biologique, p. ex. de sang ou d'urineTest par des méthodes faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiques par ligandsTest immunologique
G01N 33/58 - Analyse chimique de matériau biologique, p. ex. de sang ou d'urineTest par des méthodes faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiques par ligandsTest immunologique faisant intervenir des substances marquées
Serotype-specific cell based assays for the characterization of Clostridia botulinum neurotoxins and genetically modified cells utilized in such assays are described. Such assays and genetically modified cells can discriminate between different serotypes of clostridium neurotoxins having the same SNARE protein substrate specificity, despite a lack of such discrimination in the parental cell line. This discrimination is achieved without the use of serotype-specific neutralizing antibodies and without the use of competing heavy chains derived from a Clostridia botulinum neurotoxin.
G01N 33/50 - Analyse chimique de matériau biologique, p. ex. de sang ou d'urineTest par des méthodes faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiques par ligandsTest immunologique
G01N 33/58 - Analyse chimique de matériau biologique, p. ex. de sang ou d'urineTest par des méthodes faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiques par ligandsTest immunologique faisant intervenir des substances marquées
C07K 14/33 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant de bactéries provenant de Clostridium (G)
Systems are described in which a primary detergent or surfactant in an aqueous solution is removed by the addition of a secondary detergent or surfactant in concentrations that exceed the critical micellar concentration (CMC) of the secondary detergent or surfactant using a size separation device. These systems are particularly applicable to protein-containing solutions. Typical primary detergents/surfactants include polysorbate 20, polysorbate 80, and Triton X-100. Suitable secondary detergents or surfactants can be ionic, nonionic, or zwitterionic. Typical secondary detergents/surfactants include, but are not limited to, galactoside detergents (e.g. octyl-β-galactoside), glucamide detergents (e.g. MEGA 8, MEGA 9, MEGA 10), cholamide detergents (e.g. CHAPS, CHAPSO, BIGCHAPS), and sulfobetaine detergents (such as sulfobetaine 3-10).
B01D 61/16 - Prétraitement du courant d'alimentation
G01N 33/68 - Analyse chimique de matériau biologique, p. ex. de sang ou d'urineTest par des méthodes faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiques par ligandsTest immunologique faisant intervenir des protéines, peptides ou amino-acides
Compositions for determining the efficacy and/or potency of a vaccine preparation are described herein. Splenocytes from immunized animals are isolated and can be frozen. Upon thawing such cells are activated by exposure to a series of dilutions of a vaccine preparation being tested and a series of dilutions of a reference vaccine with known characteristics. Cells secreting immunogen-specific antibody and cells secreting nonspecific antibody are enumerated, as is the amount of immunogen-specific and nonspecific antibody produced. Comparison between the results from the vaccine preparations provides a measure of relative vaccine efficacy and/or potency.
G01N 33/50 - Analyse chimique de matériau biologique, p. ex. de sang ou d'urineTest par des méthodes faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiques par ligandsTest immunologique
G01N 33/569 - Tests immunologiquesTests faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiquesMatériaux à cet effet pour micro-organismes, p. ex. protozoaires, bactéries, virus
G01N 33/94 - Analyse chimique de matériau biologique, p. ex. de sang ou d'urineTest par des méthodes faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiques par ligandsTest immunologique faisant intervenir des narcotiques
10.
Compositions and Methods for Treating Elevated Secretory Activity
Methods for treating diseases characterized by elevated secretory activity using a protease directed to a non-neuronal SNARE protein are described. The protease is produced by selective mutation of a botulinum neurotoxin light chain, and is characterized utilizing a reporting construct that includes all or part of the non-neuronal SNARE protein. Such a protease has utility in the treatment of diseases associated with hypersecretion, where the hypersecretion is mediated by a non-neuronal SNARE protein.
A61K 38/48 - Hydrolases (3) agissant sur des liaisons peptidiques (3.4)
C07K 14/47 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant d'animauxPeptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant d'humains provenant de vertébrés provenant de mammifères
C12Q 1/37 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir une hydrolase faisant intervenir une peptidase ou une protéinase
C07K 14/705 - RécepteursAntigènes de surface cellulaireDéterminants de surface cellulaire
C07K 14/435 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant d'animauxPeptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant d'humains
Compositions and methods for characterization binding proteins are described that include use of a reporting construct that incorporates a bait region that interacts with the binding protein and a reporter that is susceptible to degradation in the reporter's local environment. Complex formation between the bait region and the binding protein provides protection of the susceptible reporter from degradation. Such a reporting construct can be utilized to identify cells expressing a binding protein when the susceptible reporter is susceptible to degradation in cytosol.
G01N 33/542 - Tests immunologiquesTests faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiquesMatériaux à cet effet avec formation d'un complexe immunologique en phase liquide avec inhibition stérique ou modification du signal, p. ex. extinction de fluorescence
C07K 14/00 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés
C12N 15/85 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes eucaryotes pour cellules animales
G01N 33/58 - Analyse chimique de matériau biologique, p. ex. de sang ou d'urineTest par des méthodes faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiques par ligandsTest immunologique faisant intervenir des substances marquées
Cell based assays for botulinum neurotoxin are provided. Specific neurotoxin uptake or proteolytic activity directed to reporting constructs sensitive to botulinum neurotoxin in cells capable of being intoxicated by botulinum neurotoxin is enhanced by increasing expression of SV2 or heat shock proteins in such cells, respectively.
G01N 33/569 - Tests immunologiquesTests faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiquesMatériaux à cet effet pour micro-organismes, p. ex. protozoaires, bactéries, virus
C12Q 1/37 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir une hydrolase faisant intervenir une peptidase ou une protéinase
C12Q 1/6897 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques faisant intervenir des gènes rapporteurs liés de façon fonctionnelle à des promoteurs
Compositions and methods for improved cell-based methods of characterizing botulinum neurotoxins are provided. Cells utilized in these methods include a reporting construct that is cleaved following uptake and processing of botulinum neurotoxin by the cell, resulting in proteolysis of the portion of the reporting construct that is released following cleavage. The released portion includes a fluorophore and amino acid substitutions or sequences that enhance the rate of proteolysis. A pair of reporting constructs can be utilized in which one member of the pair is modified to resist cleavage by the botulinum neurotoxin while co-localizing with the remaining member of the pair.
G01N 33/50 - Analyse chimique de matériau biologique, p. ex. de sang ou d'urineTest par des méthodes faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiques par ligandsTest immunologique
C07K 14/435 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant d'animauxPeptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant d'humains
C07K 14/705 - RécepteursAntigènes de surface cellulaireDéterminants de surface cellulaire
C12Q 1/37 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir une hydrolase faisant intervenir une peptidase ou une protéinase
Vesicles that incorporate reporting constructs for characterizing Botulinum neurotoxin protease activity and suitable for use in an assay are provided. The reporting constructs are a pair of recombinant hybrid proteins that act in concert. The reporting constructs are a pair of recombinant hybrid proteins that act in concert, and that include a Botulinum neurotoxin protease recognition and cleavage sequence positioned to release a fluorophore upon cleavage.
C07K 14/00 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés
C12Q 1/37 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir une hydrolase faisant intervenir une peptidase ou une protéinase
G01N 33/542 - Tests immunologiquesTests faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiquesMatériaux à cet effet avec formation d'un complexe immunologique en phase liquide avec inhibition stérique ou modification du signal, p. ex. extinction de fluorescence
botulinum toxins. A cell is provided that expresses a construct that includes an anchor region, a cleavage site, and a reporting region having two or more identical reporter peptides. Enzymatic activity at the cleavage site releases the reporter region into the cytosol, where multiple degradation events occur. The observed change in the signal is proportional to the enzymatic activity.
C12N 15/85 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes eucaryotes pour cellules animales
C12Q 1/37 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir une hydrolase faisant intervenir une peptidase ou une protéinase
C07K 14/435 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant d'animauxPeptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant d'humains
16.
Compositions and methods for improving sensitivity in cell based assays
Compositions and methods are provided that reduce the time required for detection of botulinum neurotoxins in cell-based assays. In one aspect an isoquinolynyl compound can be used for this purpose. In such cell-based assays the cell can include an enzyme that facilitates degradation of the reporter significantly faster after the cleavage than before the cleavage, and presence of the Botulinum toxin correlates with reduction of the signal from a baseline signal. The cell can advantageously express both the construct that includes the reporter, and an enzyme that facilitates the degradation.
G01N 33/50 - Analyse chimique de matériau biologique, p. ex. de sang ou d'urineTest par des méthodes faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiques par ligandsTest immunologique
G01N 33/58 - Analyse chimique de matériau biologique, p. ex. de sang ou d'urineTest par des méthodes faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiques par ligandsTest immunologique faisant intervenir des substances marquées
C12Q 1/37 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir une hydrolase faisant intervenir une peptidase ou une protéinase
G01N 33/569 - Tests immunologiquesTests faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiquesMatériaux à cet effet pour micro-organismes, p. ex. protozoaires, bactéries, virus
G01N 33/569 - Tests immunologiquesTests faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiquesMatériaux à cet effet pour micro-organismes, p. ex. protozoaires, bactéries, virus
C12Q 1/37 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir une hydrolase faisant intervenir une peptidase ou une protéinase
C12Q 1/6897 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques faisant intervenir des gènes rapporteurs liés de façon fonctionnelle à des promoteurs
Compositions and methods are described in which a primary detergent or surfactant in an aqueous solution is removed by the addition of a secondary detergent or surfactant in concentrations that exceed the critical micellar concentration (CMC) of the secondary detergent or surfactant. These compositions and methods are particularly applicable to protein-containing solutions. Typical primary detergents/surfactants include polysorbate 20, polysorbate 80, and Triton X-100. Suitable secondary detergents or surfactants can be ionic, nonionic, or zwitterionic. Typical secondary detergents/surfactants include, but are not limited to, galactoside detergents (e.g. octyl-β-galactoside), glucamide detergents (e.g. MEGA 8, MEGA 9, MEGA 10), cholamide detergents (e.g. CHAPS, CHAPSO, BIGCHAPS), and sulfobetaine detergents (such as sulfobetaine 3-10).
C07K 1/34 - ExtractionSéparationPurification par filtration, ultrafiltration ou osmose inverse
B01D 15/00 - Procédés de séparation comportant le traitement de liquides par des adsorbants ou des absorbants solidesAppareillages pour ces procédés
B01D 61/00 - Procédés de séparation utilisant des membranes semi-perméables, p. ex. dialyse, osmose ou ultrafiltrationAppareils, accessoires ou opérations auxiliaires, spécialement adaptés à cet effet
G01N 33/68 - Analyse chimique de matériau biologique, p. ex. de sang ou d'urineTest par des méthodes faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiques par ligandsTest immunologique faisant intervenir des protéines, peptides ou amino-acides
B01D 61/16 - Prétraitement du courant d'alimentation
B01D 15/34 - Séparation par sélection en fonction de la taille, p. ex. chromatographie d'exclusion de tailleFiltration sur gelPerméation
Compositions and methods are described in which a primary detergent or surfactant in an aqueous solution is removed by the addition of a secondary detergent or surfactant in concentrations that exceed the critical micellar concentration (CMC) of the secondary detergent or surfactant. These compositions and methods are particularly applicable to protein-containing solutions. Typical primary detergents/surfactants include polysorbate 20, polysorbate 80, and Triton X-100. Suitable secondary detergents or surfactants can be ionic, nonionic, or zwitterionic. Typical secondary detergents/surfactants include, but are not limited to, galactoside detergents (e.g. octyl-b-galactoside), glucamide detergents (e.g. MEGA 8, MEGA 9, MEGA 10), cholamide detergents (e.g. CHAPS, CHAPSO, BIGCHAPS), and sulfobetaine detergents (such as sulfobetaine 3-10).
C07K 14/33 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant de bactéries provenant de Clostridium (G)
B01D 15/34 - Séparation par sélection en fonction de la taille, p. ex. chromatographie d'exclusion de tailleFiltration sur gelPerméation
Compositions and methods are described that provide for screening the activity of genetically modified proteases to identify modified substrate specificity. A series of recombinant peptide substrates are generated that incorporate both portions of a parent substrate peptide (i.e. a peptide substrate of the native or wild-type protease) and portions of a target substrate peptide (i.e. a desired peptide substrate of the recombinant protease). Recombinant proteases are initially screened against a recombinant peptide substrate with a relatively high ratio of parent substrate content to target substrate content. Recombinant proteases identified in the initial screening can be further screened using a different recombinant peptide substrates with a lower ratio of parent substrate content to target substrate content. The screening process can be repeated using recombinant peptide substrates with progressively lower parent substrate content until a recombinant protease is identified with the desired activity and/or specificity towards the target substrate. Recombinant peptide substrates can include identifiable tags, immobilizing/affinity tags, and other features that facilitate detection of protease activity.
C12Q 1/37 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir une hydrolase faisant intervenir une peptidase ou une protéinase
C40B 30/06 - Procédés de criblage des bibliothèques en mesurant les effets sur des cellules, des tissus ou des organismes vivants
C07K 14/00 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés
C12Q 1/37 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir une hydrolase faisant intervenir une peptidase ou une protéinase
G01N 33/542 - Tests immunologiquesTests faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiquesMatériaux à cet effet avec formation d'un complexe immunologique en phase liquide avec inhibition stérique ou modification du signal, p. ex. extinction de fluorescence
botulinum neurotoxin light chain, and is characterized utilizing a reporting construct that includes all or part of the non-neuronal SNARE protein. Such a protease has utility in the treatment of diseases associated with hypersecretion, where the hypersecretion is mediated by a non-neuronal SNARE protein.
A61K 38/48 - Hydrolases (3) agissant sur des liaisons peptidiques (3.4)
C07K 14/47 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant d'animauxPeptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant d'humains provenant de vertébrés provenant de mammifères
C07K 14/705 - RécepteursAntigènes de surface cellulaireDéterminants de surface cellulaire
C07K 14/435 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant d'animauxPeptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant d'humains
C12Q 1/37 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir une hydrolase faisant intervenir une peptidase ou une protéinase
Compositions and methods for determining the efficacy and/or potency of a vaccine preparation are described herein. Splenocytes from immunized animals are isolated and frozen. Upon thawing aliquots these cells are activated by exposure to a series of dilutions of q vaccine preparation being tested and a series of dilutions of a reference vaccine with known characteristics. Cells secreting immunogen-specific antibody and cells secreting nonspecific antibody are enumerated, as is the amount of immunogen-specific and nonspecific antibody produced. Comparison between the results from the vaccine preparations provides a measure of relative vaccine efficacy and/or potency.
G01N 33/53 - Tests immunologiquesTests faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiquesMatériaux à cet effet
G01N 33/50 - Analyse chimique de matériau biologique, p. ex. de sang ou d'urineTest par des méthodes faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiques par ligandsTest immunologique
G01N 33/569 - Tests immunologiquesTests faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiquesMatériaux à cet effet pour micro-organismes, p. ex. protozoaires, bactéries, virus
G01N 33/94 - Analyse chimique de matériau biologique, p. ex. de sang ou d'urineTest par des méthodes faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiques par ligandsTest immunologique faisant intervenir des narcotiques
24.
Compositions and methods for improving sensitivity in cell based assays
Compositions and methods are provided that improve detection of botulinum neurotoxins in cell-based assays. In one aspect an isoquinolynyl compound can be used to enhance the sensitivity of both Förster resonance energy transfer (FRET) and non-FRET cell-based assays. Osmolarity of the cell culture media can be adjusted to optimize the effect of the compound. In that subject matter an environment cell can include an enzyme that facilitates degradation of the reporter significantly faster after the cleavage than before the cleavage, and presence of the Botulinum toxin correlates with reduction of the signal from a baseline signal. Where the environment is a cell, the cell can advantageously express both the construct that includes the reporter, and an enzyme that facilitates the degradation.
G01N 33/50 - Analyse chimique de matériau biologique, p. ex. de sang ou d'urineTest par des méthodes faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiques par ligandsTest immunologique
G01N 33/58 - Analyse chimique de matériau biologique, p. ex. de sang ou d'urineTest par des méthodes faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiques par ligandsTest immunologique faisant intervenir des substances marquées
C12Q 1/37 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir une hydrolase faisant intervenir une peptidase ou une protéinase
G01N 33/569 - Tests immunologiquesTests faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiquesMatériaux à cet effet pour micro-organismes, p. ex. protozoaires, bactéries, virus
Compositions and methods for determining the efficacy and/or potency of a vaccine preparation are described herein. Splenocytes from immunized animals are isolated and frozen. Upon thawing aliquots these cells are activated by exposure to a series of dilutions of q vaccine preparation being tested and a series of dilutions of a reference vaccine with known characteristics. Cells secreting immunogen-specific antibody and cells secreting nonspecific antibody are enumerated, as is the amount of immunogen-specific and nonspecific antibody produced. Comparison between the results from the vaccine preparations provides a measure of relative vaccine efficacy and/or potency.
G01N 33/50 - Analyse chimique de matériau biologique, p. ex. de sang ou d'urineTest par des méthodes faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiques par ligandsTest immunologique
G01N 33/53 - Tests immunologiquesTests faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiquesMatériaux à cet effet
Compositions and methods for analyzing protease activity, and especially BoNT/B, BoNT/G, BoNT/D, and/or BoNT/F protease activity, using a cell based assay are provided. Cells express at least two recombinant hybrid proteins each of which includes a fluorophore and a membrane anchoring peptide, and at least one of which includes a BoNT protease recognition and cleavage sequence positioned to release a fluorophore upon cleavage. Analysis is performed by monitoring fluorescence following exposure to a BoNT. The fluorophores are positioned so that no useful FRET occurs between them, permitting fluorescence produced by the non-released fluorophore to be used in data normalization.
C07K 14/00 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés
C12Q 1/37 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir une hydrolase faisant intervenir une peptidase ou une protéinase
G01N 33/542 - Tests immunologiquesTests faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiquesMatériaux à cet effet avec formation d'un complexe immunologique en phase liquide avec inhibition stérique ou modification du signal, p. ex. extinction de fluorescence
G01N 33/569 - Tests immunologiquesTests faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiquesMatériaux à cet effet pour micro-organismes, p. ex. protozoaires, bactéries, virus
C12Q 1/37 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir une hydrolase faisant intervenir une peptidase ou une protéinase
C12Q 1/6897 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques faisant intervenir des gènes rapporteurs liés de façon fonctionnelle à des promoteurs
botulinum toxin (BoNT) are described that include a genetically modified cell that is transfected with an artificial construct comprising a nucleic acid sequence that encodes for a hybrid protein having (a) a reporter-containing portion chemically coupled to (b) a cleavage site and (c) a control fluorophore. The cleavage site interacts with a BoNT in a manner that cleaves the reporter-containing portion from remainder of the construct. The cleaved portion is destroyed or otherwise degraded by the local environment, and presence of BoNT is evidenced by reduction in signal from the reporter. The cleavage sequence is all or part of a SNARE protein, the cleavable reporter-containing portion is preferably Yellow Fluorescent Protein (YFP), Citrine, Venus, or a YPet protein and the control fluorophore is preferably CFP, mStrawberry, or a mCherry protein.
C07K 14/435 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant d'animauxPeptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant d'humains
C12N 15/85 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes eucaryotes pour cellules animales
G01N 33/58 - Analyse chimique de matériau biologique, p. ex. de sang ou d'urineTest par des méthodes faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiques par ligandsTest immunologique faisant intervenir des substances marquées
Compositions and methods for improved cell-based methods of characterizing botulinum neurotoxins are provided. Cells utilized in these methods include a reporting construct that is cleaved following uptake and processing of botulinum neurotoxin by the cell, resulting in proteolysis of the portion of the reporting construct that is released following cleavage. The released portion includes a fluorophore and amino acid substitutions or sequences that enhance the rate of proteolysis. A pair of reporting constructs can be utilized in which one member of the pair is modified to resist cleavage by the botulinum neurotoxin while co-localizing with the remaining member of the pair.
C12Q 1/37 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir une hydrolase faisant intervenir une peptidase ou une protéinase
G01N 33/50 - Analyse chimique de matériau biologique, p. ex. de sang ou d'urineTest par des méthodes faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiques par ligandsTest immunologique
G01N 33/542 - Tests immunologiquesTests faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiquesMatériaux à cet effet avec formation d'un complexe immunologique en phase liquide avec inhibition stérique ou modification du signal, p. ex. extinction de fluorescence
G01N 33/58 - Analyse chimique de matériau biologique, p. ex. de sang ou d'urineTest par des méthodes faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiques par ligandsTest immunologique faisant intervenir des substances marquées
Compositions and methods for improved cell-based methods of characterizing botulinum neurotoxins are provided. Cells utilized in these methods include a reporting construct that is cleaved following uptake and processing of botulinum neurotoxin by the cell, resulting in proteolysis of the portion of the reporting construct that is released following cleavage. The released portion includes a fluorophore and amino acid substitutions or sequences that enhance the rate of proteolysis. A pair of reporting constructs can be utilized in which one member of the pair is modified to resist cleavage by the botulinum neurotoxin while co-localizing with the remaining member of the pair.
C12Q 1/37 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir une hydrolase faisant intervenir une peptidase ou une protéinase
G01N 33/50 - Analyse chimique de matériau biologique, p. ex. de sang ou d'urineTest par des méthodes faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiques par ligandsTest immunologique
G01N 33/542 - Tests immunologiquesTests faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiquesMatériaux à cet effet avec formation d'un complexe immunologique en phase liquide avec inhibition stérique ou modification du signal, p. ex. extinction de fluorescence
G01N 33/58 - Analyse chimique de matériau biologique, p. ex. de sang ou d'urineTest par des méthodes faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiques par ligandsTest immunologique faisant intervenir des substances marquées
31.
Resonance energy transfer assay with cleavage sequence and spacer
Methods for the identification of inhibitors of botulinum neurotoxins are described. Cells are provided that are genetically engineered to express peptides that act as a substrate for a botulinum neurotoxin and the provide reporting groups. Spacer sequences between the reporting groups serve to optimize energy transfer between the reporting groups. Characterization of the energy transfer-dependent signal prior to and following exposure to a botulinum neurotoxin in the presence of a candidate inhibitor provides a measure of the effectiveness of the candidate inhibitor.
C12Q 1/37 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir une hydrolase faisant intervenir une peptidase ou une protéinase
G01N 33/542 - Tests immunologiquesTests faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiquesMatériaux à cet effet avec formation d'un complexe immunologique en phase liquide avec inhibition stérique ou modification du signal, p. ex. extinction de fluorescence
G01N 33/94 - Analyse chimique de matériau biologique, p. ex. de sang ou d'urineTest par des méthodes faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiques par ligandsTest immunologique faisant intervenir des narcotiques
C07K 14/47 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant d'animauxPeptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant d'humains provenant de vertébrés provenant de mammifères
C07K 14/00 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés
Methods and compositions are provided for rapid and efficient removal of interferents from analyte containing solutions, where such methods and compositions are effective in removing such interferents to concentrations that do not interfere with cell-based assays. Affinity-based phase separation is employed to quantitatively harvest analyte from an interferent-containing solution, followed by quantitative recovery of the analyte from the affinity-based phase in active form. Recovery can be performed at reduced volumes relative to harvesting to provide for concentration of the analyte and extension of the dynamic range of a cell-based assay.
B01D 15/38 - Adsorption sélective, p. ex. chromatographie caractérisée par le mécanisme de séparation impliquant une interaction spécifique non couverte par un ou plusieurs des groupes , p. ex. chromatographie d'affinité, chromatographie d'échange par ligand ou chromatographie chirale
C12Q 1/37 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir une hydrolase faisant intervenir une peptidase ou une protéinase
G01N 33/569 - Tests immunologiquesTests faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiquesMatériaux à cet effet pour micro-organismes, p. ex. protozoaires, bactéries, virus
33.
Compositions and methods for improved cell-based botulinum neurotoxin assays
C12Q 1/37 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir une hydrolase faisant intervenir une peptidase ou une protéinase
C12Q 1/6897 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques faisant intervenir des gènes rapporteurs liés de façon fonctionnelle à des promoteurs
G01N 33/569 - Tests immunologiquesTests faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiquesMatériaux à cet effet pour micro-organismes, p. ex. protozoaires, bactéries, virus
34.
Fusion proteins, cells, and kits for characterizing Botulinum toxin
Compositions for characterization of Botulinum toxin (BoNT) are described that include a genetically modified cell that is transfected with an artificial construct comprising a nucleic acid sequence that encodes for a hybrid protein having (a) a reporter-containing portion chemically coupled to (b) a cleavage site and (c) a control fluorophore. The cleavage site interacts with a BoNT in a manner that cleaves the reporter-containing portion from remainder of the construct. The cleaved portion is destroyed or otherwise degraded by the local environment, and presence of BoNT is evidenced by reduction in signal from the reporter. The cleavage sequence is all or part of a SNARE protein, the cleavable reporter-containing portion is preferably Yellow Fluorescent Protein (YFP), Citrine, Venus, or a YPet protein and the control fluorophore is preferably CFP, mStrawberry, or a mCherry protein.
C07K 14/435 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant d'animauxPeptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant d'humains
G01N 33/58 - Analyse chimique de matériau biologique, p. ex. de sang ou d'urineTest par des méthodes faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiques par ligandsTest immunologique faisant intervenir des substances marquées
C12N 15/85 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes eucaryotes pour cellules animales
35.
Sensitized cultured cells for botulinum toxin characterization
Apparatus, systems and methods can provide improved detection of botulinum neurotoxins. In one aspect an isoquinolynyl compound can be used to enhance the sensitivity of both Förster resonance energy transfer (FRET) and non-FRET cell-based assays. In another aspect, non-FRET assays and constructs utilize a reporter that is not coupled with the second fluorophore in a manner that produces significant FRET. In that subject matter an environment cell can include an enzyme that facilitates degradation of the reporter significantly faster after the cleavage than before the cleavage, and presence of the Botulinum toxin correlates with reduction of the signal from a baseline signal. Where the environment is a cell, the cell can advantageously express both the construct that includes the reporter, and an enzyme that facilitates the degradation.
C12Q 1/37 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir une hydrolase faisant intervenir une peptidase ou une protéinase
G01N 33/50 - Analyse chimique de matériau biologique, p. ex. de sang ou d'urineTest par des méthodes faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiques par ligandsTest immunologique
G01N 33/58 - Analyse chimique de matériau biologique, p. ex. de sang ou d'urineTest par des méthodes faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiques par ligandsTest immunologique faisant intervenir des substances marquées
G01N 33/569 - Tests immunologiquesTests faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiquesMatériaux à cet effet pour micro-organismes, p. ex. protozoaires, bactéries, virus
36.
Resonance energy transfer assay with cleavage sequence and spacer
A molecular construct comprises a donor label, an acceptor label, a linker peptide disposed between the donor and the acceptor, the linker having a cleavage site sequence, and a spacer between at least one of (a) the donor and the cleavage site sequence and (b) the acceptor and the cleavage site sequence. Preferably, the construct is selected from the group consisting of CFP-(SGLRSRA)(SEQ ID NO. 9)-SNAP-25-(SNS)-YFP, and CFP-(SGLRSRA)(SEQ ID NO. 9)-synaptobrevin-(SNS)-YFP. In preferred embodiments, the linker peptide is a substrate of a botulinum neurotoxin selected from the group consisting of synaptobrevin (VAMP), syntaxin and SNAP-25, or a fragment thereof that can be recognized and cleaved by the botulinum neurotoxin. Advantageously, the spacer increases the electronic coupling between the donor label and the acceptor label relative to a corresponding construct without the spacer.
G01N 31/00 - Recherche ou analyse des matériaux non biologiques par l'emploi des procédés chimiques spécifiés dans les sous-groupesAppareils spécialement adaptés à de tels procédés
G01N 33/53 - Tests immunologiquesTests faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiquesMatériaux à cet effet
C12Q 1/37 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir une hydrolase faisant intervenir une peptidase ou une protéinase
G01N 33/542 - Tests immunologiquesTests faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiquesMatériaux à cet effet avec formation d'un complexe immunologique en phase liquide avec inhibition stérique ou modification du signal, p. ex. extinction de fluorescence
G01N 33/94 - Analyse chimique de matériau biologique, p. ex. de sang ou d'urineTest par des méthodes faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiques par ligandsTest immunologique faisant intervenir des narcotiques
C07K 14/47 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant d'animauxPeptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant d'humains provenant de vertébrés provenant de mammifères
C07K 14/00 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés
botulinum neurotoxin light chain, and is characterized utilizing a reporting construct that includes all or part of the non-neuronal SNARE protein. Such a protease has utility in the treatment of diseases associated with hypersecretion, where the hypersecretion is mediated by a non-neuronal SNARE protein.
C07K 14/705 - RécepteursAntigènes de surface cellulaireDéterminants de surface cellulaire
C07K 14/47 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant d'animauxPeptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant d'humains provenant de vertébrés provenant de mammifères
C07K 14/435 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant d'animauxPeptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant d'humains
A61K 38/48 - Hydrolases (3) agissant sur des liaisons peptidiques (3.4)
C12Q 1/37 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir une hydrolase faisant intervenir une peptidase ou une protéinase
38.
Botulinum assay with synaptobrevin substrate moiety
Compositions and methods for analyzing intracellular BoNT protease activity, and especially BoNT/B, BoNT/G, BoNT/D, and/or BoNT/F protease activity are provided. Cells express at least two recombinant hybrid proteins each of which includes a fluorophore and a membrane anchoring peptide, and at least one of which includes a BoNT protease recognition and cleavage sequence positioned to release a fluorophore upon cleavage. Analysis is performed by monitoring fluorescence following exposure to a BoNT.
C12Q 1/37 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir une hydrolase faisant intervenir une peptidase ou une protéinase
C07K 14/00 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés
G01N 33/542 - Tests immunologiquesTests faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiquesMatériaux à cet effet avec formation d'un complexe immunologique en phase liquide avec inhibition stérique ou modification du signal, p. ex. extinction de fluorescence
39.
BOTULINUM NEUROTOXINS WITH MODIFIED LIGHT CHAIN SPECIFITY AND METHODS FOR PRODUCING SAME
A protease directed to a non-neuronal SNARE protein is described. The protease is produced by selective mutation of a botulinum neurotoxin light chain, and is characterized utilizing a reporting construct that includes all or part of the non-neuronal SNARE protein. Such a protease has utility in the treatment of diseases associated with hypersecretion, where the hypersecretion is mediated by a non-neuronal SNARE protein.
C07K 14/33 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant de bactéries provenant de Clostridium (G)
C07K 14/705 - RécepteursAntigènes de surface cellulaireDéterminants de surface cellulaire
C07K 14/47 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant d'animauxPeptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant d'humains provenant de vertébrés provenant de mammifères
C12Q 1/37 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir une hydrolase faisant intervenir une peptidase ou une protéinase
40.
Resonance energy transfer assay with cleavage sequence and spacer
A molecular construct comprises a donor label, an acceptor label, a linker peptide disposed between the donor and the acceptor, the linker having a cleavage site sequence, and a flexible peptide spacer between at least one of (a) the donor and the cleavage site sequence and (b) the acceptor and the cleavage site sequence. The cleavage site sequence is a protease cleavage site, and the flexible spacer peptide is positioned and dimensioned to facilitate an electronic hop between the donor and acceptor label.
G01N 31/00 - Recherche ou analyse des matériaux non biologiques par l'emploi des procédés chimiques spécifiés dans les sous-groupesAppareils spécialement adaptés à de tels procédés
G01N 33/53 - Tests immunologiquesTests faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiquesMatériaux à cet effet
C12Q 1/37 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir une hydrolase faisant intervenir une peptidase ou une protéinase
G01N 33/542 - Tests immunologiquesTests faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiquesMatériaux à cet effet avec formation d'un complexe immunologique en phase liquide avec inhibition stérique ou modification du signal, p. ex. extinction de fluorescence
G01N 33/94 - Analyse chimique de matériau biologique, p. ex. de sang ou d'urineTest par des méthodes faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiques par ligandsTest immunologique faisant intervenir des narcotiques
C07K 14/47 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant d'animauxPeptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant d'humains provenant de vertébrés provenant de mammifères
C12Q 1/37 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir une hydrolase faisant intervenir une peptidase ou une protéinase
G01N 33/569 - Tests immunologiquesTests faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiquesMatériaux à cet effet pour micro-organismes, p. ex. protozoaires, bactéries, virus
C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques
Compositions and methods are disclosed that provide a rapid, sensitive, and accurate cell-based assay for enzyme activity, particularly for enzyme activities associated with botulinum toxins. A cell is provided that expresses a construct that includes an anchor region, a cleavage site, and a reporting region having two or more identical reporter peptides. Enzymatic activity at the cleavage site releases the reporter region into the cytosol, where multiple degradation events occur. The observed change in the signal is proportional to the enzymatic activity.
C12Q 1/37 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir une hydrolase faisant intervenir une peptidase ou une protéinase
Compositions and methods are disclosed that provide a rapid, sensitive, and accurate cell-based assay for enzyme activity, particularly for enzyme activities associated with botulinum toxins. A cell is provided that expresses a construct that includes an anchor region, a cleavage site, and a reporting region having two or more identical reporter peptides. Enzymatic activity at the cleavage site releases the reporter region into the cytosol, where multiple degradation events occur. The observed change in the signal is proportional to the enzymatic activity.
C12Q 1/37 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir une hydrolase faisant intervenir une peptidase ou une protéinase
Methods and compositions are provided where a transfected cell that produces a hybrid protein with a reporter-containing portion and a botulinum toxin cleavage site is contacted with a botulinum toxin at elevated temperatures and/or in media having a reduced sodium concentration. Kits that include such media and a botulinum toxin are also described.
G01N 33/569 - Tests immunologiquesTests faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiquesMatériaux à cet effet pour micro-organismes, p. ex. protozoaires, bactéries, virus
45.
Methods and compounds for increasing sensitivity of botulinum assays
Apparatus, systems and methods can provide improved detection of botulinum neurotoxins. In one aspect an isoquinolynyl compound can be used to enhance the sensitivity of both Förster resonance energy transfer (FRET) and non-FRET cell-based assays. In another aspect, non-FRET assays and constructs utilize a reporter that is not coupled with the second fluorophore in a manner that produces significant FRET. In that subject matter an environment cell can include an enzyme that facilitates degradation of the reporter significantly faster after the cleavage than before the cleavage, and presence of the Botulinum toxin correlates with reduction of the signal from a baseline signal. Where the environment is a cell, the cell can advantageously express both the construct that includes the reporter, and an enzyme that facilitates the degradation.
C12Q 1/37 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir une hydrolase faisant intervenir une peptidase ou une protéinase
G01N 33/58 - Analyse chimique de matériau biologique, p. ex. de sang ou d'urineTest par des méthodes faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiques par ligandsTest immunologique faisant intervenir des substances marquées
G01N 33/569 - Tests immunologiquesTests faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiquesMatériaux à cet effet pour micro-organismes, p. ex. protozoaires, bactéries, virus
46.
Thiazoline ring compounds as botulinum antagonists
Compositions and methods for inhibiting BoNT protease activity are presented. In most preferred aspects, inhibitors comprise a thiol reactive group, a zinc binding group, a redox active group, an alkylating group, and/or an electrophilic Michael addition acceptor group. Particularly preferred inhibitors include an isothiazolone ring, a thiadiazolidine dione ring, a (hydro)quinone ring, an iminophenol group, and/or a hydrazonophenol group, and inhibit BoNT/A at μM and sub-μM concentrations.
A61K 31/41 - Composés hétérocycliques ayant l'azote comme hétéro-atome d'un cycle, p. ex. guanéthidine ou rifamycines ayant des cycles à cinq chaînons avec plusieurs hétéro-atomes cycliques, l'un au moins étant l'azote, p. ex. tétrazole
Apparatus, systems and methods can provide improved detection of botulinum neurotoxins. In one aspect an isoquinolynyl compound can be used to enhance the sensitivity of both Frster resonance energy transfer (FRET) and non-FRET cell-based assays. In another aspect, non-FRET assays and constructs utilize a reporter that is not coupled with the second fluorophore in a manner that produces significant FRET. In that subject matter an environment cell can include an enzyme that facilitates degradation of the reporter significantly faster after the cleavage than before the cleavage, and presence of the Botulinum toxin correlates with reduction of the signal from a baseline signal. Where the environment is a cell, the cell can advantageously express both the construct that includes the reporter, and an enzyme that facilitates the degradation.
G01N 33/554 - Tests immunologiquesTests faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiquesMatériaux à cet effet avec un support insoluble pour l'immobilisation de composés immunochimiques le support étant une cellule ou un fragment de cellule biologique, p. ex. cellules de bactéries, de levure
48.
Resonance energy transfer assay with cleavage sequence and spacer
botulinum neurotoxin. Advantageously, the spacer increases the electronic coupling between the donor label and the acceptor label relative to a corresponding construct without the spacer.
G01N 33/53 - Tests immunologiquesTests faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiquesMatériaux à cet effet
G01N 31/00 - Recherche ou analyse des matériaux non biologiques par l'emploi des procédés chimiques spécifiés dans les sous-groupesAppareils spécialement adaptés à de tels procédés
C12Q 1/37 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir une hydrolase faisant intervenir une peptidase ou une protéinase
G01N 33/542 - Tests immunologiquesTests faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiquesMatériaux à cet effet avec formation d'un complexe immunologique en phase liquide avec inhibition stérique ou modification du signal, p. ex. extinction de fluorescence
G01N 33/94 - Analyse chimique de matériau biologique, p. ex. de sang ou d'urineTest par des méthodes faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiques par ligandsTest immunologique faisant intervenir des narcotiques
49.
Resonance energy transfer assay with synaptobrevin substrate moiety
Compositions and methods for analyzing intracellular BoNT protease activity, and especially BoNT/B, BoNT/G, BoNT/D, and/or BoNT/F protease activity are provided. Most preferably, cells express one or more recombinant hybrid proteins that include one or more fluorescent proteins and at least one BoNT protease recognition and cleavage sequence, and analysis is performed using FRET analysis.
C12Q 1/37 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir une hydrolase faisant intervenir une peptidase ou une protéinase
A composition includes an artificial construct having (a) a reporter-containing portion chemically coupled to (b) a cleavage site. The cleavage site interacts with an investigational substance in a manner that cleaves the reporter-containing portion from a remainder of the construct. The cleaved portion is destroyed or otherwise degraded by the local environment, and presence of an investigational substance is evidenced by reduction in signal from the reporter. The investigational substance is preferably a Botulinum toxin (BoTN), and the cleavage sequence is all or part of a SNARE protein. The cleavable reporter-containing portion is preferably Yellow Fluorescent Protein (YFP), Citrine, Venus, or a YPet protein.
G01N 33/542 - Tests immunologiquesTests faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiquesMatériaux à cet effet avec formation d'un complexe immunologique en phase liquide avec inhibition stérique ou modification du signal, p. ex. extinction de fluorescence
G01N 33/569 - Tests immunologiquesTests faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiquesMatériaux à cet effet pour micro-organismes, p. ex. protozoaires, bactéries, virus
A composition includes an artificial construct having (a) a reporter-containing portion chemically coupled to (b) a cleavage site. The cleavage site interacts with an investigational substance in a manner that cleaves the reporter-containing portion from a remainder of the construct. The cleaved portion is destroyed or otherwise degraded by the local environment, and presence of an investigational substance is evidenced by reduction in signal from the reporter. The investigational substance is preferably a Botulinum toxin (BoTN), and the cleavage sequence is all or part of a SNARE protein. The cleavable reporter-containing portion is preferably Yellow Fluorescent Protein (YFP), Citrine, Venus, or a YPet protein.
C12Q 1/37 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir une hydrolase faisant intervenir une peptidase ou une protéinase
A61K 38/00 - Préparations médicinales contenant des peptides
G01N 33/58 - Analyse chimique de matériau biologique, p. ex. de sang ou d'urineTest par des méthodes faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiques par ligandsTest immunologique faisant intervenir des substances marquées
52.
Resonance energy transfer assay with cleavage sequence and spacer
A molecular construct comprises a donor label, an acceptor label, a linker peptide disposed between the donor and the acceptor, the linker having a cleavage site sequence, and a spacer between at least one of (a) the donor and the cleavage site sequence and (b) the acceptor and the cleavage site sequence. Preferably, the construct is selected from the group consisting of CFP-(SGLRSRA)-SNAP-25-(SNS)-YFP (SEQ ID NO: 9), and CFP-(SGLRSRA)-synaptobrevin-(SNS)-YFP (SEQ ID NO: 10). In preferred embodiments, the linker peptide is a substrate of a botulinum neurotoxin selected from the group consisting of synaptobrevin (VAMP), syntaxin and SNAP-25, or a fragment thereof that can be recognized and cleaved by the botulinum neurotoxin. Advantageously, the spacer increases the electronic coupling between the donor label and the acceptor label relative to a corresponding construct without the spacer.
G01N 31/00 - Recherche ou analyse des matériaux non biologiques par l'emploi des procédés chimiques spécifiés dans les sous-groupesAppareils spécialement adaptés à de tels procédés
G01N 33/53 - Tests immunologiquesTests faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiquesMatériaux à cet effet
C12Q 1/37 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir une hydrolase faisant intervenir une peptidase ou une protéinase
G01N 33/542 - Tests immunologiquesTests faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiquesMatériaux à cet effet avec formation d'un complexe immunologique en phase liquide avec inhibition stérique ou modification du signal, p. ex. extinction de fluorescence
G01N 33/94 - Analyse chimique de matériau biologique, p. ex. de sang ou d'urineTest par des méthodes faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiques par ligandsTest immunologique faisant intervenir des narcotiques
C07K 14/47 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant d'animauxPeptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant d'humains provenant de vertébrés provenant de mammifères
brevets
