C12N 15/10 - Procédés pour l'isolement, la préparation ou la purification d'ADN ou d'ARN
C12P 19/34 - Polynucléotides, p. ex. acides nucléiques, oligoribonucléotides
C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques
C12Q 1/6806 - Préparation d’acides nucléiques pour analyse, p. ex. pour test de réaction en chaîne par polymérase [PCR]
2.
Methods and Systems of Multi-Assay Processing and Analysis
The instant disclosure provides methods of multi-assay processing and multi-assay analysis. Such multi-assay processing and analysis pertain to automated detection of target nucleic acids, e.g., as performed in the clinical setting for diagnostic purposes. Also provided are common assay timing protocols derived from a variety of individual nucleic acid amplification and analysis protocols and modified to prevent resource contention. The instant disclosure also provides systems and devices for practicing the methods as described herein.
C12Q 1/6888 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes pour la détection ou l’identification d’organismes
B01L 9/00 - Dispositifs de supportDispositifs de serrage
C12Q 1/6806 - Préparation d’acides nucléiques pour analyse, p. ex. pour test de réaction en chaîne par polymérase [PCR]
G01N 30/88 - Systèmes intégrés d'analyse, spécialement adaptés à cet effet, non couverts par un seul des groupes
G01N 33/48 - Matériau biologique, p. ex. sang, urineHémocytomètres
G01N 33/569 - Tests immunologiquesTests faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiquesMatériaux à cet effet pour micro-organismes, p. ex. protozoaires, bactéries, virus
G01N 35/00 - Analyse automatique non limitée à des procédés ou à des matériaux spécifiés dans un seul des groupes Manipulation de matériaux à cet effet
3.
PURIFICATION OF NUCLEIC ACIDS USING COPPER-TITANIUM OXIDES
The present disclosure relates to systems and methods for purifying nucleic acid. In particular, the present disclosure relates to systems and methods for purifying nucleic acids using metal or metal oxide compositions.
C12Q 1/6806 - Préparation d’acides nucléiques pour analyse, p. ex. pour test de réaction en chaîne par polymérase [PCR]
C12Q 1/70 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des virus ou des bactériophages
C12Q 1/6806 - Préparation d’acides nucléiques pour analyse, p. ex. pour test de réaction en chaîne par polymérase [PCR]
C12Q 1/70 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des virus ou des bactériophages
C12Q 1/6806 - Préparation d’acides nucléiques pour analyse, p. ex. pour test de réaction en chaîne par polymérase [PCR]
C12Q 1/70 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des virus ou des bactériophages
7.
ASSAYS FOR DETECTING CYTOMEGALOVIRUS (CMV) OR EPSTEIN-BAR VIRUS (EBV)
Provided herein are methods, compositions, kits and systems for detecting target nucleic acid sequences from cytomegalovirus (CMV) or Epstein-Bar virus (EBV).
C12Q 1/6806 - Préparation d’acides nucléiques pour analyse, p. ex. pour test de réaction en chaîne par polymérase [PCR]
C12Q 1/70 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des virus ou des bactériophages
Aspects of the present disclosure include sample analysis methods and systems. According to certain embodiments, provided are methods of analyzing samples in an automated sample analysis system. The methods include introducing samples and sample preparation cartridges into the system, isolating and purifying an analyte (e.g., nucleic acids and/or proteins) present in the samples at a sample preparation station, and performing analyte detection assays in assay mixtures that include the purified analyte. Also provided are automated sample analysis systems that find use, e.g., in performing the methods of the present disclosure. In certain aspects, the methods and systems provide for continuous operator access during replenishment or removal of one or any combination of samples, bulk fluids, reagents, commodities, waste, and/or the like.
G01N 35/10 - Dispositifs pour transférer les échantillons vers, dans ou à partir de l'appareil d'analyse, p. ex. dispositifs d'aspiration, dispositifs d'injection
G01N 35/00 - Analyse automatique non limitée à des procédés ou à des matériaux spécifiés dans un seul des groupes Manipulation de matériaux à cet effet
G01N 35/02 - Analyse automatique non limitée à des procédés ou à des matériaux spécifiés dans un seul des groupes Manipulation de matériaux à cet effet en utilisant une série de récipients à échantillons déplacés par un transporteur passant devant un ou plusieurs postes de traitement ou d'analyse
C12N 15/10 - Procédés pour l'isolement, la préparation ou la purification d'ADN ou d'ARN
10.
COMPOSITIONS AND METHODS FOR THE DETECTION AND ANALYSIS OF HERPES SIMPLEX VIRUS 1 (HSV-1), HERPES SIMPLEX VIRUS 2 (HSV-2) AND VARICELLA ZOSTER VIRUS (VZV)
Provided herein are compositions and methods useful for the detection of Herpes Simplex Virus 1 (HSV-1), Herpes Simplex Virus 2 (HSV-2) and Varicella Zoster Virus (VZV). In particular, provided herein are compositions, methods, systems, kits, reagents, and reaction mixtures involving such for nucleic acid amplification and detection procedures that detect HSV-1, HSV-2 and VZV in samples.
C12Q 1/686 - Réaction en chaine par polymérase [PCR]
C12Q 1/6876 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes
C12Q 1/70 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des virus ou des bactériophages
G01N 35/00 - Analyse automatique non limitée à des procédés ou à des matériaux spécifiés dans un seul des groupes Manipulation de matériaux à cet effet
11.
Purification of nucleic acids using titanium oxides
The present disclosure relates to systems and methods for purifying nucleic acid. In particular, the present disclosure relates to systems and methods for purifying nucleic acids using metal or metal oxide compositions.
C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques
C12Q 1/6806 - Préparation d’acides nucléiques pour analyse, p. ex. pour test de réaction en chaîne par polymérase [PCR]
B82Y 5/00 - Nanobiotechnologie ou nanomédecine, p. ex. génie protéique ou administration de médicaments
B82Y 15/00 - Nanotechnologie pour l’interaction, la détection ou l'actionnement, p. ex. points quantiques comme marqueurs en dosages protéiques ou moteurs moléculaires
The invention, in some aspects, pertains to compositions and methods for selective extraction and purification of RNA. The invention is based on the need for a method that maximizes target RNA recovery for sensitive assays while minimizing DNA recovery to reduce the possibility of assay interference from background DNA. The present disclosure provides novel two-step methods for preferentially extracting RNA molecules from a sample dried on a solid carrier. Aspects of the disclosure are based, in part, on compositions and methods comprising simple reagents that can be easily assembled but embody a sophisticated design to address the problem of selectively enriching for RNA recovery from a sample.
C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques
C12Q 1/6806 - Préparation d’acides nucléiques pour analyse, p. ex. pour test de réaction en chaîne par polymérase [PCR]
The invention, in some aspects, pertains to compositions and methods for selective extraction and purification of RNA. The invention is based on the need for a method that maximizes target RNA recovery for sensitive assays while minimizing DNA recovery to reduce the possibility of assay interference from background DNA. The present disclosure provides novel two-step methods for preferentially extracting RNA molecules from a sample dried on a solid carrier. Aspects of the disclosure are based, in part, on compositions and methods comprising simple reagents that can be easily assembled but embody a sophisticated design to address the problem of selectively enriching for RNA recovery from a sample.
C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques
C12Q 1/70 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des virus ou des bactériophages
G01N 35/00 - Analyse automatique non limitée à des procédés ou à des matériaux spécifiés dans un seul des groupes Manipulation de matériaux à cet effet
C12Q 1/6806 - Préparation d’acides nucléiques pour analyse, p. ex. pour test de réaction en chaîne par polymérase [PCR]
The disclosure is directed to kits and methods for amplifying and detecting human papilloma virus (HPV) of genotype 16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59, 66, and/or 68 in a sample, which comprises a variety of combinations of forward oligonucleotide primers, reverse oligonucleotide primers, and oligonucleotide probes.
C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques
C12Q 1/6853 - Réactions d’amplification d’acides nucléiques utilisant des amorces ou des matrices modifiées
C12Q 1/6883 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes pour les maladies provoquées par des altérations du matériel génétique
Provided herein is technology relating to amplification of nucleic acids and particularly, but not exclusively, to compositions and methods for doing improving the polymerase chain reaction and providing reagents for polymerase chain reaction with improved stability.
C07D 275/03 - Composés hétérocycliques contenant des cycles thiazole-1, 2 ou thiazole-1, 2 hydrogéné non condensés avec d'autres cycles avec des hétéro-atomes ou avec des atomes de carbone comportant trois liaisons à des hétéro-atomes, avec au plus une liaison à un halogène, p. ex. radicaux ester ou nitrile, liés directement aux atomes de carbone du cycle
C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
C12Q 1/6806 - Préparation d’acides nucléiques pour analyse, p. ex. pour test de réaction en chaîne par polymérase [PCR]
C12Q 1/6848 - Réactions d’amplification d’acides nucléiques caracterisées par les moyens d’empêcher la contamination ou d’augmenter la spécificité ou la sensibilité d’une réaction d’amplification
05 - Produits pharmaceutiques, vétérinaires et hygièniques
10 - Appareils et instruments médicaux
Produits et services
(1) A specimen collection kit consisting of medical diagnostic preparations, namely, medical diagnostic reagents and assays for testing of bodily fluids, swabs for medical purposes and diagnostic preparations for medical laboratory use
(2) A specimen collection kit for the analysis of blood, bodily fluid and tissue comprised of medical instruments for taking human blood, urine, tissue and bodily fluid sample specimens for medical purposes, medical specimen containers, specimen cup holders and plastic bags for transmitting medical specimens
05 - Produits pharmaceutiques, vétérinaires et hygièniques
10 - Appareils et instruments médicaux
Produits et services
Specimen collection kits comprised primarily of medical diagnostic preparations, namely, swabs and medical sample tubes for medical purposes, and also including plastic bags for transmitting medical specimens and printed mailing labels; all of the foregoing excluding veterinary products Blood, urine, tissue, and bodily fluid collection kits comprised of medical sample collection swab and tube, holder for medical sample tubes and vials, and medical sample tubes and vials for the analysis of blood, bodily fluid, and tissue; all of the foregoing excluding veterinary products
21.
Methods and systems of multi-assay processing and analysis
The instant disclosure provides methods of multi-assay processing and multi-assay analysis. Such multi-assay processing and analysis pertain to automated detection of target nucleic acids, e.g., as performed in the clinical setting for diagnostic purposes. Also provided are common assay timing protocols derived from a variety of individual nucleic acid amplification and analysis protocols and modified to prevent resource contention. The instant disclosure also provides systems and devices for practicing the methods as described herein.
C12Q 1/6888 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes pour la détection ou l’identification d’organismes
B01L 9/00 - Dispositifs de supportDispositifs de serrage
C12Q 1/6806 - Préparation d’acides nucléiques pour analyse, p. ex. pour test de réaction en chaîne par polymérase [PCR]
G01N 30/88 - Systèmes intégrés d'analyse, spécialement adaptés à cet effet, non couverts par un seul des groupes
G01N 33/48 - Matériau biologique, p. ex. sang, urineHémocytomètres
G01N 35/00 - Analyse automatique non limitée à des procédés ou à des matériaux spécifiés dans un seul des groupes Manipulation de matériaux à cet effet
G01N 33/569 - Tests immunologiquesTests faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiquesMatériaux à cet effet pour micro-organismes, p. ex. protozoaires, bactéries, virus
22.
Methods and probe combinations for detecting melanoma
The present invention is based on the discovery of methods and combinations of probes to chromosomal regions that are gained or lost or imbalanced in melanoma that provide highly specific and sensitive assays for the detection of melanoma cells.
C12Q 1/6886 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes pour les maladies provoquées par des altérations du matériel génétique pour le cancer
The present disclosure relates to systems and methods for purifying nucleic acid. In particular, the present disclosure relates to systems and methods for purifying nucleic acids using metal or metal oxide compositions.
Provided herein are compositions and methods useful for the detection of MTB. In particular, provided herein are kits, reagents, reaction mixtures, and methods involving such for nucleic acid amplification and detection procedures, which specifically and sensitively detect MTB in samples.
C12Q 1/689 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes pour la détection ou l’identification d’organismes pour les bactéries
This instant disclosure provides methods of processing a sample in an automated sample processing device including devices configured for the automated extraction or isolation of nucleic acids. Also provided are plungers for use in such devices and methods of sample processing. Systems for performing the described methods and employing the described plungers are also provided.
B01L 99/00 - Matière non prévue dans les autres groupes de la présente sous-classe
C12N 15/10 - Procédés pour l'isolement, la préparation ou la purification d'ADN ou d'ARN
G01N 33/543 - Tests immunologiquesTests faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiquesMatériaux à cet effet avec un support insoluble pour l'immobilisation de composés immunochimiques
G01N 35/00 - Analyse automatique non limitée à des procédés ou à des matériaux spécifiés dans un seul des groupes Manipulation de matériaux à cet effet
G01N 35/10 - Dispositifs pour transférer les échantillons vers, dans ou à partir de l'appareil d'analyse, p. ex. dispositifs d'aspiration, dispositifs d'injection
Aspects of the present disclosure include sample analysis methods and systems. According to certain embodiments, provided are methods of analyzing samples in an automated sample analysis system. The methods include introducing samples and sample preparation cartridges into the system, isolating and purifying an analyte (e.g., nucleic acids and/or proteins) present in the samples at a sample preparation station, and performing analyte detection assays in assay mixtures that include the purified analyte. Also provided are automated sample analysis systems that find use, e.g., in performing the methods of the present disclosure. In certain aspects, the methods and systems provide for continuous operator access during replenishment or removal of one or any combination of samples, bulk fluids, reagents, commodities, waste, and/or the like.
G01N 35/00 - Analyse automatique non limitée à des procédés ou à des matériaux spécifiés dans un seul des groupes Manipulation de matériaux à cet effet
G01N 35/02 - Analyse automatique non limitée à des procédés ou à des matériaux spécifiés dans un seul des groupes Manipulation de matériaux à cet effet en utilisant une série de récipients à échantillons déplacés par un transporteur passant devant un ou plusieurs postes de traitement ou d'analyse
G01N 35/10 - Dispositifs pour transférer les échantillons vers, dans ou à partir de l'appareil d'analyse, p. ex. dispositifs d'aspiration, dispositifs d'injection
Provided herein are compositions and methods useful for the detection of MTB. In particular, provided herein are kits, reagents, reaction mixtures, and methods involving such for nucleic acid amplification and detection procedures, which specifically and sensitively detect MTB in samples.
C12Q 1/689 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes pour la détection ou l’identification d’organismes pour les bactéries
Provided herein is technology relating to amplification of nucleic acids and particularly, but not exclusively, to compositions and methods for doing improving the polymerase chain reaction and providing reagents for polymerase chain reaction with improved stability.
C12Q 1/00 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions
C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques
C12N 15/10 - Procédés pour l'isolement, la préparation ou la purification d'ADN ou d'ARN
Provided herein is technology relating to amplification of nucleic acids and particularly, but not exclusively, to compositions and methods for doing improving the polymerase chain reaction and providing reagents for polymerase chain reaction with improved stability.
C07D 275/03 - Composés hétérocycliques contenant des cycles thiazole-1, 2 ou thiazole-1, 2 hydrogéné non condensés avec d'autres cycles avec des hétéro-atomes ou avec des atomes de carbone comportant trois liaisons à des hétéro-atomes, avec au plus une liaison à un halogène, p. ex. radicaux ester ou nitrile, liés directement aux atomes de carbone du cycle
C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
C12Q 1/6806 - Préparation d’acides nucléiques pour analyse, p. ex. pour test de réaction en chaîne par polymérase [PCR]
C12Q 1/6848 - Réactions d’amplification d’acides nucléiques caracterisées par les moyens d’empêcher la contamination ou d’augmenter la spécificité ou la sensibilité d’une réaction d’amplification
The disclosure is directed to kits and methods for amplifying and detecting human papilloma virus (HPV) of genotype 16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59, 66, and/or 68 in a sample, which comprises a variety of combinations of forward oligonucleotide primers, reverse oligonucleotide primers, and oligonucleotide probes.
C12Q 1/6886 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes pour les maladies provoquées par des altérations du matériel génétique pour le cancer
C12Q 1/6888 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes pour la détection ou l’identification d’organismes
C12Q 1/70 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des virus ou des bactériophages
The disclosure is directed to kits and methods for amplifying and detecting human papilloma virus (HPV) of genotype 16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59, 66, and/or 68 in a sample, which comprises a variety of combinations of forward oligonucleotide primers, reverse oligonucleotide primers, and oligonucleotide probes.
C12Q 1/6886 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes pour les maladies provoquées par des altérations du matériel génétique pour le cancer
C12Q 1/6888 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes pour la détection ou l’identification d’organismes
C12Q 1/70 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des virus ou des bactériophages
The disclosure is directed to kits and methods for amplifying and detecting human papilloma virus (HPV) of genotype 16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59, 66, and/or 68 in a sample, which comprises a variety of combinations of forward oligonucleotide primers, reverse oligonucleotide primers, and oligonucleotide probes.
C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques
C12Q 1/6883 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes pour les maladies provoquées par des altérations du matériel génétique
C12Q 1/6853 - Réactions d’amplification d’acides nucléiques utilisant des amorces ou des matrices modifiées
Provided herein is technology relating to detecting molecular markers relevant to cancer and particularly, but not exclusively, to methods and compositions for quantifying and/or detecting EGFR mRNA and/or EGFRvIII mRNA in biological samples.
C12Q 1/6886 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes pour les maladies provoquées par des altérations du matériel génétique pour le cancer
Provided herein is technology relating to the manipulation and detection of nucleic acids, including but not limited to compositions, methods, and kits related to nucleotides comprising a chemically reactive linking moiety.
C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques
C07H 19/10 - Radicaux pyrimidine avec le radical saccharide estérifié par des acides phosphoriques ou polyphosphoriques
C07H 19/20 - Radicaux purine avec le radical saccharide estérifié par des acides phosphoriques ou polyphosphoriques
C12Q 1/6806 - Préparation d’acides nucléiques pour analyse, p. ex. pour test de réaction en chaîne par polymérase [PCR]
C12N 15/10 - Procédés pour l'isolement, la préparation ou la purification d'ADN ou d'ARN
C07H 21/04 - Composés contenant au moins deux unités mononucléotide comportant chacune des groupes phosphate ou polyphosphate distincts liés aux radicaux saccharide des groupes nucléoside, p. ex. acides nucléiques avec le désoxyribosyle comme radical saccharide
The present disclosure relates to systems and methods for purifying nucleic acid. In particular, the present disclosure relates to systems and methods for purifying nucleic acids using metal or metal oxide compositions.
Provided herein are compositions and methods for diagnosing and characterizing tuberculosis infection. In particular, provided herein are compositions and methods for identifying drug resistant tuberculosis.
C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques
C12Q 1/689 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes pour la détection ou l’identification d’organismes pour les bactéries
The present disclosure relates to systems and methods for purifying nucleic acid. In particular, the present disclosure relates to systems and methods for purifying nucleic acids using metal or metal oxide compositions.
The invention is directed to methods, kits, and compositions, for amplifying and detecting Chlamydia trachomatis (CT), Neisseria gonorrhoeae (NG), Trichomonas vaginalis (TV), and Mycoplasma genitalium (MG) in a sample, which comprises a variety of combinations of forward oligonucleotide primers, reverse oligonucleotide primers, and oligonucleotide probes.
C12Q 1/689 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes pour la détection ou l’identification d’organismes pour les bactéries
C12Q 1/6893 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes pour la détection ou l’identification d’organismes pour les protozoaires
Chlamydia trachomatisNeisseria gonorrhoeaeTrichomonas vaginalisMycoplasma genitaliumMycoplasma genitalium (MG) in a sample, which comprises a variety of combinations of forward oligonucleotide primers, reverse oligonucleotide primers, and oligonucleotide probes.
C12Q 1/689 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes pour la détection ou l’identification d’organismes pour les bactéries
C12Q 1/6893 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes pour la détection ou l’identification d’organismes pour les protozoaires
Mycoplasma genitalium (MG) in a sample, which comprises a variety of combinations of forward oligonucleotide primers, reverse oligonucleotide primers, and oligonucleotide probes.
C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques
C12Q 1/689 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes pour la détection ou l’identification d’organismes pour les bactéries
C12Q 1/6893 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes pour la détection ou l’identification d’organismes pour les protozoaires
Provided herein is technology related to processing samples of nucleic acids and particularly, but not exclusively, to methods for enriching samples for small nucleic acids, such as small circulating cell-free DNA.
G01N 1/00 - ÉchantillonnagePréparation des éprouvettes pour la recherche
G01N 1/18 - Dispositifs pour prélever des échantillons à l'état liquide ou fluide avec mesures prises pour diviser des échantillons en plusieurs parties
C12N 15/10 - Procédés pour l'isolement, la préparation ou la purification d'ADN ou d'ARN
The disclosure is directed to methods, kits, and compositions, for amplifying and detecting a human hepatitis B virus (HBV) in a sample, which comprises a variety of combinations of forward oligonucleotide primers, reverse oligonucleotide primers, and oligonucleotide probes.
C12Q 1/6876 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes
C12Q 1/70 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des virus ou des bactériophages
C12Q 1/6806 - Préparation d’acides nucléiques pour analyse, p. ex. pour test de réaction en chaîne par polymérase [PCR]
C12Q 1/686 - Réaction en chaine par polymérase [PCR]
The disclosure is directed to methods, kits, and compositions, for amplifying and detecting a human hepatitis C virus (HCV) in a sample, which comprises a variety of combinations of forward oligonucleotide primers, reverse oligonucleotide primers, and oligonucleotide probes. The disclosure employs a dual-probe method and the primers and probes bind to a conserved region of the 5'-non-coding region (UTR).
C12Q 1/70 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des virus ou des bactériophages
44.
ASSAY FOR DETECTING HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS (HIV)
The disclosure is directed to methods, kits, and compositions for amplifying and detecting a large number of different types of human immunodeficiency virus-1 (HIV-1) in a sample. The methods, kits and compositions employ both a specific primer pair which amplify the integrase (INT) gene and a specific primer pair which amplifies the long terminal repeat (LTR) region. The methods, kits and compositions may also employ a dual probe system with fluorophore label and quencher.
C12Q 1/70 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des virus ou des bactériophages
45.
ASSAY FOR DETECTING HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS (HIV)
The disclosure is directed to methods, kits, and compositions for amplifying and detecting a large number of different types of human immunodeficiency virus-1 (HIV-1) in a sample. The methods, kits and compositions employ both a specific primer pair which amplify the integrase (INT) gene and a specific primer pair which amplifies the long terminal repeat (LTR) region. The methods, kits and compositions may also employ a dual probe system with fluorophore label and quencher.
C12Q 1/70 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des virus ou des bactériophages
The disclosure is directed to methods, kits, and compositions, for amplifying and detecting a human hepatitis C virus (HCV) in a sample, which comprises a variety of combinations of forward oligonucleotide primers, reverse oligonucleotide primers, and oligonucleotide probes. The disclosure employs a dual-probe method and the primers and probes bind to a conserved region of the 5'-non-coding region (UTR).
C12Q 1/70 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des virus ou des bactériophages
The disclosure is directed to methods, kits, and compositions, for amplifying and detecting a human hepatitis B virus (HBV) in a sample, which comprises a variety of combinations of forward oligonucleotide primers, reverse oligonucleotide primers, and oligonucleotide probes.
C12Q 1/70 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des virus ou des bactériophages
The disclosure is directed to methods, kits, and compositions, for amplifying and detecting a human hepatitis C virus (HCV) in a sample, which comprises a variety of combinations of forward oligonucleotide primers, reverse oligonucleotide primers, and oligonucleotide probes.
C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques
C12Q 1/70 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des virus ou des bactériophages
The disclosure is directed to methods, kits, and compositions, for amplifying and detecting a human hepatitis B virus (HBV) in a sample, which comprises a variety of combinations of forward oligonucleotide primers, reverse oligonucleotide primers, and oligonucleotide probes.
C12Q 1/70 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des virus ou des bactériophages
50.
Assay for detecting human immunodeficiency virus (HIV)
The disclosure is directed to methods, kits, and compositions for amplifying and detecting a human immunodeficiency virus-1 (HIV-1) in a sample, which comprises a variety of combinations of forward oligonucleotide primers, reverse oligonucleotide primers, and oligonucleotide probes.
C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques
C12Q 1/70 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des virus ou des bactériophages
51.
Analysis Systems and Methods of Identifying Consumables and Reagents
Provided are analysis systems that include components for identifying, inventorying, or both, consumables and/or reagents introduced into one or more consumable or reagent storage areas of the systems. The systems include a camera and camera positioning means for positioning the camera in optical communication with the one or more consumable or reagent storage areas. The systems further include one or more non-transitory computer-readable media including instructions that cause the system to detect when a consumable or reagent has been introduced to the one or more consumable or reagent storage areas, position the camera in optical communication with the introduced consumable or reagent, and identify the introduced consumable or reagent. Also provided are automated methods for identifying, inventorying, or both, consumables and/or reagents introduced into one or more consumable or reagent storage areas of an analysis system.
G01N 35/00 - Analyse automatique non limitée à des procédés ou à des matériaux spécifiés dans un seul des groupes Manipulation de matériaux à cet effet
G01N 35/10 - Dispositifs pour transférer les échantillons vers, dans ou à partir de l'appareil d'analyse, p. ex. dispositifs d'aspiration, dispositifs d'injection
B01L 3/00 - Récipients ou ustensiles pour laboratoires, p. ex. verrerie de laboratoireCompte-gouttes
52.
METHODS OF AUTOMATIZED SAMPLE LOADING AND PROCESSING AND DEVICES AND SYSTEMS RELATED THERETO
Provided are methods for the automated loading and/or automatic processing of one or more samples in an automated sample processing device. Also provided are automated sample loading systems and devices that include automated sample loading systems or devices that are utilized in such systems.
Provided are methods for the automated loading and/or automatic processing of one or more samples in an automated sample processing device. Also provided are automated sample loading systems and devices that include automated sample loading systems or devices that are utilized in such systems.
G01N 35/10 - Dispositifs pour transférer les échantillons vers, dans ou à partir de l'appareil d'analyse, p. ex. dispositifs d'aspiration, dispositifs d'injection
B01L 3/00 - Récipients ou ustensiles pour laboratoires, p. ex. verrerie de laboratoireCompte-gouttes
B01L 7/04 - Dispositifs d'isolation thermique, p. ex. manchons pour ballons
G01N 35/00 - Analyse automatique non limitée à des procédés ou à des matériaux spécifiés dans un seul des groupes Manipulation de matériaux à cet effet
G06K 9/00 - Méthodes ou dispositions pour la lecture ou la reconnaissance de caractères imprimés ou écrits ou pour la reconnaissance de formes, p.ex. d'empreintes digitales
54.
ANALYSIS SYSTEMS AND METHODS OF IDENTIFYING CONSUMABLES AND REAGENTS
Provided are analysis systems that include components for identifying, inventorying, or both, consumables and/or reagents introduced into one or more consumable or reagent storage areas of the systems. The systems include a camera and camera positioning means for positioning the camera in optical communication with the one or more consumable or reagent storage areas. The systems further include one or more non-transitory computer-readable media including instructions that cause the system to detect when a consumable or reagent has been introduced to the one or more consumable or reagent storage areas, position the camera in optical communication with the introduced consumable or reagent, and identify the introduced consumable or reagent. Also provided are automated methods for identifying, inventorying, or both, consumables and/or reagents introduced into one or more consumable or reagent storage areas of an analysis system.
B01L 9/06 - Supports de tubes à essaiPorte-tubes à essai
C40B 60/02 - Appareils intégrés spécialement adaptés à la création, au criblage de bibliothèques et à l'identification des éléments des bibliothèques
C40B 60/04 - Appareils intégrés spécialement adaptés à la fois à la création de bibliothèques et à l'identification des éléments des bibliothèques
C40B 60/06 - Appareils intégrés spécialement adaptés à la fois à la création et à l'identification des éléments des bibliothèques
C40B 60/08 - Appareils intégrés spécialement adaptés à la fois à la création et au criblage de bibliothèques
C40B 60/10 - Appareils spécialement adaptés à une utilisation en chimie combinatoire ou avec des bibliothèques pour identifier des éléments des bibliothèques
C40B 60/12 - Appareils spécialement adaptés à une utilisation en chimie combinatoire ou avec des bibliothèques pour cribler des bibliothèques
C40B 60/14 - Appareils spécialement adaptés à une utilisation en chimie combinatoire ou avec des bibliothèques pour créer des bibliothèques
Provided herein is technology relating to next-generation sequencing and particularly, but not exclusively, to methods and compositions for preparing a next-generation sequencing library comprising short overlapping DNA fragments and using the library to sequence one or more target nucleic acids.
Provided herein is technology relating to the manipulation and detection of nucleic acids, including but not limited to compositions, methods, and kits related to nucleotides comprising a chemically reactive linking moiety.
C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques
C12Q 1/6806 - Préparation d’acides nucléiques pour analyse, p. ex. pour test de réaction en chaîne par polymérase [PCR]
C12N 15/10 - Procédés pour l'isolement, la préparation ou la purification d'ADN ou d'ARN
C07H 19/20 - Radicaux purine avec le radical saccharide estérifié par des acides phosphoriques ou polyphosphoriques
C07H 19/10 - Radicaux pyrimidine avec le radical saccharide estérifié par des acides phosphoriques ou polyphosphoriques
C07H 21/04 - Composés contenant au moins deux unités mononucléotide comportant chacune des groupes phosphate ou polyphosphate distincts liés aux radicaux saccharide des groupes nucléoside, p. ex. acides nucléiques avec le désoxyribosyle comme radical saccharide
Provided herein is technology related to processing samples of nucleic acids and particularly, but not exclusively, to methods for enriching samples for small nucleic acids, such as small circulating cell-free DNA.
G01N 1/00 - ÉchantillonnagePréparation des éprouvettes pour la recherche
G01N 1/18 - Dispositifs pour prélever des échantillons à l'état liquide ou fluide avec mesures prises pour diviser des échantillons en plusieurs parties
C12N 15/10 - Procédés pour l'isolement, la préparation ou la purification d'ADN ou d'ARN
58.
MAXIMIZING DNA YIELD OF BLOOD SPECIMENS COLLECTED IN RAPID CLOT TUBES
The invention provides methods for isolating DNA from a blood sample collected into tubes containing a rapid clot activator, which involves the use of a lysis buffer comprising an alcohol.
C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques
C12N 15/10 - Procédés pour l'isolement, la préparation ou la purification d'ADN ou d'ARN
59.
Maximizing DNA yield of blood specimens collected in rapid clot tubes
The invention provides methods for isolating DNA from a blood sample collected into tubes containing a rapid clot activator, which involves the use of a lysis buffer comprising an alcohol.
C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques
C12N 15/10 - Procédés pour l'isolement, la préparation ou la purification d'ADN ou d'ARN
C12Q 1/6806 - Préparation d’acides nucléiques pour analyse, p. ex. pour test de réaction en chaîne par polymérase [PCR]
C12Q 1/70 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des virus ou des bactériophages
60.
Primers and probes for detecting human papillomavirus and human beta globin sequences in test samples
The present invention relates to primers, probes, primer sets, primer and probe sets, methods and kits for detecting human papillomaviruses, human beta globin sequences and human papillomaviruses and human beta globin sequences in a test sample.
C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques
C12Q 1/6806 - Préparation d’acides nucléiques pour analyse, p. ex. pour test de réaction en chaîne par polymérase [PCR]
C12Q 1/6886 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes pour les maladies provoquées par des altérations du matériel génétique pour le cancer
C12Q 1/70 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des virus ou des bactériophages
The invention is directed to compositions, kits, and methods for amplifying and detecting a Zika virus nucleic acid sequence in a sample, which comprises a variety of combinations of forward oligonucleotide primers, reverse oligonucleotide primers, and oligonucleotide probes.
C12Q 1/70 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des virus ou des bactériophages
62.
Methods and systems of multi-assay processing and analysis
The instant disclosure provides methods of multi-assay processing and multi-assay analysis. Such multi-assay processing and analysis pertain to automated detection of target nucleic acids, e.g., as performed in the clinical setting for diagnostic purposes. Also provided are common assay timing protocols derived from a variety of individual nucleic acid amplification and analysis protocols and modified to prevent resource contention. The instant disclosure also provides systems and devices for practicing the methods as described herein.
G01N 35/00 - Analyse automatique non limitée à des procédés ou à des matériaux spécifiés dans un seul des groupes Manipulation de matériaux à cet effet
C12Q 1/6888 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes pour la détection ou l’identification d’organismes
C12Q 1/6806 - Préparation d’acides nucléiques pour analyse, p. ex. pour test de réaction en chaîne par polymérase [PCR]
G01N 33/48 - Matériau biologique, p. ex. sang, urineHémocytomètres
B01L 9/00 - Dispositifs de supportDispositifs de serrage
G01N 30/88 - Systèmes intégrés d'analyse, spécialement adaptés à cet effet, non couverts par un seul des groupes
G01N 33/569 - Tests immunologiquesTests faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiquesMatériaux à cet effet pour micro-organismes, p. ex. protozoaires, bactéries, virus
The instant disclosure provides methods of multi-assay processing and multi-assay analysis. Such multi-assay processing and analysis pertain to automated detection of target nucleic acids, e.g., as performed in the clinical setting for diagnostic purposes. Also provided are common assay timing protocols derived from a variety of individual nucleic acid amplification and analysis protocols and modified to prevent resource contention. The instant disclosure also provides systems and devices for practicing the methods as described herein.
C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques
G01N 33/48 - Matériau biologique, p. ex. sang, urineHémocytomètres
G01N 33/50 - Analyse chimique de matériau biologique, p. ex. de sang ou d'urineTest par des méthodes faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiques par ligandsTest immunologique
65.
Reaction vessel systems and methods and systems for using same
Aspects of the present disclosure include systems that include reaction vessels and reaction vessel caps. In certain aspects, the reaction vessels include a reaction chamber and a groove disposed around a top opening of a reaction chamber. The system also includes a RV cap that includes a cap body, a RV plug, and a lower wall that includes an outer radial groove disposed above an outward projecting ridge of the lower wall. When the cap is inserted into the RV, the RV plug of the RV cap is sealingly inserted into the reaction chamber of the RV, a ridge of the RV mates with the outer radial groove of the RV cap, and an outward projecting ridge of the RV cap mates with the radial groove of the RV. Also provided are methods and sample analysis systems, which may employ the RV/RV cap systems of the present disclosure.
G01N 35/10 - Dispositifs pour transférer les échantillons vers, dans ou à partir de l'appareil d'analyse, p. ex. dispositifs d'aspiration, dispositifs d'injection
66.
METHODS AND SYSTEMS OF MULTI-ASSAY PROCESSING AND ANALYSIS
The instant disclosure provides methods of multi-assay processing and multi-assay analysis. Such multi-assay processing and analysis pertain to automated detection of target nucleic acids, e.g., as performed in the clinical setting for diagnostic purposes. Also provided are common assay timing protocols derived from a variety of individual nucleic acid amplification and analysis protocols and modified to prevent resource contention. The instant disclosure also provides systems and devices for practicing the methods as described herein.
C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques
G01N 33/48 - Matériau biologique, p. ex. sang, urineHémocytomètres
G01N 33/50 - Analyse chimique de matériau biologique, p. ex. de sang ou d'urineTest par des méthodes faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiques par ligandsTest immunologique
Aspects of the present disclosure include sample analysis methods and systems. According to certain embodiments, provided are methods of analyzing samples in an automated sample analysis system. The methods include introducing samples and sample preparation cartridges into the system, isolating and purifying an analyte (e.g., nucleic acids and/or proteins) present in the samples at a sample preparation station, and performing analyte detection assays in assay mixtures that include the purified analyte. Also provided are automated sample analysis systems that find use, e.g., in performing the methods of the present disclosure. In certain aspects, the methods and systems provide for continuous operator access during replenishment or removal of one or any combination of samples, bulk fluids, reagents, commodities, waste, and/or the like.
G01N 35/02 - Analyse automatique non limitée à des procédés ou à des matériaux spécifiés dans un seul des groupes Manipulation de matériaux à cet effet en utilisant une série de récipients à échantillons déplacés par un transporteur passant devant un ou plusieurs postes de traitement ou d'analyse
68.
SAMPLE PREPARATION CARTRIDGES AND METHODS FOR USING SAME
Aspects of the present disclosure include sample preparation cartridges including a frame the includes a plurality of wells integrated therewith, where the plurality of wells have a closed bottom and an open top. The frame further includes an opening within the frame having a reaction vessel (RV) or RV cap removably disposed therein, where the plurality of wells and the opening are linearly arranged relative to each other. Also provided are sample preparation cartridges that include a frame, two or more cartridge separation projections on a top side of the frame, and two or more cartridge separation projections on a bottom side of the frame. The cartridge separation projections separate the cartridge and a different cartridge when the cartridge and different cartridge are stacked. Methods of using the sample preparation cartridges, as well as nucleic acid sample preparation units that include the sample preparation cartridges, are also provided.
C12Q 1/00 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions
G01N 1/00 - ÉchantillonnagePréparation des éprouvettes pour la recherche
Aspects of the present disclosure include sample analysis methods and systems. According to certain embodiments, provided are methods of analyzing samples in an automated sample analysis system. The methods include introducing samples and sample preparation cartridges into the system, isolating and purifying an analyte (e.g., nucleic acids and/or proteins) present in the samples at a sample preparation station, and performing analyte detection assays in assay mixtures that include the purified analyte. Also provided are automated sample analysis systems that find use, e.g., in performing the methods of the present disclosure. In certain aspects, the methods and systems provide for continuous operator access during replenishment or removal of one or any combination of samples, bulk fluids, reagents, commodities, waste, and/or the like.
G01N 35/02 - Analyse automatique non limitée à des procédés ou à des matériaux spécifiés dans un seul des groupes Manipulation de matériaux à cet effet en utilisant une série de récipients à échantillons déplacés par un transporteur passant devant un ou plusieurs postes de traitement ou d'analyse
This instant disclosure provides methods of processing a sample in an automated sample processing device including devices configured for the automated extraction or isolation of nucleic acids. Also provided are plungers for use in such devices and methods of sample processing. Systems for performing the described methods and employing the described plungers are also provided.
G01N 33/543 - Tests immunologiquesTests faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiquesMatériaux à cet effet avec un support insoluble pour l'immobilisation de composés immunochimiques
G01N 33/00 - Recherche ou analyse des matériaux par des méthodes spécifiques non couvertes par les groupes
G01N 35/10 - Dispositifs pour transférer les échantillons vers, dans ou à partir de l'appareil d'analyse, p. ex. dispositifs d'aspiration, dispositifs d'injection
B01L 99/00 - Matière non prévue dans les autres groupes de la présente sous-classe
G01N 35/00 - Analyse automatique non limitée à des procédés ou à des matériaux spécifiés dans un seul des groupes Manipulation de matériaux à cet effet
Aspects of the present disclosure include sample analysis methods and systems. According to certain embodiments, provided are methods of analyzing samples in an automated sample analysis system. The methods include introducing samples and sample preparation cartridges into the system, isolating and purifying an analyte (e.g., nucleic acids and/or proteins) present in the samples at a sample preparation station, and performing analyte detection assays in assay mixtures that include the purified analyte. Also provided are automated sample analysis systems that find use, e.g., in performing the methods of the present disclosure. In certain aspects, the methods and systems provide for continuous operator access during replenishment or removal of one or any combination of samples, bulk fluids, reagents, commodities, waste, and/or the like.
G01N 35/10 - Dispositifs pour transférer les échantillons vers, dans ou à partir de l'appareil d'analyse, p. ex. dispositifs d'aspiration, dispositifs d'injection
G01N 35/02 - Analyse automatique non limitée à des procédés ou à des matériaux spécifiés dans un seul des groupes Manipulation de matériaux à cet effet en utilisant une série de récipients à échantillons déplacés par un transporteur passant devant un ou plusieurs postes de traitement ou d'analyse
G01N 35/00 - Analyse automatique non limitée à des procédés ou à des matériaux spécifiés dans un seul des groupes Manipulation de matériaux à cet effet
Aspects of the present disclosure include sample preparation cartridges including a frame that includes a plurality of wells integrated therewith, where the plurality of wells have a closed bottom and an open top. The frame further includes an opening within the frame having a reaction vessel (RV) or RV cap removably disposed therein, where the plurality of wells and the opening are linearly arranged relative to each other. Also provided are sample preparation cartridges that include a frame, two or more cartridge separation projections on a top side of the frame, and two or more cartridge separation projections on a bottom side of the frame. The cartridge separation projections separate the cartridge and a different cartridge when the cartridge and different cartridge are stacked. Methods of using the sample preparation cartridges, as well as nucleic acid sample preparation units that include the sample preparation cartridges, are also provided.
Disclosed herein are hybridization buffer compositions and hybridization compositions comprising guanidinium thiocyanate, methods of making the compositions, and methods of using the compositions, such as the hybridization of DNA or RNA sequences by fluorescence in situ hybridization ("FISH").
C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques
74.
Purification of nucleic acids using copper-titanium oxides
The present disclosure relates to systems and methods for purifying nucleic acid. In particular, the present disclosure relates to systems and methods for purifying nucleic acids using metal or metal oxide compositions.
Disclosed herein are hybridization buffer compositions and hybridization compositions comprising an alkyl diester such as dimethyl succinate, methods of making the compositions, and methods of using the compositions, such as the hybridization of DNA or RNA sequences by fluorescence in situ hybridization ("FISH") and blot hybridization methodologies.
C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques
76.
Compositions and methods for identifying drug resistant tuberculosis
Provided herein are compositions and methods for diagnosing and characterizing tuberculosis infection. In particular, provided herein are compositions and methods for identifying drug resistant tuberculosis.
C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques
C12Q 1/689 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes pour la détection ou l’identification d’organismes pour les bactéries
Compositions and techniques for the extraction, enrichment and isolation of nucleic acids from cellular source material using an ammonium hydroxide-based solution are disclosed herein.
C07H 21/00 - Composés contenant au moins deux unités mononucléotide comportant chacune des groupes phosphate ou polyphosphate distincts liés aux radicaux saccharide des groupes nucléoside, p. ex. acides nucléiques
C12N 15/10 - Procédés pour l'isolement, la préparation ou la purification d'ADN ou d'ARN
C07H 1/08 - SéparationPurification à partir de produits naturels
C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques
78.
PURIFICATION OF NUCLEIC ACIDS USING COPPER-TITANIUM OXIDES
The present disclosure relates to systems and methods for purifying nucleic acid. In particular, the present disclosure relates to systems and methods for purifying nucleic acids using metal or metal oxide compositions.
C12N 15/10 - Procédés pour l'isolement, la préparation ou la purification d'ADN ou d'ARN
C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques
C12P 19/34 - Polynucléotides, p. ex. acides nucléiques, oligoribonucléotides
C07H 21/02 - Composés contenant au moins deux unités mononucléotide comportant chacune des groupes phosphate ou polyphosphate distincts liés aux radicaux saccharide des groupes nucléoside, p. ex. acides nucléiques avec le ribosyle comme radical saccharide
Provided herein are compositions and methods for diagnosing and characterizing tuberculosis infection. In particular, provided herein are compositions and methods for identifying drug resistant tuberculosis.
A61P 31/06 - Agents antibactériens pour le traitement de la tuberculose
C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques
The present disclosure relates to systems and methods for purifying nucleic acid. In particular, the present disclosure relates to systems and methods for purifying nucleic acids using metal or metal oxide compositions.
C07H 21/02 - Composés contenant au moins deux unités mononucléotide comportant chacune des groupes phosphate ou polyphosphate distincts liés aux radicaux saccharide des groupes nucléoside, p. ex. acides nucléiques avec le ribosyle comme radical saccharide
C12N 15/10 - Procédés pour l'isolement, la préparation ou la purification d'ADN ou d'ARN
C12P 19/34 - Polynucléotides, p. ex. acides nucléiques, oligoribonucléotides
C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques
81.
PRIMERS AND PROBES FOR DETECTING HUMAN PAPILLOMAVIRUS AND HUMAN BETA GLOBIN SEQUENCES IN TEST SAMPLES
The present invention relates to primers, probes, primer sets, primer and probe sets, methods and kits for detecting human papillomaviruses, human beta globin sequences and human papillomaviruses and human beta globin sequences in a test sample.
C12Q 1/6876 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes
C12Q 1/6888 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes pour la détection ou l’identification d’organismes
C12Q 1/70 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des virus ou des bactériophages
C40B 30/04 - Procédés de criblage des bibliothèques en mesurant l'aptitude spécifique à se lier à une molécule cible, p. ex. liaison anticorps-antigène, liaison récepteur-ligand
82.
Compositions and methods for nucleic acid extraction
Compositions and techniques for the extraction, enrichment and isolation of nucleic acids from yeast in a whole blood sample using amine monomers are disclosed herein.
C07H 21/00 - Composés contenant au moins deux unités mononucléotide comportant chacune des groupes phosphate ou polyphosphate distincts liés aux radicaux saccharide des groupes nucléoside, p. ex. acides nucléiques
Provided herein is technology relating to detecting molecular markers relevant to cancer and particularly, but not exclusively, to methods and compositions for quantifying and/or detecting EGFR mRNA and/or EGFRvIII mRNA in biological samples.
C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques
C07H 19/207 - Radicaux purine avec le radical saccharide estérifié par des acides phosphoriques ou polyphosphoriques les acides phosphoriques ou polyphosphoriques étant estérifiés par un autre composé hydroxylique, p. ex. les dinucléotides de la flavine-adénine ou de la nicotinamide-adénine
C12Q 1/6886 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes pour les maladies provoquées par des altérations du matériel génétique pour le cancer
Provided herein is technology relating to detecting molecular markers relevant to cancer and particularly, but not exclusively, to methods and compositions for quantifying and/or detecting EGFR mRNA and/or EGFRvIII mRNA in biological samples.
C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques
C12N 15/10 - Procédés pour l'isolement, la préparation ou la purification d'ADN ou d'ARN
85.
Detection of chromosomal abnormalities associated with endometrial cancer
Mayo Foundation for Medical Eduction And Research (USA)
Abbott Molecular (USA)
Inventeur(s)
Pestova, Ekaterina
Morrison, Larry E.
Voss, Jesse S.
Peterson, Lisa M.
Halling, Kevin C.
Abrégé
The methods and compositions described herein address the need for diagnostic method that could be offered to women during yearly checkups to allow for early detection, diagnosis and classification, and treatment of endometrial cancer. In addition, these methods and compositions address the current need for improving diagnostic accuracy of biopsy procedures in symptomatic patients.
C12Q 1/6886 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes pour les maladies provoquées par des altérations du matériel génétique pour le cancer
C12Q 1/6837 - Couplage enzymatique ou biochimique d’acides nucléiques à une phase solide utilisant des réseaux de sondes ou des puces à sondes
The present disclosure provides methods for identifying early stage non-small-cell lung cancer (NSCLC) patients who will have an unfavorable prognosis for the recurrence of lung cancer after surgical resection. The methods are based in part on the discovery of chromosomal copy number abnormalities that can be used for prognostic classification. The methods preferably use fluorescence in situ hybridization with fluorescently labeled nucleic acid probes to hybridize to patient samples to quantify the chromosomal copy number of these genetic loci.
C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques
C12Q 1/6886 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes pour les maladies provoquées par des altérations du matériel génétique pour le cancer
G01N 33/574 - Tests immunologiquesTests faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiquesMatériaux à cet effet pour le cancer
The present invention relates to compositions and methods for detection, analysis, and treatment of nucleic acids. In particular, the present invention relates to compositions and methods for generating and using hybridization probes.
The present invention provides systems, devices, methods, kits, and compositions for nucleic acid analysis using digital PCR. In particular, methods are provided to analyze high titer samples that cannot be divided into a sufficient number of partitions containing zero nucleic acid molecules per partition to allow for Poisson analysis (digital PCR analysis).
Provided herein is technology related to processing samples of nucleic acids and particularly, but not exclusively, to methods for enriching samples for small nucleic acids, such as small circulating cell-free DNA.
Provided herein is technology related to processing samples of nucleic acids and particularly, but not exclusively, to methods for enriching samples for small nucleic acids, such as small circulating cell-free DNA. Apoptotic fetal trophoblasts shed cffDNA directly into maternal blood in the placenta during gestation. It is estimated that cffDNAs are liberated into maternal plasma at a rate of approximately 20,000 per minute in 2.5 liters of maternal plasma (approximate total blood volume of a typical female is 5 liters) and are detected by some tests in circulating maternal plasma by approximately the 10th or 11th week of gestation and, in some studies, as early as the 5th week (see, e.g., Holmberg et al (2013), PLoS One 8(8):e73068) or, by some tests, as early as the 18th day of gestation (see, e.g., Guibert et al (2003) Hum Reprod 18:1733-6). A quasi-steady state relationship exists between cffDNA biogenesis in maternal plasma and cffDNA degradation by maternal plasma nucleases.
The present invention provides novel and non-obvious improvements to dried blood spot testing for HIV-1 viral load useful for diagnosis and monitoring treatment progression.
C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques
C12P 19/34 - Polynucléotides, p. ex. acides nucléiques, oligoribonucléotides
C12Q 1/70 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des virus ou des bactériophages
C12Q 1/686 - Réaction en chaine par polymérase [PCR]
C12Q 1/6806 - Préparation d’acides nucléiques pour analyse, p. ex. pour test de réaction en chaîne par polymérase [PCR]
G01N 35/00 - Analyse automatique non limitée à des procédés ou à des matériaux spécifiés dans un seul des groupes Manipulation de matériaux à cet effet
G01N 35/10 - Dispositifs pour transférer les échantillons vers, dans ou à partir de l'appareil d'analyse, p. ex. dispositifs d'aspiration, dispositifs d'injection
Provided herein is technology relating to next-generation sequencing (NGS) and particularly, but not exclusively, to methods and compositions for preparing NGS libraries, e.g., to prepare NGS libraries for use in a NGS workflow.
C12N 15/10 - Procédés pour l'isolement, la préparation ou la purification d'ADN ou d'ARN
C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques
Provided herein is technology relating to the manipulation and characterization of nucleic acids and particularly, but not exclusively, to methods and compositions relating to oligonucleotide primers and probes for amplifying, quantifying, and sequencing nucleic acids.
C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques
C40B 40/06 - Bibliothèques comprenant des nucléotides ou des polynucléotides ou leurs dérivés
C40B 30/04 - Procédés de criblage des bibliothèques en mesurant l'aptitude spécifique à se lier à une molécule cible, p. ex. liaison anticorps-antigène, liaison récepteur-ligand
94.
COMPOSITIONS AND METHODS FOR THE DETECTION AND ANALYSIS OF MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS
Provided herein are compositions and methods useful for the detection of MTB. In particular, provided herein are kits, reagents, reaction mixtures, and methods involving such for nucleic acid amplification and detection procedures, which specifically and sensitively detect MTB in samples.
C07H 21/04 - Composés contenant au moins deux unités mononucléotide comportant chacune des groupes phosphate ou polyphosphate distincts liés aux radicaux saccharide des groupes nucléoside, p. ex. acides nucléiques avec le désoxyribosyle comme radical saccharide
C12Q 1/689 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes pour la détection ou l’identification d’organismes pour les bactéries
95.
Compositions and methods for the detection and analysis of mycobacterium tuberculosis
Provided herein are compositions and methods useful for the detection of MTB. In particular, provided herein are kits, reagents, reaction mixtures, and methods involving such for nucleic acid amplification and detection procedures, which specifically and sensitively detect MTB in samples.
C12P 19/34 - Polynucléotides, p. ex. acides nucléiques, oligoribonucléotides
C12Q 1/689 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes pour la détection ou l’identification d’organismes pour les bactéries
96.
COMPOSITIONS AND METHODS FOR THE DETECTION AND ANALYSIS OF MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS
Provided herein are compositions and methods useful for the detection of MTB. In particular, provided herein are kits, reagents, reaction mixtures, and methods involving such for nucleic acid amplification and detection procedures, which specifically and sensitively detect MTB in samples.
C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques
G06F 19/22 - pour la comparaison de séquences impliquant des nucléotides ou des acides aminés, p.ex. recherche d'homologie, identification de motifs ou de polymorphismes de nucléotides simples [SNP] ou alignement de séquences
The present invention provides novel and non-obvious improvements to dried blood spot testing for HIV-1 viral load useful for diagnosis and monitoring treatment progression.
G01N 35/00 - Analyse automatique non limitée à des procédés ou à des matériaux spécifiés dans un seul des groupes Manipulation de matériaux à cet effet
98.
AUTOMATED HIV-1 VIRAL LOAD TESTING PROCEDURE FOR DRIED SPOTS
The present invention provides novel and non-obvious improvements to dried blood spot testing for HIV-1 viral load useful for diagnosis and monitoring treatment progression.
C12Q 1/686 - Réaction en chaine par polymérase [PCR]
C12Q 1/70 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des virus ou des bactériophages
99.
MATERIALS AND METHODS FOR ASSESSING PROGRESSION OF PROSTATE CANCER
Methods of distinguishing and identifying a patient with aggressive/indolent, prostatic adenocarcinoma comprising contacting a sample from the patient with a set of detectably labeled probes under hybridization conditions and determining the presence of chromosomal abnormalities in the sample; sets of probes for use in such methods; and kits comprising a set of probes and instructions for distinguishing or identifying a patient as having aggressive/indolent, prostatic adenocarcinoma.
C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques
100.
DETECTION OF SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISMS IN HUMAN KRAS
Disclosed herein are primers and probes for the detection of single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the KRAS gene. These primers and probes may be used in a method of identifying the presence or absence of one or more SNPs in the KRAS gene. These primers and probes may also be used in a method of predicting a response of a subject in need thereof to a cancer therapy. The primers and probes may further be used in a method of selecting a cancer therapy for a subject in need thereof.
C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques