Abrégé

Provided are nucleic acid translators capable of carrying out logic operations with improved efficiency, maximized output and reduced off-target effects, in particular in a biological system. Methods of using these translators to transduce signal are also provided.

Classes IPC  ?

• C12N 15/113 - Acides nucléiques non codants modulant l'expression des gènes, p. ex. oligonucléotides anti-sens
• B82Y 10/00 - Nanotechnologie pour le traitement, le stockage ou la transmission d’informations, p. ex. calcul quantique ou logique à un électron
• C07H 21/04 - Composés contenant au moins deux unités mononucléotide comportant chacune des groupes phosphate ou polyphosphate distincts liés aux radicaux saccharide des groupes nucléoside, p. ex. acides nucléiques avec le désoxyribosyle comme radical saccharide
• C12N 15/11 - Fragments d'ADN ou d'ARNLeurs formes modifiées
• C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques
• G06N 3/00 - Agencements informatiques fondés sur des modèles biologiques
• G06N 3/123 - Informatique à ADN

Abrégé

Conjugated molecules are prepared that comprise a predetermined number of oligo conjugation components. The conjugated molecules also may comprise one or more detectable labels. Preparation of these molecules can be implemented according to an asymmetric or a symmetric conjugation strategy.

Classes IPC  ?

• C07H 21/04 - Composés contenant au moins deux unités mononucléotide comportant chacune des groupes phosphate ou polyphosphate distincts liés aux radicaux saccharide des groupes nucléoside, p. ex. acides nucléiques avec le désoxyribosyle comme radical saccharide
• A61K 47/54 - Préparations médicinales caractérisées par les ingrédients non actifs utilisés, p. ex. les supports ou les additifs inertesAgents de ciblage ou de modification chimiquement liés à l’ingrédient actif l’ingrédient non actif étant chimiquement lié à l’ingrédient actif, p. ex. conjugués polymère-médicament l’ingrédient non actif étant un agent de modification l’agent de modification étant un composé organique
• C07H 21/00 - Composés contenant au moins deux unités mononucléotide comportant chacune des groupes phosphate ou polyphosphate distincts liés aux radicaux saccharide des groupes nucléoside, p. ex. acides nucléiques
• C07K 14/00 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés

Produits et services

Pharmaceutical preparations used to treat viral infections; pharmaceutical preparations, namely, nucleic acids for therapeutic use; pharmaceutical preparations used to detect and regulate target polynucleotides

Abrégé

Provided are nucleic acid translators capable of carrying out logic operations with improved efficiency, maximized output and reduced off-target effects, in particular in a biological system. Methods of using these translators to transduce signal are also provided.

Classes IPC  ?

• C07H 21/04 - Composés contenant au moins deux unités mononucléotide comportant chacune des groupes phosphate ou polyphosphate distincts liés aux radicaux saccharide des groupes nucléoside, p. ex. acides nucléiques avec le désoxyribosyle comme radical saccharide
• B82Y 10/00 - Nanotechnologie pour le traitement, le stockage ou la transmission d’informations, p. ex. calcul quantique ou logique à un électron
• C12N 15/11 - Fragments d'ADN ou d'ARNLeurs formes modifiées
• C12N 15/113 - Acides nucléiques non codants modulant l'expression des gènes, p. ex. oligonucléotides anti-sens
• C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques
• G06N 3/00 - Agencements informatiques fondés sur des modèles biologiques
• G06N 3/123 - Informatique à ADN

Abrégé

Provided are nucleic acid translators capable of carrying out logic operations with improved efficiency, maximized output and reduced off-target effects, in particular in a biological system. Methods of using these translators to transduce signal are also provided.

Classes IPC  ?

• C07H 21/04 - Composés contenant au moins deux unités mononucléotide comportant chacune des groupes phosphate ou polyphosphate distincts liés aux radicaux saccharide des groupes nucléoside, p. ex. acides nucléiques avec le désoxyribosyle comme radical saccharide
• C12N 15/113 - Acides nucléiques non codants modulant l'expression des gènes, p. ex. oligonucléotides anti-sens
• C12N 15/11 - Fragments d'ADN ou d'ARNLeurs formes modifiées
• C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques
• G06N 3/00 - Agencements informatiques fondés sur des modèles biologiques
• G06N 3/12 - Agencements informatiques fondés sur des modèles biologiques utilisant des modèles génétiques
• B82Y 10/00 - Nanotechnologie pour le traitement, le stockage ou la transmission d’informations, p. ex. calcul quantique ou logique à un électron

Produits et services

Pharmaceutical preparations used to treat viral infections; pharmaceutical preparations, namely, nucleic acids for therapeutic use; pharmaceutical preparations used to detect and regulate target polynucleotides. Medical laboratory services (terms considered too vague by the International Bureau - Rule 13(2)(b) of the Common Regulations); scientific laboratory services; conducting laboratory experiments on behalf of others; software as a service featuring software for designing laboratory experiments, for running laboratory experiments, for reviewing laboratory experiment controls, equipment, and environment data, and for reviewing laboratory experiment results (terms considered too vague by the International Bureau - Rule 13(2)(b) of the Common Regulations); custom assay development (terms considered too vague by the International Bureau - Rule 13(2)(b) of the Common Regulations); research and development of chemicals, pharmaceuticals, biologics, vaccines and medical devices; scientific testing of chemicals, pharmaceuticals, biologics, vaccines, and medical devices; biopharmaceutical research design and scientific testing services; product safety testing for pharmaceuticals, biopharmaceuticals, chemicals, medical devices, vaccines, and biologics; toxicological safety testing services for pharmaceuticals, chemicals, and consumer products.

Abrégé

Conjugated molecules are prepared that comprise a predetermined number of oligo conjugation components. The conjugated molecules also may comprise one or more detectable labels. Preparation of these molecules can be implemented according to an asymmetric or a symmetric conjugation strategy.

Classes IPC  ?

• C07H 21/00 - Composés contenant au moins deux unités mononucléotide comportant chacune des groupes phosphate ou polyphosphate distincts liés aux radicaux saccharide des groupes nucléoside, p. ex. acides nucléiques
• C12P 19/34 - Polynucléotides, p. ex. acides nucléiques, oligoribonucléotides

Abrégé

Provided are nucleic acid translators capable of carrying out logic operations with improved efficiency, maximized output and reduced off-target effects, in particular in a biological system. Methods of using these translators to transduce signal are also provided.

Classes IPC  ?

• C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques
• C07H 21/00 - Composés contenant au moins deux unités mononucléotide comportant chacune des groupes phosphate ou polyphosphate distincts liés aux radicaux saccharide des groupes nucléoside, p. ex. acides nucléiques
• C12N 5/10 - Cellules modifiées par l'introduction de matériel génétique étranger, p. ex. cellules transformées par des virus
• G06F 19/20 - pour l'hybridation ou l'expression génique, p.ex. microréseaux, séquençage par hybridation, normalisation, profilage, modèles de correction de bruit, estimation du ratio d'expression, conception ou optimisation de sonde

Abrégé

An approach to designing a polynucleotide probe to hybridize selectively to a target polynucleotide sequence involves calculating the final concentration of the intended binding product between a candidate probe and the target sequence. The calculation takes into consideration the binding reaction between the candidate probe and the target fragment on the target sequence, as well as various other binding reactions, involving either the probe or the target fragment, that interfere with the intended binding reaction. In contrast to the conventional technology, which attempts to determine the entire structure of the target polynucleotide, this approach only needs to determine the binding dynamics that impact on the intended probe-target fragment binding. The approach does not require determination of the structure of the involved sequences.

Classes IPC  ?

• C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques
• C12N 15/11 - Fragments d'ADN ou d'ARNLeurs formes modifiées
• G01N 33/53 - Tests immunologiquesTests faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiquesMatériaux à cet effet

Abrégé

A method for improving a nucleic acid-based molecular computing system includes (A) identifying a computing system comprised of (i) a nucleic acid structure that includes an incompletely base-paired duplex domain, (ii) at least one polynucleotide displacement molecule that can bind with the nucleic acid structure under hybridizing conditions, such that the nucleic acid structure undergoes a transition in energy state due to a branch migration reaction involving the duplex domain, and (iii) a clashing polynucleotide molecule that competes with the polynucleotide displacement molecule for binding the nucleic acid structure under the hybridizing conditions but that cannot produce a branch migration reaction involving the duplex domain; then (B) reconfiguring at least one of the displacement molecule and the nucleic acid structure, respectively, to incorporate a chemical modification relative to a first reference molecule that comprises natural nucleosides and has the same sequence content as the displacement molecule or the nucleic acid structure, as the case may be, wherein the modification causes binding of the displacement molecule and the nucleic acid structure to have a hybridization free energy, differing from that of a first reference binding between the displacement molecule or the nucleic acid structure and the first reference molecule, such that the branch migration reaction is facilitated relative to the first reference binding; and/or (C) reconfiguring at least one of the clashing molecule and the nucleic acid structure, respectively, to incorporate a chemical modification relative to a second reference molecule that comprises natural nucleosides and has the same sequence content as the clashing molecule or the nucleic acid structure, as the case may be. The modification effected via such reconfiguring causes binding of the clashing molecule and the nucleic acid structure to have a hybridization free energy, differing from that of a second reference binding between the clashing molecule or the nucleic acid structure and the second reference molecule, such that binding of the clashing molecule is impeded relative to the second reference binding.

Classes IPC  ?

• G06F 19/10 - Bio-informatique, c. à d. procédés ou systèmes pour le traitement de données génétiques ou se rapportant aux protéines en biologie moléculaire informatique (procédés in silico de criblage de bibliothèques chimiques virtuelles C40B 30/02;procédés mathématiques ou in silicio de création de bibliothèques chimiques virtuelles C40B 50/02)