Abrégé

Aspects of the present invention relate to the use the growth factors such as e.g., cytokines IL-2 and IL-12 for T-cell activation whereby the growth factor(s) is/are expressed by cells comprising synthetic chromosomes. The growth factor(s) is/are desirably under controllable expression from a synthetic chromosome. By approaches described herein, one can control an immune response to treat or inhibit a disease such as a cancer. The control may be provided by inducing expression of the growth factor(s), wherein expression level(s) can be fine-tuned. If more than one growth factor is expressed, the levels can be individually controlled so that the desired concentrations of each growth factor are obtained.

Classes IPC  ?

• A61K 35/17 - LymphocytesLymphocytes BLymphocytes TCellules tueuses naturellesLymphocytes activés par un interféron ou une cytokine
• A61K 39/00 - Préparations médicinales contenant des antigènes ou des anticorps
• C07K 14/54 - Interleukines [IL]
• C07K 14/55 - IL-2
• C12N 5/0783 - Cellules TCellules NKProgéniteurs de cellules T ou NK
• C12N 15/11 - Fragments d'ADN ou d'ARNLeurs formes modifiées

Abrégé

Use of one or more markers to identify and sort cells that have been engineered to comprise a synthetic chromosome encoding the marker(s), with said cells expressing said marker(s) encoded on the synthetic chromosome. The marker is typically but not limited to a cluster of differentiation (CD), wherein the CD has been truncated or otherwise modified so that the biological function of the CD is lost or remarkably reduced. The modified CD is typically used to sort cells to obtain a desired population of cells containing the synthetic chromosome, or i) to ensure that a cell population administered to a subject, e.g., suffering from cancer, reaches the target tissue, ii) to ensure that a cell population administered to a subject,e.g., suffering from cancer, stays at the desired site within the body of the subject during a treatment regimen, iii) to make it possible to turn on a kill switch comprised in the synthetic chromosomes of the cells of the cell population if the cell population is present at undesired sites in the body, or iv) to use as a diagnostic tool.

Classes IPC  ?

• C12N 15/85 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes eucaryotes pour cellules animales
• C12N 5/071 - Cellules ou tissus de vertébrés, p. ex. cellules humaines ou tissus humains
• C12N 5/074 - Cellules souches adultes
• C12N 5/078 - Cellules du sang ou du système immunitaire
• C12Q 1/6897 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques faisant intervenir des gènes rapporteurs liés de façon fonctionnelle à des promoteurs
• A61K 48/00 - Préparations médicinales contenant du matériel génétique qui est introduit dans des cellules du corps vivant pour traiter des maladies génétiquesThérapie génique
• C12N 5/10 - Cellules modifiées par l'introduction de matériel génétique étranger, p. ex. cellules transformées par des virus

Abrégé

Aspects of the present invention relate to the use of chemokine receptors such as e.g., CCR4 and CCR6, as homing agents. The chemokine receptor(s) is/are expressed by cells containing synthetic chromosomes. The chemokine receptor(s) is/are under controllable expression from a synthetic chromosome and can be used to control an immune response so as to treat or inhibit a disease such as cancer. The control is provided by inducing leukocyte trafficking to sites of disease. If more than one chemokine receptor is expressed, the levels can be individually controlled so that the desired cellular trafficking pattern can be obtained.

Classes IPC  ?

• A61K 38/19 - CytokinesLymphokinesInterférons
• C12N 5/074 - Cellules souches adultes
• C12N 5/0775 - Cellules souches mésenchymateusesCellules souches dérivées du tissu adipeux
• C12Q 1/6897 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques faisant intervenir des gènes rapporteurs liés de façon fonctionnelle à des promoteurs
• A61K 48/00 - Préparations médicinales contenant du matériel génétique qui est introduit dans des cellules du corps vivant pour traiter des maladies génétiquesThérapie génique
• C12N 9/10 - Transférases (2.)
• C12N 15/85 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes eucaryotes pour cellules animales

Abrégé

The risk with introducing manipulated T-cell is unforeseen adverse events. During the development of chimeric antigen receptor (CAR) T-cell therapies almost all clinical trial has shown some adverse events ranging from cytokine mediated toxicities to tissue damage and death. By the present invention, we aim to induce multiple layers of safety checkpoints. As a last resort we will be able to induce suicide in all cells which we have introduced to the body. Here we describe the scientific background to the parts of our suicide switch and the details regarding the proteins which are included. Safety switches are being tested on CAR-T cells, but they have a few drawbacks. Due to the limited space on the CAR vector, there is only room for one gene switch. Presently the results show they induce apoptosis in around 70-90% of cells, while the desired target is for all cells to be removed from the tissue. By utilising the space available on a synthetic chromosome, we can include multiple genes under Tet operons which allow us to turn multiple genes on/off. Life or death of a cell depends on the balance of the pro and anti-apoptotic proteins. The scale is always shifting a bit back and forth but only when tipped completely over the apoptotic cascade is initiated. By fine tuning the balance we aim to ensure that the hSync carrying cells have a survival advantage in the tumour in the absence of inducing agent. On the other hand, the moment that agent is administrated the cells will undergo apoptosis and express "find me" and "eat me" markers making sure they are removed without risk of tissue damage. The present invention encompasses compositions and methods for use in cellular gene therapeutics using a modular approach to genetically engineer cells to carry a synthetic chromosome having a regulatable system including one or more safety switches.

Classes IPC  ?

• A61K 48/00 - Préparations médicinales contenant du matériel génétique qui est introduit dans des cellules du corps vivant pour traiter des maladies génétiquesThérapie génique
• C12N 5/074 - Cellules souches adultes
• C12Q 1/6897 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques faisant intervenir des gènes rapporteurs liés de façon fonctionnelle à des promoteurs
• C12N 9/10 - Transférases (2.)
• C12N 15/85 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes eucaryotes pour cellules animales

Abrégé

Aspects of the present invention relate to synthetic chromosomes that may be incorporated into leukocytes, wherein the synthetic chromosomes comprise nucleic acid sequences encoding multiple Chimeric Antigen Receptors (CARs). Such manipulated leukocytes can be used in medicine, notably in the treatment of a cancer such as in the treatment of cancer having solid tumors. The leukocytes may be lymphocytes, including tumor-infiltrating lymphocytes, T cells, NK cells or B cells. In a preferred aspect, the leucocytes are syngeneic and T cells.

Classes IPC  ?

• A61K 35/17 - LymphocytesLymphocytes BLymphocytes TCellules tueuses naturellesLymphocytes activés par un interféron ou une cytokine
• C12N 5/074 - Cellules souches adultes
• C12N 5/0775 - Cellules souches mésenchymateusesCellules souches dérivées du tissu adipeux
• C12N 5/0783 - Cellules TCellules NKProgéniteurs de cellules T ou NK
• C12Q 1/6897 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques faisant intervenir des gènes rapporteurs liés de façon fonctionnelle à des promoteurs
• A61K 38/19 - CytokinesLymphokinesInterférons
• A61K 48/00 - Préparations médicinales contenant du matériel génétique qui est introduit dans des cellules du corps vivant pour traiter des maladies génétiquesThérapie génique
• A61P 35/04 - Agents anticancéreux spécifiques pour le traitement des métastases
• C12N 9/10 - Transférases (2.)
• C12N 15/85 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes eucaryotes pour cellules animales

Abrégé

Use of one or more markers to identify and sort cells that have been engineered to comprise a synthetic chromosome encoding the marker(s), with said cells expressing said marker(s) encoded on the synthetic chromosome. The marker is typically but not limited to a cluster of differentiation (CD), wherein the CD has been truncated or otherwise modified so that the biological function of the CD is lost or remarkably reduced. The modified CD is typically used to sort cells to obtain a desired population of cells containing the synthetic chromosome, or i) to ensure that a cell population administered to a subject, e.g., suffering from cancer, reaches the target tissue, ii) to ensure that a cell population administered to a subject,e.g., suffering from cancer, stays at the desired site within the body of the subject during a treatment regimen, iii) to make it possible to turn on a kill switch comprised in the synthetic chromosomes of the cells of the cell population if the cell population is present at undesired sites in the body, or iv) to use as a diagnostic tool.

Classes IPC  ?

• A61K 48/00 - Préparations médicinales contenant du matériel génétique qui est introduit dans des cellules du corps vivant pour traiter des maladies génétiquesThérapie génique
• C12N 9/10 - Transférases (2.)
• C12N 15/85 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes eucaryotes pour cellules animales
• C12N 5/074 - Cellules souches adultes
• C12Q 1/6897 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques faisant intervenir des gènes rapporteurs liés de façon fonctionnelle à des promoteurs
• A61K 38/19 - CytokinesLymphokinesInterférons
• C12N 5/0775 - Cellules souches mésenchymateusesCellules souches dérivées du tissu adipeux

Abrégé

Aspects of the present invention relate to synthetic chromosomes that may be incorporated into leukocytes, wherein the synthetic chromosomes comprise nucleic acid sequences encoding multiple Chimeric Antigen Receptors (CARs). Such manipulated leukocytes can be used in medicine, notably in the treatment of a cancer such as in the treatment of cancer having solid tumors. The leukocytes may be lymphocytes, including tumor-infiltrating lymphocytes, T cells, NK cells or B cells. In a preferred aspect, the leucocytes are syngeneic and T cells.

Classes IPC  ?

• A61K 48/00 - Préparations médicinales contenant du matériel génétique qui est introduit dans des cellules du corps vivant pour traiter des maladies génétiquesThérapie génique
• C12N 9/10 - Transférases (2.)
• C12N 15/85 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes eucaryotes pour cellules animales
• C12N 5/074 - Cellules souches adultes
• C12Q 1/6897 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques faisant intervenir des gènes rapporteurs liés de façon fonctionnelle à des promoteurs
• A61K 38/19 - CytokinesLymphokinesInterférons
• C12N 5/0775 - Cellules souches mésenchymateusesCellules souches dérivées du tissu adipeux
• A61K 35/17 - LymphocytesLymphocytes BLymphocytes TCellules tueuses naturellesLymphocytes activés par un interféron ou une cytokine
• A61P 35/04 - Agents anticancéreux spécifiques pour le traitement des métastases
• C12N 5/0783 - Cellules TCellules NKProgéniteurs de cellules T ou NK

Abrégé

The risk with introducing manipulated T-cell is unforeseen adverse events. During the development of chimeric antigen receptor (CAR) T-cell therapies almost all clinical trial has shown some adverse events ranging from cytokine mediated toxicities to tissue damage and death. By the present invention, we aim to induce multiple layers of safety checkpoints. As a last resort we will be able to induce suicide in all cells which we have introduced to the body. Here we describe the scientific background to the parts of our suicide switch and the details regarding the proteins which are included. Safety switches are being tested on CAR-T cells, but they have a few drawbacks. Due to the limited space on the CAR vector, there is only room for one gene switch. Presently the results show they induce apoptosis in around 70-90% of cells, while the desired target is for all cells to be removed from the tissue. By utilising the space available on a synthetic chromosome, we can include multiple genes under Tet operons which allow us to turn multiple genes on/off. Life or death of a cell depends on the balance of the pro and anti-apoptotic proteins. The scale is always shifting a bit back and forth but only when tipped completely over the apoptotic cascade is initiated. By fine tuning the balance we aim to ensure that the hSync carrying cells have a survival advantage in the tumour in the absence of inducing agent. On the other hand, the moment that agent is administrated the cells will undergo apoptosis and express "find me" and "eat me" markers making sure they are removed without risk of tissue damage. The present invention encompasses compositions and methods for use in cellular gene therapeutics using a modular approach to genetically engineer cells to carry a synthetic chromosome having a regulatable system including one or more safety switches.

Classes IPC  ?

• A61K 48/00 - Préparations médicinales contenant du matériel génétique qui est introduit dans des cellules du corps vivant pour traiter des maladies génétiquesThérapie génique
• C12N 9/10 - Transférases (2.)
• C12N 15/85 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes eucaryotes pour cellules animales
• C12N 5/074 - Cellules souches adultes
• C12Q 1/6897 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques faisant intervenir des gènes rapporteurs liés de façon fonctionnelle à des promoteurs

Abrégé

Aspects of the present invention relate to the use the growth factors such as e.g., cytokines IL-2 and IL-12 for T-cell activation whereby the growth factor(s) is/are expressed by cells comprising synthetic chromosomes. The growth factor(s) is/are desirably under controllable expression from a synthetic chromosome. By approaches described herein, one can control an immune response to treat or inhibit a disease such as a cancer. The control may be provided by inducing expression of the growth factor(s), wherein expression level(s) can be fine-tuned. If more than one growth factor is expressed, the levels can be individually controlled so that the desired concentrations of each growth factor are obtained.

Classes IPC  ?

• A61K 38/19 - CytokinesLymphokinesInterférons
• C12N 5/074 - Cellules souches adultes
• C12N 5/0775 - Cellules souches mésenchymateusesCellules souches dérivées du tissu adipeux
• C12Q 1/6897 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques faisant intervenir des gènes rapporteurs liés de façon fonctionnelle à des promoteurs
• A61K 48/00 - Préparations médicinales contenant du matériel génétique qui est introduit dans des cellules du corps vivant pour traiter des maladies génétiquesThérapie génique
• A61P 35/00 - Agents anticancéreux
• C07K 14/54 - Interleukines [IL]
• C07K 14/55 - IL-2
• C12N 9/10 - Transférases (2.)
• C12N 15/85 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes eucaryotes pour cellules animales

Abrégé

Aspects of the present invention relate to the use the growth factors such as e.g., cytokines IL-2 and IL-12 for T-cell activation whereby the growth factor(s) is/are expressed by cells comprising synthetic chromosomes. The growth factor(s) is/are desirably under controllable expression from a synthetic chromosome. By approaches described herein, one can control an immune response to treat or inhibit a disease such as a cancer. The control may be provided by inducing expression of the growth factor(s), wherein expression level(s) can be fine-tuned. If more than one growth factor is expressed, the levels can be individually controlled so that the desired concentrations of each growth factor are obtained.

Classes IPC  ?

• A61K 48/00 - Préparations médicinales contenant du matériel génétique qui est introduit dans des cellules du corps vivant pour traiter des maladies génétiquesThérapie génique
• C12N 9/10 - Transférases (2.)
• C12N 15/85 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes eucaryotes pour cellules animales
• C12N 5/074 - Cellules souches adultes
• C12Q 1/6897 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques faisant intervenir des gènes rapporteurs liés de façon fonctionnelle à des promoteurs
• A61K 38/19 - CytokinesLymphokinesInterférons
• C12N 5/0775 - Cellules souches mésenchymateusesCellules souches dérivées du tissu adipeux
• A61P 35/00 - Agents anticancéreux
• C07K 14/54 - Interleukines [IL]
• C07K 14/55 - IL-2

Abrégé

Aspects of the present invention relate to the use of chemokine receptors such as e.g., CCR4 and CCR6, as homing agents. The chemokine receptor(s) is/are expressed by cells containing synthetic chromosomes. The chemokine receptor(s) is/are under controllable expression from a synthetic chromosome and can be used to control an immune response so as to treat or inhibit a disease such as cancer. The control is provided by inducing leukocyte trafficking to sites of disease. If more than one chemokine receptor is expressed, the levels can be individually controlled so that the desired cellular trafficking pattern can be obtained.

Classes IPC  ?

• A61K 48/00 - Préparations médicinales contenant du matériel génétique qui est introduit dans des cellules du corps vivant pour traiter des maladies génétiquesThérapie génique
• C12N 9/10 - Transférases (2.)
• C12N 15/85 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes eucaryotes pour cellules animales
• C12N 5/074 - Cellules souches adultes
• C12Q 1/6897 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques faisant intervenir des gènes rapporteurs liés de façon fonctionnelle à des promoteurs
• A61K 38/19 - CytokinesLymphokinesInterférons
• C12N 5/0775 - Cellules souches mésenchymateusesCellules souches dérivées du tissu adipeux

Abrégé

The present invention encompasses compositions and methods to allow one to deliver and express multiple genes from a biosynthetic pathway in a recipient cell via a synthetic chromosome.

Classes IPC  ?

• C12N 15/81 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes eucaryotes pour champignons pour levures
• C12N 15/85 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes eucaryotes pour cellules animales

Abrégé

The present invention provides a novel method for targeted integration of nucleic acids onto an autonomously replicating nucleic acid using site-directed recombination that allows for sequential loading of multiple delivery vectors using a single selectable marker.

Classes IPC  ?

• C12N 15/64 - Méthodes générales pour la préparation du vecteur, pour son introduction dans la cellule ou pour la sélection de l'hôte contenant le vecteur
• C12N 15/65 - Introduction de matériel génétique étranger utilisant des vecteursVecteurs Utilisation d'hôtes pour ceux-ciRégulation de l'expression utilisant des marqueurs
• C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes
• C12N 15/11 - Fragments d'ADN ou d'ARNLeurs formes modifiées

Abrégé

The present invention encompasses compositions and methods to create a whole chromosome regulatable “kill” switch to inactivate expression of one or more therapeutic genes expressed from a synthetic chromosome.

Classes IPC  ?

• C12N 15/85 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes eucaryotes pour cellules animales
• C12N 9/10 - Transférases (2.)
• A61K 48/00 - Préparations médicinales contenant du matériel génétique qui est introduit dans des cellules du corps vivant pour traiter des maladies génétiquesThérapie génique

Abrégé

The field of the invention encompasses synthetic chromosome compositions and methods that allow single cell spatiotemporal analysis in response to differentiation cues and labeling of transplanted cells to monitor the fate and function of such cells in the patient recipient.

Classes IPC  ?

• C07H 21/04 - Composés contenant au moins deux unités mononucléotide comportant chacune des groupes phosphate ou polyphosphate distincts liés aux radicaux saccharide des groupes nucléoside, p. ex. acides nucléiques avec le désoxyribosyle comme radical saccharide
• C12Q 1/6897 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques faisant intervenir des gènes rapporteurs liés de façon fonctionnelle à des promoteurs
• C12N 5/0735 - Cellules souches embryonnairesCellules germinales embryonnaires
• C12N 15/85 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes eucaryotes pour cellules animales
• C12N 5/074 - Cellules souches adultes
• C07K 1/13 - Marquage de peptides