Ncan Genomics, Inc.

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        États-Unis 25
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2024 décembre 2
2024 novembre 5
2024 10
2022 6
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Classe IPC
C12Q 1/6869 - Méthodes de séquençage 25
C12Q 1/6855 - Adaptateurs ligaturés 14
C12Q 1/6806 - Préparation d’acides nucléiques pour analyse, p. ex. pour test de réaction en chaîne par polymérase [PCR] 10
C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques 8
C12Q 1/6876 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes 8
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Statut
En Instance 17
Enregistré / En vigueur 12
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1.

LINKED TARGET CAPTURE

      
Numéro d'application 18827961
Statut En instance
Date de dépôt 2024-09-09
Date de la première publication 2024-12-26
Propriétaire NCAN Genomics, Inc. (Canada)
Inventeur(s)
  • Pel, Joel
  • Marziali, Andrea

Abrégé

The invention generally relates to sequencing library preparation methods. In certain embodiments, two or more template nucleic acids are joined together by a linking molecule, such as a PEG derivative. Identical copies of a nucleic acid fragment or both strands of a duplex fragment may be linked together. The linked nucleic acids are amplified, creating linked amplicons. Emulsion PCR with linked primers creates linked template nucleic acids for seeding sequencing clusters and errors can be readily identified by their presence on only one of the linked fragments.

Classes IPC  ?

2.

LINKED TARGET CAPTURE

      
Numéro d'application 18827964
Statut En instance
Date de dépôt 2024-09-09
Date de la première publication 2024-12-26
Propriétaire NCAN Genomics, Inc. (Canada)
Inventeur(s)
  • Pel, Joel
  • Marziali, Andrea

Abrégé

The invention generally relates to sequencing library preparation methods. In certain embodiments, two or more template nucleic acids are joined together by a linking molecule, such as a PEG derivative. Identical copies of a nucleic acid fragment or both strands of a duplex fragment may be linked together. The linked nucleic acids are amplified, creating linked amplicons. Emulsion PCR with linked primers creates linked template nucleic acids for seeding sequencing clusters and errors can be readily identified by their presence on only one of the linked fragments.

Classes IPC  ?

3.

METHODS OF SEQUENCING LINKED FRAGMENTS

      
Numéro d'application 18791671
Statut En instance
Date de dépôt 2024-08-01
Date de la première publication 2024-11-28
Propriétaire NCAN Genomics, Inc. (Canada)
Inventeur(s)
  • Despotovic, Milenko
  • Pel, Joel
  • Marziali, Andrea

Abrégé

The invention generally relates to sequencing library preparation methods. In certain embodiments, two template nucleic acids are joined together by a linking molecule, such as a PEG derivative. The linked template nucleic acids is amplified, creating linked amplicons.

Classes IPC  ?

4.

METHODS OF SEQUENCING LINKED FRAGMENTS

      
Numéro d'application 18791664
Statut En instance
Date de dépôt 2024-08-01
Date de la première publication 2024-11-28
Propriétaire NCAN Genomics, Inc. (Canada)
Inventeur(s)
  • Despotovic, Milenko
  • Pel, Joel
  • Marziali, Andrea

Abrégé

The invention generally relates to sequencing library preparation methods. In certain embodiments, two template nucleic acids are joined together by a linking molecule, such as a PEG derivative. The linked template nucleic acids is amplified, creating linked amplicons.

Classes IPC  ?

5.

LINKED TARGET CAPTURE AND LIGATION

      
Numéro d'application 18785811
Statut En instance
Date de dépôt 2024-07-26
Date de la première publication 2024-11-21
Propriétaire NCAN Genomics, Inc. (Canada)
Inventeur(s)
  • Pel, Joel
  • Marziali, Andrea

Abrégé

The invention generally relates to capturing, amplifying, and sequencing nucleic acids. In certain embodiments, linked capture probes and multiple binding and extension steps improve specificity over traditional single binding target capture techniques. Methods of seeding sequencing clusters with captured target nucleic acids are also disclosed. Linked adapters may be used to increase adapter ligation selectively or efficiency and yield. Ligation adapters and primers can be linked to various sequence-specific or feature-specific molecules to selectively bind targets for ligation or amplification with universal adapters or primers.

Classes IPC  ?

6.

LINKED TARGET CAPTURE

      
Numéro d'application 18791679
Statut En instance
Date de dépôt 2024-08-01
Date de la première publication 2024-11-21
Propriétaire NCAN Genomics, Inc. (Canada)
Inventeur(s)
  • Pel, Joel
  • Marziali, Andrea

Abrégé

The invention generally relates to sequencing library preparation methods. In certain embodiments, two or more template nucleic acids are joined together by a linking molecule, such as a PEG derivative. Identical copies of a nucleic acid fragment or both strands of a duplex fragment may be linked together. The linked nucleic acids are amplified, creating linked amplicons. Emulsion PCR with linked primers creates linked template nucleic acids for seeding sequencing clusters and errors can be readily identified by their presence on only one of the linked fragments.

Classes IPC  ?

7.

LINKED TARGET CAPTURE

      
Numéro d'application 18791675
Statut En instance
Date de dépôt 2024-08-01
Date de la première publication 2024-11-21
Propriétaire NCAN Genomics, Inc. (Canada)
Inventeur(s)
  • Pel, Joel
  • Marziali, Andrea

Abrégé

The invention generally relates to sequencing library preparation methods. In certain embodiments, two or more template nucleic acids are joined together by a linking molecule, such as a PEG derivative. Identical copies of a nucleic acid fragment or both strands of a duplex fragment may be linked together. The linked nucleic acids are amplified, creating linked amplicons. Emulsion PCR with linked primers creates linked template nucleic acids for seeding sequencing clusters and errors can be readily identified by their presence on only one of the linked fragments.

Classes IPC  ?

8.

LINKED TARGET CAPTURE

      
Numéro d'application 18443715
Statut En instance
Date de dépôt 2024-02-16
Date de la première publication 2024-07-25
Propriétaire NCAN Genomics, Inc. (Canada)
Inventeur(s)
  • Pel, Joel
  • Marziali, Andrea

Abrégé

The invention generally relates to sequencing library preparation methods. In certain embodiments, two or more template nucleic acids are joined together by a linking molecule, such as a PEG derivative. Identical copies of a nucleic acid fragment or both strands of a duplex fragment may be linked together. The linked nucleic acids are amplified, creating linked amplicons. Emulsion PCR with linked primers creates linked template nucleic acids for seeding sequencing clusters and errors can be readily identified by their presence on only one of the linked fragments.

Classes IPC  ?

9.

LINKED LIGATION

      
Numéro d'application 18488255
Statut En instance
Date de dépôt 2023-10-17
Date de la première publication 2024-02-15
Propriétaire NCAN Genomics, Inc. (Canada)
Inventeur(s)
  • Marziali, Andrea
  • Pel, Joel

Abrégé

The invention generally relates to capturing, amplifying, and sequencing nucleic acids. In certain embodiments, copies of the sense and antisense strands of a duplex template nucleic acid are captured using linked capture probes and multiple binding and extension steps to improve specificity over traditional single binding target capture techniques. Methods of seeding sequencing clusters with sense and antisense strands of a target nucleic acid are also disclosed including identifying the strands using sense-specific barcodes and confirming base calls using two sense-specific sequencing reads. Linked adapters may be used to increase adapter ligation selectively or efficiency and yield.

Classes IPC  ?

  • C12Q 1/6827 - Tests d’hybridation pour la détection de mutation ou de polymorphisme
  • C12Q 1/6806 - Préparation d’acides nucléiques pour analyse, p. ex. pour test de réaction en chaîne par polymérase [PCR]
  • C12Q 1/6855 - Adaptateurs ligaturés
  • C12Q 1/686 - Réaction en chaine par polymérase [PCR]
  • C12Q 1/6869 - Méthodes de séquençage
  • C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques

10.

METHODS OF SEQUENCING WITH LINKED FRAGMENTS

      
Numéro d'application 18489381
Statut En instance
Date de dépôt 2023-10-18
Date de la première publication 2024-02-08
Propriétaire NCAN Genomics, Inc. (Canada)
Inventeur(s)
  • Despotovic, Milenko
  • Pel, Joel
  • Marziali, Andrea

Abrégé

The invention generally relates to sequencing library preparation methods. In certain embodiments, two template nucleic acids are joined together by a linking molecule, such as a PEG derivative. The linked template nucleic acids is amplified, creating linked amplicons.

Classes IPC  ?

11.

LINKED TARGET CAPTURE

      
Numéro d'application 17842113
Statut En instance
Date de dépôt 2022-06-16
Date de la première publication 2022-10-27
Propriétaire NCAN Genomics, Inc. (Canada)
Inventeur(s)
  • Pel, Joel
  • Marziali, Andrea

Abrégé

The invention generally relates to sequencing library preparation methods. In certain embodiments, two or more template nucleic acids are joined together by a linking molecule, such as a PEG derivative. Identical copies of a nucleic acid fragment or both strands of a duplex fragment may be linked together. The linked nucleic acids are amplified, creating linked amplicons. Emulsion PCR with linked primers creates linked template nucleic acids for seeding sequencing clusters and errors can be readily identified by their presence on only one of the linked fragments.

Classes IPC  ?

  • C12Q 1/6869 - Méthodes de séquençage
  • C12Q 1/6806 - Préparation d’acides nucléiques pour analyse, p. ex. pour test de réaction en chaîne par polymérase [PCR]
  • C12Q 1/6855 - Adaptateurs ligaturés
  • C12Q 1/6876 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes

12.

ENHANCED LINKED TARGET CAPTURE

      
Numéro de document 03216064
Statut En instance
Date de dépôt 2022-04-05
Date de disponibilité au public 2022-10-13
Propriétaire NCAN GENOMICS, INC. (Canada)
Inventeur(s)
  • Marziali, Andrea
  • Pel, Joel

Abrégé

The invention generally relates to using linked target capture probes to profile the adaptive immune system of a subject, detect pathogens, perform spatial sequencing, and isolate mutant sequences.

Classes IPC  ?

  • C12Q 1/6806 - Préparation d’acides nucléiques pour analyse, p. ex. pour test de réaction en chaîne par polymérase [PCR]
  • C12Q 1/6844 - Réactions d’amplification d’acides nucléiques
  • C12Q 1/6848 - Réactions d’amplification d’acides nucléiques caracterisées par les moyens d’empêcher la contamination ou d’augmenter la spécificité ou la sensibilité d’une réaction d’amplification
  • C12Q 1/6869 - Méthodes de séquençage
  • C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques

13.

ENHANCED LINKED TARGET CAPTURE

      
Numéro d'application 17713690
Statut En instance
Date de dépôt 2022-04-05
Date de la première publication 2022-10-06
Propriétaire NCAN Genomics, Inc. (Canada)
Inventeur(s)
  • Pel, Joel
  • Marziali, Andrea

Abrégé

The invention generally relates to using linked target capture probes to profile the adaptive immune system of a subject, detect pathogens, perform spatial sequencing, and isolate mutant sequences.

Classes IPC  ?

  • C12Q 1/6827 - Tests d’hybridation pour la détection de mutation ou de polymorphisme
  • C12Q 1/6876 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes
  • C12Q 1/6855 - Adaptateurs ligaturés

14.

LINKED TARGET CAPTURE

      
Numéro d'application 17614746
Statut En instance
Date de dépôt 2020-06-10
Date de la première publication 2022-07-21
Propriétaire NCAN Genomics, Inc. (Canada)
Inventeur(s)
  • Pel, Joel
  • Marziali, Andrea

Abrégé

The invention generally relates to using linked target capture probes to evaluate genome editing efficiency and specificity.

Classes IPC  ?

  • C12Q 1/6855 - Adaptateurs ligaturés
  • C12Q 1/6876 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes
  • C12Q 1/6806 - Préparation d’acides nucléiques pour analyse, p. ex. pour test de réaction en chaîne par polymérase [PCR]
  • C12N 9/22 - Ribonucléases
  • C12N 15/11 - Fragments d'ADN ou d'ARNLeurs formes modifiées

15.

Linked ligation

      
Numéro d'application 17688220
Numéro de brevet 11879151
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2022-03-07
Date de la première publication 2022-06-16
Date d'octroi 2024-01-23
Propriétaire NCAN GENOMICS, INC. (Canada)
Inventeur(s)
  • Marziali, Andrea
  • Pel, Joel

Abrégé

The invention generally relates to capturing, amplifying, and sequencing nucleic acids. In certain embodiments, copies of the sense and antisense strands of a duplex template nucleic acid are captured using linked capture probes and multiple binding and extension steps to improve specificity over traditional single binding target capture techniques. Methods of seeding sequencing clusters with sense and antisense strands of a target nucleic acid are also disclosed including identifying the strands using sense-specific barcodes and confirming base calls using two sense-specific sequencing reads. Linked adapters may be used to increase adapter ligation selectively or efficiency and yield.

Classes IPC  ?

  • C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques
  • C12Q 1/6827 - Tests d’hybridation pour la détection de mutation ou de polymorphisme
  • C12Q 1/6806 - Préparation d’acides nucléiques pour analyse, p. ex. pour test de réaction en chaîne par polymérase [PCR]
  • C12Q 1/6855 - Adaptateurs ligaturés
  • C12Q 1/686 - Réaction en chaine par polymérase [PCR]
  • C12Q 1/6869 - Méthodes de séquençage

16.

Linked target capture

      
Numéro d'application 17417995
Numéro de brevet 11473136
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2020-01-03
Date de la première publication 2022-03-17
Date d'octroi 2022-10-18
Propriétaire NCAN Genomics, Inc. (Canada)
Inventeur(s)
  • Pel, Joel
  • Marziali, Andrea

Abrégé

The invention generally relates to sequencing library preparation methods. In certain embodiments, two or more template nucleic acids are joined together by a linking molecule, such as a PEG derivative. Identical copies of a nucleic acid fragment or both strands of a duplex fragment may be linked together. The linked nucleic acids are amplified, creating linked amplicons. Emulsion PCR with linked primers creates linked template nucleic acids for seeding sequencing clusters and errors can be readily identified by their presence on only one of the linked fragments.

Classes IPC  ?

  • C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques
  • C12Q 1/6869 - Méthodes de séquençage
  • C12Q 1/6806 - Préparation d’acides nucléiques pour analyse, p. ex. pour test de réaction en chaîne par polymérase [PCR]
  • C12Q 1/6855 - Adaptateurs ligaturés
  • C12Q 1/6876 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes

17.

Linked target capture

      
Numéro d'application 17178614
Numéro de brevet 11905556
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2021-02-18
Date de la première publication 2021-08-12
Date d'octroi 2024-02-20
Propriétaire NCAN Genomics, Inc. (Canada)
Inventeur(s)
  • Pel, Joel
  • Marziali, Andrea

Abrégé

The invention generally relates to sequencing library preparation methods. In certain embodiments, two or more template nucleic acids are joined together by a linking molecule, such as a PEG derivative. Identical copies of a nucleic acid fragment or both strands of a duplex fragment may be linked together. The linked nucleic acids are amplified, creating linked amplicons. Emulsion PCR with linked primers creates linked template nucleic acids for seeding sequencing clusters and errors can be readily identified by their presence on only one of the linked fragments.

Classes IPC  ?

18.

Linked target capture and ligation

      
Numéro d'application 17269515
Numéro de brevet 12098419
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2019-08-23
Date de la première publication 2021-07-01
Date d'octroi 2024-09-24
Propriétaire NCAN Genomics, Inc. (Canada)
Inventeur(s)
  • Pel, Joel
  • Marziali, Andrea

Abrégé

The invention generally relates to capturing, amplifying, and sequencing nucleic acids. In certain embodiments, linked capture probes and multiple binding and extension steps improve specificity over traditional single binding target capture techniques. Methods of seeding sequencing clusters with captured target nucleic acids are also disclosed. Linked adapters may be used to increase adapter ligation selectively or efficiency and yield. Ligation adapters and primers can be linked to various sequence-specific or feature-specific molecules to selectively bind targets for ligation or amplification with universal adapters or primers.

Classes IPC  ?

19.

Methods of sequencing with linked fragments

      
Numéro d'application 17060853
Numéro de brevet 11827930
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2020-10-01
Date de la première publication 2021-03-25
Date d'octroi 2023-11-28
Propriétaire NCAN Genomics, Inc. (Canada)
Inventeur(s)
  • Despotovic, Milenko
  • Pel, Joel
  • Marziali, Andrea

Abrégé

The invention generally relates to sequencing library preparation methods. In certain embodiments, two template nucleic acids are joined together by a linking molecule, such as a PEG derivative. The linked template nucleic acids is amplified, creating linked amplicons.

Classes IPC  ?

20.

LINKED TARGET CAPTURE

      
Numéro de document 03140171
Statut En instance
Date de dépôt 2020-06-10
Date de disponibilité au public 2020-12-17
Propriétaire NCAN GENOMICS, INC. (Canada)
Inventeur(s)
  • Pel, Joel
  • Marziali, Andrea

Abrégé

The invention generally relates to using linked target capture probes to evaluate genome editing efficiency and specificity.

Classes IPC  ?

  • C12Q 1/6855 - Adaptateurs ligaturés
  • C12Q 1/6809 - Méthodes de détermination ou d’identification des acides nucléiques faisant intervenir la détection différentielle
  • C12Q 1/6869 - Méthodes de séquençage
  • C12Q 1/6876 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes

21.

Linked ligation

      
Numéro d'application 16467870
Numéro de brevet 11268137
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2017-12-07
Date de la première publication 2019-10-03
Date d'octroi 2022-03-08
Propriétaire NCAN GENOMICS, INC. (Canada)
Inventeur(s)
  • Marziali, Andrea
  • Pel, Joel

Abrégé

The invention generally relates to capturing, amplifying, and sequencing nucleic acids. In certain embodiments, copies of the sense and antisense strands of a duplex template nucleic acid are captured using linked capture probes and multiple binding and extension steps to improve specificity over traditional single binding target capture techniques. Methods of seeding sequencing clusters with sense and antisense strands of a target nucleic acid are also disclosed including identifying the strands using sense-specific barcodes and confirming base calls using two sense-specific sequencing reads. Linked adapters may be used to increase adapter ligation selectively or efficiency and yield.

Classes IPC  ?

  • C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques
  • C12Q 1/6827 - Tests d’hybridation pour la détection de mutation ou de polymorphisme
  • C12Q 1/6806 - Préparation d’acides nucléiques pour analyse, p. ex. pour test de réaction en chaîne par polymérase [PCR]
  • C12Q 1/6855 - Adaptateurs ligaturés
  • C12Q 1/686 - Réaction en chaine par polymérase [PCR]
  • C12Q 1/6869 - Méthodes de séquençage

22.

Linked duplex target capture

      
Numéro d'application 16239100
Numéro de brevet 10961573
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2019-01-03
Date de la première publication 2019-08-29
Date d'octroi 2021-03-30
Propriétaire NCAN GENOMICS, INC. (Canada)
Inventeur(s)
  • Pel, Joel
  • Marziali, Andrea

Abrégé

The invention generally relates to sequencing library preparation methods. In certain embodiments, two or more template nucleic acids are joined together by a linking molecule, such as a PEG derivative. Identical copies of a nucleic acid fragment or both strands of a duplex fragment may be linked together. The linked nucleic acids are amplified, creating linked amplicons. Emulsion PCR with linked primers creates linked template nucleic acids for seeding sequencing clusters and errors can be readily identified by their presence on only one of the linked fragments.

Classes IPC  ?

23.

Linked-fragment sequencing

      
Numéro d'application 16088717
Numéro de brevet 11021742
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2017-03-28
Date de la première publication 2019-05-02
Date d'octroi 2021-06-01
Propriétaire NCAN GENOMICS, INC. (Canada)
Inventeur(s)
  • Marziali, Andrea
  • Pel, Joel

Abrégé

The invention generally relates to sequencing library preparation methods. In certain embodiments, two or more template nucleic acids are joined together by a linking molecule, such as a PEG derivative. Identical copies of a nucleic acid fragment or both strands of a duplex fragment may be linked together. The linked nucleic acids are amplified, creating linked amplicons. Emulsion PCR with linked primers creates linked template nucleic acids for seeding sequencing clusters and errors can be readily identified by their presence on only one of the linked fragments.

Classes IPC  ?

  • C12Q 1/6855 - Adaptateurs ligaturés
  • C12Q 1/686 - Réaction en chaine par polymérase [PCR]
  • C12Q 1/6806 - Préparation d’acides nucléiques pour analyse, p. ex. pour test de réaction en chaîne par polymérase [PCR]
  • C12Q 1/6874 - Méthodes de séquençage faisant intervenir des réseaux d’acides nucléiques, p. ex. séquençage par hybridation [SBH]
  • C40B 20/04 - Identification des éléments d'une bibliothèque au moyen d'une étiquette, d'un marqueur ou d'un autre identificateur lisible ou détectable, p. ex. procédés de décodage
  • C12Q 1/6869 - Méthodes de séquençage
  • C12Q 1/6853 - Réactions d’amplification d’acides nucléiques utilisant des amorces ou des matrices modifiées
  • C40B 40/08 - Bibliothèques comprenant de l'ARN ou de l'ADN codant des protéines, p. ex. bibliothèques de gènes
  • C12Q 1/6876 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes
  • C12Q 1/6886 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes pour les maladies provoquées par des altérations du matériel génétique pour le cancer

24.

Droplet-based linked-fragment sequencing

      
Numéro d'application 16088714
Numéro de brevet 10801059
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2017-03-28
Date de la première publication 2019-04-18
Date d'octroi 2020-10-13
Propriétaire NCAN GENOMICS, INC. (Canada)
Inventeur(s)
  • Pel, Joel
  • Marziali, Andrea

Abrégé

The invention generally relates to sequencing library preparation methods. In certain embodiments, two or more template nucleic acids are joined together by a linking molecule, such as a PEG derivative. Identical copies of a nucleic acid fragment or both strands of a duplex fragment may be linked together. The linked nucleic acids are amplified, creating linked amplicons. Emulsion PCR with linked primers creates linked template nucleic acids for seeding sequencing clusters and errors can be readily identified by their presence on only one of the linked fragments.

Classes IPC  ?

  • C12Q 1/6855 - Adaptateurs ligaturés
  • C12Q 1/686 - Réaction en chaine par polymérase [PCR]
  • C12Q 1/6806 - Préparation d’acides nucléiques pour analyse, p. ex. pour test de réaction en chaîne par polymérase [PCR]
  • C12Q 1/6874 - Méthodes de séquençage faisant intervenir des réseaux d’acides nucléiques, p. ex. séquençage par hybridation [SBH]
  • C12Q 1/6876 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes
  • C40B 20/04 - Identification des éléments d'une bibliothèque au moyen d'une étiquette, d'un marqueur ou d'un autre identificateur lisible ou détectable, p. ex. procédés de décodage
  • C12Q 1/6869 - Méthodes de séquençage
  • C12Q 1/6853 - Réactions d’amplification d’acides nucléiques utilisant des amorces ou des matrices modifiées
  • C40B 40/08 - Bibliothèques comprenant de l'ARN ou de l'ADN codant des protéines, p. ex. bibliothèques de gènes

25.

Linked target capture

      
Numéro d'application 16088720
Numéro de brevet 10961568
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2017-03-28
Date de la première publication 2019-04-11
Date d'octroi 2021-03-30
Propriétaire NCAN GENOMICS, INC. (Canada)
Inventeur(s)
  • Pel, Joel
  • Marziali, Andrea

Abrégé

The invention generally relates to sequencing library preparation methods. In certain embodiments, two or more template nucleic acids are joined together by a linking molecule, such as a PEG derivative. Identical copies of a nucleic acid fragment or both strands of a duplex fragment may be linked together. The linked nucleic acids are amplified, creating linked amplicons. Emulsion PCR with linked primers creates linked template nucleic acids for seeding sequencing clusters and errors can be readily identified by their presence on only one of the linked fragments.

Classes IPC  ?

  • C12Q 1/6855 - Adaptateurs ligaturés
  • C12Q 1/686 - Réaction en chaine par polymérase [PCR]
  • C12Q 1/6806 - Préparation d’acides nucléiques pour analyse, p. ex. pour test de réaction en chaîne par polymérase [PCR]
  • C12Q 1/6874 - Méthodes de séquençage faisant intervenir des réseaux d’acides nucléiques, p. ex. séquençage par hybridation [SBH]
  • C40B 20/04 - Identification des éléments d'une bibliothèque au moyen d'une étiquette, d'un marqueur ou d'un autre identificateur lisible ou détectable, p. ex. procédés de décodage
  • C12Q 1/6869 - Méthodes de séquençage
  • C12Q 1/6853 - Réactions d’amplification d’acides nucléiques utilisant des amorces ou des matrices modifiées
  • C12Q 1/6876 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes
  • C40B 40/08 - Bibliothèques comprenant de l'ARN ou de l'ADN codant des protéines, p. ex. bibliothèques de gènes

26.

Methods of sequencing with linked fragments

      
Numéro d'application 16008702
Numéro de brevet 10829813
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2018-06-14
Date de la première publication 2018-10-18
Date d'octroi 2020-11-10
Propriétaire NCAN GENOMICS, INC. (Canada)
Inventeur(s)
  • Despotovic, Milenko
  • Pel, Joel
  • Marziali, Andrea

Abrégé

The invention generally relates to sequencing library preparation methods. In certain embodiments, two template nucleic acids are joined together by a linking molecule, such as a PEG derivative. The linked template nucleic acids is amplified, creating linked amplicons.

Classes IPC  ?

  • C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques
  • C12Q 1/6869 - Méthodes de séquençage

27.

LINKED LIGATION

      
Numéro de document 03048420
Statut En instance
Date de dépôt 2017-12-07
Date de disponibilité au public 2018-06-14
Propriétaire NCAN GENOMICS, INC. (Canada)
Inventeur(s)
  • Marziali, Andrea
  • Pel, Joel

Abrégé

The invention generally relates to capturing, amplifying, and sequencing nucleic acids. In certain embodiments, copies of the sense and antisense strands of a duplex template nucleic acid are captured using linked capture probes and multiple binding and extension steps to improve specificity over traditional single binding target capture techniques. Methods of seeding sequencing clusters with sense and antisense strands of a target nucleic acid are also disclosed including identifying the strands using sense-specific barcodes and confirming base calls using two sense-specific sequencing reads. Linked adapters may be used to increase adapter ligation selectively or efficiency and yield.

Classes IPC  ?

28.

LINKED TARGET CAPTURE

      
Numéro de document 03019367
Statut En instance
Date de dépôt 2017-03-28
Date de disponibilité au public 2017-10-05
Propriétaire NCAN GENOMICS, INC. (Canada)
Inventeur(s)
  • Marziali, Andrea
  • Pel, Joel

Abrégé

The invention generally relates to sequencing library preparation methods. In certain embodiments, two or more template nucleic acids are joined together by a linking molecule, such as a PEG derivative. Identical copies of a nucleic acid fragment or both strands of a duplex fragment may be linked together. The linked nucleic acids are amplified, creating linked amplicons. Emulsion PCR with linked primers creates linked template nucleic acids for seeding sequencing clusters and errors can be readily identified by their presence on only one of the linked fragments.

Classes IPC  ?

  • C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques
  • C07H 21/00 - Composés contenant au moins deux unités mononucléotide comportant chacune des groupes phosphate ou polyphosphate distincts liés aux radicaux saccharide des groupes nucléoside, p. ex. acides nucléiques
  • C12N 15/10 - Procédés pour l'isolement, la préparation ou la purification d'ADN ou d'ARN
  • C12P 19/34 - Polynucléotides, p. ex. acides nucléiques, oligoribonucléotides

29.

Methods of sequencing with linked fragments

      
Numéro d'application 14930227
Numéro de brevet 10000799
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2015-11-02
Date de la première publication 2016-05-05
Date d'octroi 2018-06-19
Propriétaire NCAN GENOMICS, INC. (Canada)
Inventeur(s)
  • Despotovic, Milenko
  • Pel, Joel
  • Marziali, Andrea

Abrégé

The invention generally relates to sequencing library preparation methods. In certain embodiments, two template nucleic acids are joined together by a linking molecule, such as a PEG derivative. The linked template nucleic acids is amplified, creating linked amplicons.

Classes IPC  ?

  • C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques