The present application relates to compounds of Formula (I), as defined herein, and pharmaceutically acceptable salts thereof. The present application also describes pharmaceutical composition comprising a compound of Formula (I), and pharmaceutically acceptable salts thereof, and methods of using the compounds and compositions for treating diseases such as cancer.
The present application relates to EGFR inhibitor compounds of Formula (I), as defined herein, and pharmaceutically acceptable salts thereof. The present application also describes pharmaceutical composition comprising a compound of Formula (I), and pharmaceutically acceptable salts thereof, and methods of using the compounds and compositions for inhibiting certain protein-protein interactions, and for treating cancer.
C07D 241/38 - Composés hétérocycliques contenant des cycles diazine-1,4 ou diazine-1,4 hydrogéné condensés avec des carbocycles ou avec des systèmes carbocycliques avec uniquement des atomes d'hydrogène ou de carbone liés directement aux atomes d'azote du cycle
The present application relates to compounds of Formula (I), as defined herein, and pharmaceutically acceptable salts thereof. The present application also describes pharmaceutical composition comprising a compound of Formula (I), and pharmaceutically acceptable salts thereof, and methods of using the compounds and compositions for inhibiting certain protein-protein interactions, and for treating cancer.
The present application relates to compounds of Formula (I), as defined herein, and pharmaceutically acceptable salts thereof. The present application also describes pharmaceutical composition comprising a compound of Formula (I), and pharmaceutically acceptable salts thereof, and methods of using the compounds and compositions for inhibiting certain protein-protein interactions, and for treating cancer.
A61K 31/5025 - PyridazinesPyridazines hydrogénées condensées en ortho ou en péri avec des systèmes hétérocycliques
A61K 31/5377 - 1,4-Oxazines, p. ex. morpholine non condensées et contenant d'autres hétérocycles, p. ex. timolol
C07D 519/00 - Composés hétérocycliques contenant plusieurs systèmes de plusieurs hétérocycles déterminants condensés entre eux ou condensés avec un système carbocyclique commun non prévus dans les groupes ou
The present application relates to compounds of Formula (I), as defined herein, and pharmaceutically acceptable salts thereof. The present application also describes pharmaceutical composition comprising a compound of Formula (I), and pharmaceutically acceptable salts thereof, and methods of using the compounds and compositions for inhibiting kinase activity, and for treating cancer.
A61K 31/4365 - Composés hétérocycliques ayant l'azote comme hétéro-atome d'un cycle, p. ex. guanéthidine ou rifamycines ayant des cycles à six chaînons avec un azote comme seul hétéro-atome d'un cycle condensés en ortho ou en péri avec des systèmes hétérocycliques le système hétérocyclique ayant le soufre comme hétéro-atome du cycle, p. ex. ticlopidine
A61K 31/4375 - Composés hétérocycliques ayant l'azote comme hétéro-atome d'un cycle, p. ex. guanéthidine ou rifamycines ayant des cycles à six chaînons avec un azote comme seul hétéro-atome d'un cycle condensés en ortho ou en péri avec des systèmes hétérocycliques le système hétérocyclique contenant un cycle à six chaînons ayant l'azote comme hétéro-atome du cycle, p. ex. quinolizines, naphtyridines, berbérine, vincamine
A61K 31/4743 - QuinoléinesIsoquinoléines condensées en ortho ou en péri avec des systèmes hétérocycliques condensées avec des systèmes cycliques ayant le soufre comme hétéro-atome d'un cycle
A61K 31/5377 - 1,4-Oxazines, p. ex. morpholine non condensées et contenant d'autres hétérocycles, p. ex. timolol
Disclosed is a compound represented by formula (I) or a pharmaceutically acceptable salt thereof. Compounds of formula (I) are useful for treating coronavirus infection via inhibition of the protease Mpro.
C07D 401/14 - Composés hétérocycliques contenant plusieurs hétérocycles comportant des atomes d'azote comme uniques hétéro-atomes du cycle, au moins un cycle étant un cycle à six chaînons avec un unique atome d'azote contenant au moins trois hétérocycles
A61K 31/437 - Composés hétérocycliques ayant l'azote comme hétéro-atome d'un cycle, p. ex. guanéthidine ou rifamycines ayant des cycles à six chaînons avec un azote comme seul hétéro-atome d'un cycle condensés en ortho ou en péri avec des systèmes hétérocycliques le système hétérocyclique contenant un cycle à cinq chaînons ayant l'azote comme hétéro-atome du cycle, p. ex. indolizine, bêta-carboline
A61K 31/4985 - Pyrazines ou pipérazines condensées en ortho ou en péri avec des systèmes hétérocycliques
The present application relates to compounds of Formula (I), as defined herein, and pharmaceutically acceptable salts thereof. The present application also describes pharmaceutical composition comprising a compound of Formula (I), and pharmaceutically acceptable salts thereof, and methods of using the compounds and compositions for treating diseases such as cancer.
C07D 491/147 - Systèmes condensés en ortho le système condensé contenant un cycle avec l'oxygène comme hétéro-atome du cycle et deux cycles avec l'azote comme hétéro-atome du cycle
A61K 31/519 - PyrimidinesPyrimidines hydrogénées, p. ex. triméthoprime condensées en ortho ou en péri avec des hétérocycles
The present application relates to compounds of Formula (I), as defined herein, and pharmaceutically acceptable salts thereof. The present application also describes pharmaceutical composition comprising a compound of Formula (I), and pharmaceutically acceptable salts thereof, and methods of using the compounds and compositions for treating diseases, such as cancer, autoimmune disorders, and inflammatory disorders.
A61K 31/519 - PyrimidinesPyrimidines hydrogénées, p. ex. triméthoprime condensées en ortho ou en péri avec des hétérocycles
A61K 31/444 - Pyridines non condenséesLeurs dérivés hydrogénés contenant d'autres systèmes hétérocycliques contenant un cycle à six chaînons avec l'azote comme hétéro-atome du cycle, p. ex. amrinone
A61K 31/5025 - PyridazinesPyridazines hydrogénées condensées en ortho ou en péri avec des systèmes hétérocycliques
A61K 45/06 - Mélanges d'ingrédients actifs sans caractérisation chimique, p. ex. composés antiphlogistiques et pour le cœur
G01N 33/573 - Tests immunologiquesTests faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiquesMatériaux à cet effet pour enzymes ou isoenzymes
G01N 33/68 - Analyse chimique de matériau biologique, p. ex. de sang ou d'urineTest par des méthodes faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiques par ligandsTest immunologique faisant intervenir des protéines, peptides ou amino-acides
8.
3-(1H-INDOLE-2-CARBONYL)-6,6-DIMETHYL-N-((S)-1-OXO-3-((S)-2-OXOPYRROLIDIN-3-YL)P ROPAN-2-YL)-3-AZABICYCLO[3.1.0]HEXANE-2-CARBOXAMIDE DERIVATIVES AS MPRO INHIBITORS FOR THE TREATMENT OF CORONAVIRUS INFECTIONS
Disclosed are compounds represented by formulae (I) and (II): or a pharmaceutically acceptable salt thereof. Compounds of formula (I) and (II) are useful for treating coronavirus infection via inhibition of the protease Mpro.
C07D 403/12 - Composés hétérocycliques contenant plusieurs hétérocycles, comportant des atomes d'azote comme uniques hétéro-atomes du cycle, non prévus par le groupe contenant deux hétérocycles liés par une chaîne contenant des hétéro-atomes comme chaînons
C07D 403/14 - Composés hétérocycliques contenant plusieurs hétérocycles, comportant des atomes d'azote comme uniques hétéro-atomes du cycle, non prévus par le groupe contenant au moins trois hétérocycles
C07D 401/14 - Composés hétérocycliques contenant plusieurs hétérocycles comportant des atomes d'azote comme uniques hétéro-atomes du cycle, au moins un cycle étant un cycle à six chaînons avec un unique atome d'azote contenant au moins trois hétérocycles
A61K 31/4025 - Composés hétérocycliques ayant l'azote comme hétéro-atome d'un cycle, p. ex. guanéthidine ou rifamycines ayant des cycles à cinq chaînons avec un azote comme seul hétéro-atome d'un cycle, p. ex. sulpiride, succinimide, tolmétine, buflomédil non condensés et contenant d'autres hétérocycles, p. ex. cromakalim
A61K 31/403 - Composés hétérocycliques ayant l'azote comme hétéro-atome d'un cycle, p. ex. guanéthidine ou rifamycines ayant des cycles à cinq chaînons avec un azote comme seul hétéro-atome d'un cycle, p. ex. sulpiride, succinimide, tolmétine, buflomédil condensés avec des carbocycles, p. ex. carbazole
A61K 31/407 - Composés hétérocycliques ayant l'azote comme hétéro-atome d'un cycle, p. ex. guanéthidine ou rifamycines ayant des cycles à cinq chaînons avec un azote comme seul hétéro-atome d'un cycle, p. ex. sulpiride, succinimide, tolmétine, buflomédil condensés avec des systèmes hétérocycliques, p. ex. kétorolac, physostigmine
The present application relates to compounds of Formula (I), as defined herein, and pharmaceutically acceptable salts thereof. The present application also describes pharmaceutical composition comprising a compound of Formula (I), and pharmaceutically acceptable salts thereof, and methods of using the compounds and compositions for treating diseases, such as cancer, autoimmune disorders, and inflammatory disorders.
The present application relates to compounds of Formula (I), as defined herein, and pharmaceutically acceptable salts thereof which are MALT1 inhibitors. The present application also describes pharmaceutical composition comprising a compound of Formula (I), and pharmaceutically acceptable salts thereof, and methods of using the compounds and compositions for treating diseases, such as cancer, autoimmune disorders, and inflammatory disorders.
The present application relates to compounds of Formula (I), as defined herein, and pharmaceutically acceptable salts thereof which are MALT1 inhibitors. The present application also describes pharmaceutical composition comprising a compound of Formula (I), and pharmaceutically acceptable salts thereof, and methods of using the compounds and compositions for treating diseases, such as cancer, autoimmune disorders, and inflammatory disorders.
The present application relates to compounds of Formula (I), as defined herein, and pharmaceutically acceptable salts thereof. The present application also describes pharmaceutical composition comprising a compound of Formula (I), and pharmaceutically acceptable salts thereof, and methods of using the compounds and compositions for inhibiting certain protein-protein interactions, and for treating cancer.
C07C 235/58 - Amides d'acides carboxyliques, le squelette carboné de la partie acide étant substitué de plus par des atomes d'oxygène ayant des atomes de carbone de groupes carboxamide liés à des atomes de carbone de cycles aromatiques à six chaînons et des atomes d'oxygène, liés par des liaisons simples, liés au même squelette carboné avec des atomes de carbone de groupes carboxamide et des atomes d'oxygène, liés par des liaisons simples, liés à des atomes de carbone du même cycle aromatique à six chaînons non condensé avec des atomes de carbone de groupes carboxamide et des atomes d'oxygène, liés par des liaisons simples, liés en position ortho à des atomes de carbone du même cycle aromatique à six chaînons non condensé
C07C 235/42 - Amides d'acides carboxyliques, le squelette carboné de la partie acide étant substitué de plus par des atomes d'oxygène ayant des atomes de carbone de groupes carboxamide liés à des atomes de carbone de cycles aromatiques à six chaînons et des atomes d'oxygène, liés par des liaisons simples, liés au même squelette carboné
C07C 235/44 - Amides d'acides carboxyliques, le squelette carboné de la partie acide étant substitué de plus par des atomes d'oxygène ayant des atomes de carbone de groupes carboxamide liés à des atomes de carbone de cycles aromatiques à six chaînons et des atomes d'oxygène, liés par des liaisons simples, liés au même squelette carboné avec des atomes de carbone de groupes carboxamide et des atomes d'oxygène, liés par des liaisons simples, liés à des atomes de carbone du même cycle aromatique à six chaînons non condensé
12.
HETEROCYCLIC PERICONDENSED CDC7 KINASE INHIBITORS FOR THE TREATMENT OF CANCER
The present application relates to compounds of Formula (I), as defined herein, and pharmaceutically acceptable salts thereof. The present application also describes pharmaceutical composition comprising a compound of Formula (I), and pharmaceutically acceptable salts thereof, and methods of using the compounds and compositions for inhibiting kinase activity, and for treating cancer.
The present application relates to compounds of Formula (I), as defined herein, and pharmaceutically acceptable salts thereof. The present application also describes pharmaceutical composition comprising a compound of Formula (I), and pharmaceutically acceptable salts thereof, and methods of using the compounds and compositions for inhibiting certain protein- protein interactions, and for treating cancer.
C07D 401/12 - Composés hétérocycliques contenant plusieurs hétérocycles comportant des atomes d'azote comme uniques hétéro-atomes du cycle, au moins un cycle étant un cycle à six chaînons avec un unique atome d'azote contenant deux hétérocycles liés par une chaîne contenant des hétéro-atomes comme chaînons
C07D 405/14 - Composés hétérocycliques contenant à la fois un ou plusieurs hétérocycles comportant des atomes d'oxygène comme uniques hétéro-atomes du cycle et un ou plusieurs hétérocycles comportant des atomes d'azote comme uniques hétéro-atomes du cycle contenant au moins trois hétérocycles
C07D 405/04 - Composés hétérocycliques contenant à la fois un ou plusieurs hétérocycles comportant des atomes d'oxygène comme uniques hétéro-atomes du cycle et un ou plusieurs hétérocycles comportant des atomes d'azote comme uniques hétéro-atomes du cycle contenant deux hétérocycles liés par une liaison directe de chaînon cyclique à chaînon cyclique
C07D 401/14 - Composés hétérocycliques contenant plusieurs hétérocycles comportant des atomes d'azote comme uniques hétéro-atomes du cycle, au moins un cycle étant un cycle à six chaînons avec un unique atome d'azote contenant au moins trois hétérocycles
A system, device, and method for predicting an active set of compounds that bind to a biomolecular target is disclosed. The system and device contain modules allowing for the prediction of an active set of compounds. A core identification module can identify the core of an initial lead compound. A core hopping module is used to identify potential lead compounds having different cores compared to the core of an initial lead compound. A scoring module can use computational techniques to calculate the relative binding free energy of each identified potential lead compound. An activity prediction module can use the relative binding free energy calculations to predict an active set of compounds that bind to the biomolecular target. Empirical analysis can be used to inform the accuracy and completeness of the predicted active set of compounds.
G16C 20/50 - Conception moléculaire, p. ex. de médicaments
G16C 10/00 - Chimie théorique computationnelle, c.-à-d. TIC spécialement adaptées aux aspects théoriques de la chimie quantique, de la mécanique moléculaire, de la dynamique moléculaire ou similaires
G16C 20/10 - Analyse ou conception des réactions, des synthèses ou des procédés chimiques
G16C 20/70 - Apprentissage automatique, exploration de données ou chimiométrie
The present application relates to compounds of Formula (I), as defined herein, and pharmaceutically acceptable salts thereof. The present application also describes pharmaceutical composition comprising a compound of Formula (I), and pharmaceutically acceptable salts thereof, and methods of using the compounds and compositions for inhibiting certain protein-protein interactions, and for treating cancer.
C07D 405/14 - Composés hétérocycliques contenant à la fois un ou plusieurs hétérocycles comportant des atomes d'oxygène comme uniques hétéro-atomes du cycle et un ou plusieurs hétérocycles comportant des atomes d'azote comme uniques hétéro-atomes du cycle contenant au moins trois hétérocycles
C07D 405/12 - Composés hétérocycliques contenant à la fois un ou plusieurs hétérocycles comportant des atomes d'oxygène comme uniques hétéro-atomes du cycle et un ou plusieurs hétérocycles comportant des atomes d'azote comme uniques hétéro-atomes du cycle contenant deux hétérocycles liés par une chaîne contenant des hétéro-atomes comme chaînons
C07D 405/04 - Composés hétérocycliques contenant à la fois un ou plusieurs hétérocycles comportant des atomes d'oxygène comme uniques hétéro-atomes du cycle et un ou plusieurs hétérocycles comportant des atomes d'azote comme uniques hétéro-atomes du cycle contenant deux hétérocycles liés par une liaison directe de chaînon cyclique à chaînon cyclique
C07D 213/73 - Radicaux amino ou imino non substitués
A system, device, and method for predicting a docked position of a target ligand in a binding site of a biomolecule is disclosed. The prediction makes use of a template ligand-biomolecule complex structure in order to predict a target ligand-biomolecule complex structure. The system and device contain modules allowing for the prediction of a target-ligand biomolecule complex structure. A preparation module can receive information identifying a target ligand and a template ligand-biomolecule structure. A pharmacophore matcher module can identify common pharmacophores between the template ligand and the target ligand. A docking module can predict a docked ligand position of the target ligand by overlapping the pharmacophore models of the target ligand and template ligand while the template ligand is in the binding site of the biomolecule. A biomolecule modification module can modify the biomolecule to reduce clashes between the docked target ligand and the biomolecule.
The present application relates to compounds of Formula (I), as defined herein, and pharmaceutically acceptable salts thereof. The present application also describes pharmaceutical composition comprising a compound of Formula (I), and pharmaceutically acceptable salts thereof, and methods of using the compounds and compositions for inhibiting kinase activity, and for treating cancer.
A61K 31/551 - Composés hétérocycliques ayant l'azote comme hétéro-atome d'un cycle, p. ex. guanéthidine ou rifamycines ayant des cycles à sept chaînons, p. ex. azélastine, pentylènetétrazole ayant deux atomes d'azote comme hétéro-atomes d'un cycle, p. ex. clozapine, dilazèpe
A61K 45/06 - Mélanges d'ingrédients actifs sans caractérisation chimique, p. ex. composés antiphlogistiques et pour le cœur
C07D 519/00 - Composés hétérocycliques contenant plusieurs systèmes de plusieurs hétérocycles déterminants condensés entre eux ou condensés avec un système carbocyclique commun non prévus dans les groupes ou
A61K 31/5383 - 1,4-Oxazines, p. ex. morpholine condensées en ortho ou en péri avec des systèmes hétérocycliques
A61K 31/553 - Composés hétérocycliques ayant l'azote comme hétéro-atome d'un cycle, p. ex. guanéthidine ou rifamycines ayant des cycles à sept chaînons, p. ex. azélastine, pentylènetétrazole ayant au moins un azote et au moins un oxygène comme hétéro-atomes d'un cycle, p. ex. loxapine, staurosporine
The present application relates to compounds of Formula (I), as defined herein, and pharmaceutically acceptable salts thereof. The present application also describes pharmaceutical composition comprising a compound of Formula (I), and pharmaceutically acceptable salts thereof, and methods of using the compounds and compositions for inhibiting certain protein-protein interactions, and for treating cancer.
A61K 31/4375 - Composés hétérocycliques ayant l'azote comme hétéro-atome d'un cycle, p. ex. guanéthidine ou rifamycines ayant des cycles à six chaînons avec un azote comme seul hétéro-atome d'un cycle condensés en ortho ou en péri avec des systèmes hétérocycliques le système hétérocyclique contenant un cycle à six chaînons ayant l'azote comme hétéro-atome du cycle, p. ex. quinolizines, naphtyridines, berbérine, vincamine
A61K 31/4985 - Pyrazines ou pipérazines condensées en ortho ou en péri avec des systèmes hétérocycliques
The present application relates to compounds of Formula (I), as defined herein, and pharmaceutically acceptable salts thereof. The present application also describes pharmaceutical composition comprising a compound of Formula (I), and pharmaceutically acceptable salts thereof, and methods of using the compounds and compositions for inhibiting kinase activity, and for treating cancer.
A61K 31/4365 - Composés hétérocycliques ayant l'azote comme hétéro-atome d'un cycle, p. ex. guanéthidine ou rifamycines ayant des cycles à six chaînons avec un azote comme seul hétéro-atome d'un cycle condensés en ortho ou en péri avec des systèmes hétérocycliques le système hétérocyclique ayant le soufre comme hétéro-atome du cycle, p. ex. ticlopidine
The present application relates to compounds of Formula (I), as defined herein, and pharmaceutically acceptable salts thereof. The present application also describes pharmaceutical composition comprising a compound of Formula (I), and pharmaceutically acceptable salts thereof, and methods of using the compounds and compositions for inhibiting kinase activity, and for treating cancer.
A61K 31/4365 - Composés hétérocycliques ayant l'azote comme hétéro-atome d'un cycle, p. ex. guanéthidine ou rifamycines ayant des cycles à six chaînons avec un azote comme seul hétéro-atome d'un cycle condensés en ortho ou en péri avec des systèmes hétérocycliques le système hétérocyclique ayant le soufre comme hétéro-atome du cycle, p. ex. ticlopidine
The present application relates to compounds of Formula (I), as defined herein, and pharmaceutically acceptable salts thereof. The present application also describes pharmaceutical composition comprising a compound of Formula (I), and pharmaceutically acceptable salts thereof, and methods of using the compounds and compositions for treating diseases, such as cancer, autoimmune disorders, and inflammatory disorders.
The present application relates to compounds of Formula (I), as defined herein, and pharmaceutically acceptable salts thereof. The present application also describes pharmaceutical composition comprising a compound of Formula (I), and pharmaceutically acceptable salts thereof, and methods of using the compounds and compositions for treating diseases such as cancer.
The present application relates to compounds of Formula (I), as defined herein, and pharmaceutically acceptable salts thereof. The present application also describes pharmaceutical composition comprising a compound of Formula (I), and pharmaceutically acceptable salts thereof, and methods of using the compounds and compositions for inhibiting kinase activity, and for treating cancer.
A61P 35/04 - Agents anticancéreux spécifiques pour le traitement des métastases
A61K 31/4365 - Composés hétérocycliques ayant l'azote comme hétéro-atome d'un cycle, p. ex. guanéthidine ou rifamycines ayant des cycles à six chaînons avec un azote comme seul hétéro-atome d'un cycle condensés en ortho ou en péri avec des systèmes hétérocycliques le système hétérocyclique ayant le soufre comme hétéro-atome du cycle, p. ex. ticlopidine
24.
SUBSTITUTED DIHYDROPYRAZINEDIONES AS MODULATORS OF THE NMDA RECEPTOR
This present application relates to compounds of Formula (I), as defined herein, and pharmaceutically acceptable salts thereof. The present application also describes pharmaceutical composition comprising a compound of Formula (I) and pharmaceutically acceptable salts thereof and methods of using the compounds and compositions for treating neurological disorders such as schizophrenia, mild cognitive impairment and chronic neuropathic pain.
C07D 401/06 - Composés hétérocycliques contenant plusieurs hétérocycles comportant des atomes d'azote comme uniques hétéro-atomes du cycle, au moins un cycle étant un cycle à six chaînons avec un unique atome d'azote contenant deux hétérocycles liés par une chaîne carbonée contenant uniquement des atomes de carbone aliphatiques
C07D 401/12 - Composés hétérocycliques contenant plusieurs hétérocycles comportant des atomes d'azote comme uniques hétéro-atomes du cycle, au moins un cycle étant un cycle à six chaînons avec un unique atome d'azote contenant deux hétérocycles liés par une chaîne contenant des hétéro-atomes comme chaînons
C07D 403/06 - Composés hétérocycliques contenant plusieurs hétérocycles, comportant des atomes d'azote comme uniques hétéro-atomes du cycle, non prévus par le groupe contenant deux hétérocycles liés par une chaîne carbonée ne contenant que des atomes de carbone aliphatiques
C07D 403/10 - Composés hétérocycliques contenant plusieurs hétérocycles, comportant des atomes d'azote comme uniques hétéro-atomes du cycle, non prévus par le groupe contenant deux hétérocycles liés par une chaîne carbonée contenant des cycles aromatiques
C07D 403/12 - Composés hétérocycliques contenant plusieurs hétérocycles, comportant des atomes d'azote comme uniques hétéro-atomes du cycle, non prévus par le groupe contenant deux hétérocycles liés par une chaîne contenant des hétéro-atomes comme chaînons
C07D 405/04 - Composés hétérocycliques contenant à la fois un ou plusieurs hétérocycles comportant des atomes d'oxygène comme uniques hétéro-atomes du cycle et un ou plusieurs hétérocycles comportant des atomes d'azote comme uniques hétéro-atomes du cycle contenant deux hétérocycles liés par une liaison directe de chaînon cyclique à chaînon cyclique
C07D 405/06 - Composés hétérocycliques contenant à la fois un ou plusieurs hétérocycles comportant des atomes d'oxygène comme uniques hétéro-atomes du cycle et un ou plusieurs hétérocycles comportant des atomes d'azote comme uniques hétéro-atomes du cycle contenant deux hétérocycles liés par une chaîne carbonée contenant uniquement des atomes de carbone aliphatiques
C07D 405/12 - Composés hétérocycliques contenant à la fois un ou plusieurs hétérocycles comportant des atomes d'oxygène comme uniques hétéro-atomes du cycle et un ou plusieurs hétérocycles comportant des atomes d'azote comme uniques hétéro-atomes du cycle contenant deux hétérocycles liés par une chaîne contenant des hétéro-atomes comme chaînons
C07D 409/04 - Composés hétérocycliques contenant plusieurs hétérocycles, au moins un cycle comportant des atomes de soufre comme uniques hétéro-atomes du cycle contenant deux hétérocycles liés par une liaison directe de chaînon cyclique à chaînon cyclique
C07D 409/06 - Composés hétérocycliques contenant plusieurs hétérocycles, au moins un cycle comportant des atomes de soufre comme uniques hétéro-atomes du cycle contenant deux hétérocycles liés par une chaîne carbonée contenant uniquement des atomes de carbone aliphatiques
C07D 409/12 - Composés hétérocycliques contenant plusieurs hétérocycles, au moins un cycle comportant des atomes de soufre comme uniques hétéro-atomes du cycle contenant deux hétérocycles liés par une chaîne contenant des hétéro-atomes comme chaînons
C07D 411/04 - Composés hétérocycliques contenant plusieurs hétérocycles, au moins un cycle comportant des atomes d'oxygène et de soufre comme uniques hétéro-atomes du cycle contenant deux hétérocycles liés par une liaison directe de chaînon cyclique à chaînon cyclique
C07D 413/04 - Composés hétérocycliques contenant plusieurs hétérocycles, au moins un cycle comportant des atomes d'azote et d'oxygène comme uniques hétéro-atomes du cycle contenant deux hétérocycles liés par une liaison directe de chaînon cyclique à chaînon cyclique
25.
Methods for predicting an active set of compounds having alternative cores, and drug discovery methods involving the same
A system, device, and method for predicting an active set of compounds that bind to a biomolecular target is disclosed. The system and device contain modules allowing for the prediction of an active set of compounds. A core identification module can identify the core of an initial lead compound. A core hopping module is used to identify potential lead compounds having different cores compared to the core of an initial lead compound. A scoring module can use computational techniques to calculate the relative binding free energy of each identified potential lead compound. An activity prediction module can use the relative binding free energy calculations to predict an active set of compounds that bind to the biomolecular target. Empirical analysis can be used to inform the accuracy and completeness of the predicted active set of compounds.
G16C 20/50 - Conception moléculaire, p. ex. de médicaments
G16C 10/00 - Chimie théorique computationnelle, c.-à-d. TIC spécialement adaptées aux aspects théoriques de la chimie quantique, de la mécanique moléculaire, de la dynamique moléculaire ou similaires
G16C 20/10 - Analyse ou conception des réactions, des synthèses ou des procédés chimiques
G16C 20/70 - Apprentissage automatique, exploration de données ou chimiométrie
The present application relates to compounds of Formula (I), as defined herein, and pharmaceutically acceptable salts thereof which are MALT1 inhibitors. The present application also describes pharmaceutical composition comprising a compound of Formula (I), and pharmaceutically acceptable salts thereof, and methods of using the compounds and compositions for treating diseases, such as cancer, autoimmune disorders, and inflammatory disorders.
The present application relates to compounds of Formula (I), as defined herein, and pharmaceutically acceptable salts thereof which are MALT1 inhibitors. The present application also describes pharmaceutical composition comprising a compound of Formula (I), and pharmaceutically acceptable salts thereof, and methods of using the compounds and compositions for treating diseases, such as cancer, autoimmune disorders, and inflammatory disorders.
A system, device, and method for predicting a docked position of a target ligand in a binding site of a biomolecule is disclosed. The prediction makes use of a template ligand-biomolecule complex structure in order to predict a target ligand-biomolecule complex structure. The system and device contain modules allowing for the prediction of a target-ligand biomolecule complex structure. A preparation module can receive information identifying a target ligand and a template ligand-biomolecule structure. A pharmacophore matcher module can identify common pharmacophores between the template ligand and the target ligand. A docking module can predict a docked ligand position of the target ligand by overlapping the pharmacophore models of the target ligand and template ligand while the template ligand is in the binding site of the biomolecule. A biomolecule modification module can modify the biomolecule to reduce clashes between the docked target ligand and the biomolecule.
The present application relates to compounds of Formula (I), as defined herein, and pharmaceutically acceptable salts thereof. The present application also describes pharmaceutical composition comprising a compound of Formula (I), and pharmaceutically acceptable salts thereof, and methods of using the compounds and compositions for inhibiting kinase activity, and for treating cancer.
A61P 25/28 - Médicaments pour le traitement des troubles du système nerveux des troubles dégénératifs du système nerveux central, p. ex. agents nootropes, activateurs de la cognition, médicaments pour traiter la maladie d'Alzheimer ou d'autres formes de démence
C07D 495/22 - Composés hétérocycliques contenant dans le système condensé au moins un hétérocycle comportant des atomes de soufre comme uniques hétéro-atomes du cycle dans lesquels le système condensé contient au moins quatre hétérocycles
A method for computing free energy difference between a reference molecule and a target molecule. The target molecule has the common set of atoms PAB and a set of atoms PB. The method includes applying a potential to restrain an interaction of the additional atomic component from the set of atoms PB with the common set of atoms PAB in the initial state. The method includes determining one or more transition states along a transformation path between the initial state and target state. The method includes scaling the restrain potential correspondingly along the transformation path until the potential becomes zero when a corresponding end state is reached, and calculating the free energy difference between the reference molecule and the target molecule using a value obtained along the transformation path from the initial state to the target state.
G16C 20/50 - Conception moléculaire, p. ex. de médicaments
G16B 15/00 - TIC spécialement adaptées à l’analyse de structures moléculaires bidimensionnelles ou tridimensionnelles, p. ex. relations structurelles ou fonctionnelles ou alignement de structures
G16B 15/30 - Ciblage de médicament à l’aide de données structurellesPrévision d’amarrage ou de liaison moléculaire
31.
PREDICTING AN ACTIVE SET OF COMPOUNDS HAVING ALTERNATIVE CORES
A system, device, and method for predicting an active set of compounds that bind to a biomolecular target is disclosed. The system and device contain modules allowing for the prediction of an active set of compounds. A core identification module can identify the core of an initial lead compound. A core hopping module is used to identify potential lead compounds having different cores compared to the core of an initial lead compound. A scoring module can use computational techniques to calculate the relative binding free energy of each identified potential lead compound. An activity prediction module can use the relative binding free energy calculations to predict an active set of compounds that bind to the biomolecular target. Empirical analysis can be used to inform the accuracy and completeness of the predicted active set of compounds.
G06F 19/16 - pour la structure moléculaire, p.ex. alignement de la structure, relations structurales ou fonctionnelles, repliement protéique, topologies de domaine, ciblage de médicaments utilisant des données de structure, impliquant des structures bidimensionnelles ou tridimensionnelles
C12Q 1/02 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des micro-organismes viables
G01N 33/50 - Analyse chimique de matériau biologique, p. ex. de sang ou d'urineTest par des méthodes faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiques par ligandsTest immunologique
A system, device, and method for predicting a docked position of a target ligand in a binding site of a biomolecule is disclosed. The prediction makes use of a template ligand-biomolecule complex structure in order to predict a target ligand-biomolecule complex structure. The system and device contain modules allowing for the prediction of a target-ligand biomolecule complex structure. A preparation module can receive information identifying a target ligand and a template ligand-biomolecule structure. A pharmacophore matcher module can identify common pharmacophores between the template ligand and the target ligand. A docking module can predict a docked ligand position of the target ligand by overlapping the pharmacophore models of the target ligand and template ligand while the template ligand is in the binding site of the biomolecule. A biomolecule modification module can modify the biomolecule to reduce clashes between the docked target ligand and the biomolecule.
C40B 30/04 - Procédés de criblage des bibliothèques en mesurant l'aptitude spécifique à se lier à une molécule cible, p. ex. liaison anticorps-antigène, liaison récepteur-ligand
G01N 33/50 - Analyse chimique de matériau biologique, p. ex. de sang ou d'urineTest par des méthodes faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiques par ligandsTest immunologique
G06F 19/00 - Équipement ou méthodes de traitement de données ou de calcul numérique, spécialement adaptés à des applications spécifiques (spécialement adaptés à des fonctions spécifiques G06F 17/00;systèmes ou méthodes de traitement de données spécialement adaptés à des fins administratives, commerciales, financières, de gestion, de surveillance ou de prévision G06Q;informatique médicale G16H)
G06F 19/10 - Bio-informatique, c. à d. procédés ou systèmes pour le traitement de données génétiques ou se rapportant aux protéines en biologie moléculaire informatique (procédés in silico de criblage de bibliothèques chimiques virtuelles C40B 30/02;procédés mathématiques ou in silicio de création de bibliothèques chimiques virtuelles C40B 50/02)
G06F 19/16 - pour la structure moléculaire, p.ex. alignement de la structure, relations structurales ou fonctionnelles, repliement protéique, topologies de domaine, ciblage de médicaments utilisant des données de structure, impliquant des structures bidimensionnelles ou tridimensionnelles
33.
Methods and systems for calculating free energy differences using an alchemical restraint potential
AB in the initial state. The method includes determining one or more transition states along a transformation path between the initial state and target state. The method includes scaling the restrain potential correspondingly along the transformation path until the potential becomes zero when a corresponding end state is reached, and calculating the free energy difference between the reference molecule and the target molecule using a value obtained along the transformation path from the initial state to the target state.
G01N 33/48 - Matériau biologique, p. ex. sang, urineHémocytomètres
G01N 33/50 - Analyse chimique de matériau biologique, p. ex. de sang ou d'urineTest par des méthodes faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiques par ligandsTest immunologique
G16C 20/50 - Conception moléculaire, p. ex. de médicaments
G16B 15/00 - TIC spécialement adaptées à l’analyse de structures moléculaires bidimensionnelles ou tridimensionnelles, p. ex. relations structurelles ou fonctionnelles ou alignement de structures
G16B 15/30 - Ciblage de médicament à l’aide de données structurellesPrévision d’amarrage ou de liaison moléculaire
G16C 10/00 - Chimie théorique computationnelle, c.-à-d. TIC spécialement adaptées aux aspects théoriques de la chimie quantique, de la mécanique moléculaire, de la dynamique moléculaire ou similaires
34.
METHODS AND SYSTEMS FOR CALCULATING FREE ENERGY DIFFERENCES USING AN ALCHEMICAL RESTRAINT POTENTIAL
A method for computing free energy difference between a reference molecule and a target molecule. The target molecule has the common set of atoms PAB and a set of atoms PB. The method includes applying a potential to restrain an interaction of the additional atomic component from the set of atoms PB with the common set of atoms PAB in the initial state. The method includes determining one or more transition states along a transformation path between the initial state and target state. The method includes scaling the restrain potential correspondingly along the transformation path until the potential becomes zero when a corresponding end state is reached, and calculating the free energy difference between the reference molecule and the target molecule using a value obtained along the transformation path from the initial state to the target state.
G06F 19/12 - pour la modélisation ou la simulation en biologie des systèmes, p.ex. modèles probabilistes ou dynamiques, réseaux régulateurs de gènes, réseaux d'interaction protéique ou réseaux métaboliques
G06F 19/16 - pour la structure moléculaire, p.ex. alignement de la structure, relations structurales ou fonctionnelles, repliement protéique, topologies de domaine, ciblage de médicaments utilisant des données de structure, impliquant des structures bidimensionnelles ou tridimensionnelles
35.
GRAPHICAL USER INTERFACE FOR CHEMICAL TRANSITION STATE CALCULATIONS
A computer-implemented method for finding a transition state for a chemical reaction includes obtaining a graphical representation of one or more reactants of the chemical reaction via a graphical user interface (GUI); (ii) obtaining a graphical representation of one or more reaction products of the chemical reaction via the GUI; (iii) generating an entrance complex and generating an exit complex; (iv) geometrically aligning the entrance complex and the exit complex; (v) calculating an approximate transition state based on the geometrically aligned entrance and exit complexes; (vi) determining the transition state; and (vii) calculating and outputting information about the transition state from the determined transition state.
Methods and systems for drug discovery collaboration provide collaborative drug discovery electronic workplaces simultaneously accessible by multiple user computing devices. In certain embodiments, a server computer running a server side application communicates with multiple user computing devices. The server side application communicates with electronic databases that define the parameters of each electronic workplace. Each workplace includes an indication of one or more items, such as compounds, and data pertaining to such items, such as computational and experimental data. Updates to a workplace made by one user may be saved to the workplace definition and propagated and displayed to other users. New items of interest may be added to a workplace. A new item added to a workplace may also be saved to the database and registered with the system for use by other users and in connection with other workplaces.
Methods and systems for drug discovery collaboration provide collaborative drug discovery electronic workplaces simultaneously accessible by multiple user computing devices. In certain embodiments, a server computer running a server side application communicates with multiple user computing devices. The server side application communicates with electronic databases that define the parameters of each electronic workplace. Each workplace includes an indication of one or more items, such as compounds, and data pertaining to such items, such as computational and experimental data. Updates to a workplace made by one user may be saved to the workplace definition and propagated and displayed to other users. New items of interest may be added to a workplace. A new item added to a workplace may also be saved to the database and registered with the system for use by other users and in connection with other workplaces.
G06F 17/00 - Équipement ou méthodes de traitement de données ou de calcul numérique, spécialement adaptés à des fonctions spécifiques
G06F 19/00 - Équipement ou méthodes de traitement de données ou de calcul numérique, spécialement adaptés à des applications spécifiques (spécialement adaptés à des fonctions spécifiques G06F 17/00;systèmes ou méthodes de traitement de données spécialement adaptés à des fins administratives, commerciales, financières, de gestion, de surveillance ou de prévision G06Q;informatique médicale G16H)
G06F 17/30 - Recherche documentaire; Structures de bases de données à cet effet
38.
METHODS AND SYSTEMS FOR CALCULATING FREE ENERGY DIFFERENCES USING A MODIFIED BOND STRETCH POTENTIAL
A method and system for calculating the free energy difference between a target state and a reference state. The method includes determining one or more intermediate states using a coupling parameter, performing molecular simulations to obtain ensembles of micro-states for each of the system states, and calculating the free energy difference by an analysis of the ensembles of micro-states of the system states. The method can be particularly suited for calculating physical or non-physical transformation of molecular systems such as ring-opening, ring-closing, and other transformations involving bond breaking and/or formation. A soft bond potential dependent on a bond stretching component of the coupling parameter and different from the conventional harmonic potential is used in the molecular simulations of the system states for the bond being broken or formed during the transformation.
G06F 19/00 - Équipement ou méthodes de traitement de données ou de calcul numérique, spécialement adaptés à des applications spécifiques (spécialement adaptés à des fonctions spécifiques G06F 17/00;systèmes ou méthodes de traitement de données spécialement adaptés à des fins administratives, commerciales, financières, de gestion, de surveillance ou de prévision G06Q;informatique médicale G16H)
G06F 19/16 - pour la structure moléculaire, p.ex. alignement de la structure, relations structurales ou fonctionnelles, repliement protéique, topologies de domaine, ciblage de médicaments utilisant des données de structure, impliquant des structures bidimensionnelles ou tridimensionnelles
39.
Binding affinity scoring function penalizing compounds which make unfavorable hydrophobic contacts with localized water molecules in the receptor active site
A method of scoring binding affinity of a proposed ligand molecule for a receptor molecule using a computer and computer data bases, which accounts for the increase in energy required where docking disrupts water molecules that are localized at ligand hydration sites. The method uses computer-stored data representing a predicted ligand-receptor structure (preferably one that is validated). The computerized scoring analysis includes determining whether the receptor includes one or more hydration sites occupied by localized water, and, if so, assessing a penalty if docking the ligand into the receptor results in unfavorable interaction of the ligand with a localized water molecule remaining at the receptor hydration site (i.e. after docking).
G06F 19/00 - Équipement ou méthodes de traitement de données ou de calcul numérique, spécialement adaptés à des applications spécifiques (spécialement adaptés à des fonctions spécifiques G06F 17/00;systèmes ou méthodes de traitement de données spécialement adaptés à des fins administratives, commerciales, financières, de gestion, de surveillance ou de prévision G06Q;informatique médicale G16H)
40.
Binding affinity scoring function including factor for environs of ring or bulky rigid group
Scoring functions can be markedly improved by taking into account the status environs of ligand rings (or indeed other bulky rigid ligand structures) on the ligand when the ligand is complexed with the receptor. In its most general form, the invention features, quantifying a particular component of binding affinity between a ligand and a receptor molecule. Specifically, the component in question takes into account the spatial relationship between ligand ring structure(s) (or bulky rigid ligand structures) and their ambient surroundings when the ligand is bound to the receptor molecule. The method steps may be used when quantifying a component that reflects these particular ligand features alone, or the steps may be part of a comprehensive method of quantifying binding affinity which includes numerous other factors that relate to binding affinity in addition to the component. For example, one may calculate an initial binding affinity and then adjust the initial binding affinity by a factor obtained at least in part based on the classification of the ring structure.
G06F 19/10 - Bio-informatique, c. à d. procédés ou systèmes pour le traitement de données génétiques ou se rapportant aux protéines en biologie moléculaire informatique (procédés in silico de criblage de bibliothèques chimiques virtuelles C40B 30/02;procédés mathématiques ou in silicio de création de bibliothèques chimiques virtuelles C40B 50/02)
brevets
