Allen Institute, DBA Allen Institute for Brain Science; Allen Institute for Cell Science

États‑Unis d’Amérique

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Type PI
        Brevet 73
        Marque 13
Juridiction
        États-Unis 44
        International 42
Date
2025 octobre 1
2025 août 1
2025 (AACJ) 16
2024 11
2023 12
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Classe IPC
C12N 15/86 - Vecteurs viraux 26
A61K 48/00 - Préparations médicinales contenant du matériel génétique qui est introduit dans des cellules du corps vivant pour traiter des maladies génétiquesThérapie génique 21
C12N 15/85 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes eucaryotes pour cellules animales 9
C12N 15/11 - Fragments d'ADN ou d'ARNLeurs formes modifiées 8
C12N 15/63 - Introduction de matériel génétique étranger utilisant des vecteursVecteurs Utilisation d'hôtes pour ceux-ciRégulation de l'expression 8
Voir plus
Classe NICE
42 - Services scientifiques, technologiques et industriels, recherche et conception 9
09 - Appareils et instruments scientifiques et électriques 8
41 - Éducation, divertissements, activités sportives et culturelles 7
Statut
En Instance 21
Enregistré / En vigueur 65

1.

REMOVING INDEPENDENT NOISE USING DEEPINTERPOLATION

      
Numéro d'application 19252612
Statut En instance
Date de dépôt 2025-06-27
Date de la première publication 2025-10-23
Propriétaire Allen Institute (USA)
Inventeur(s)
  • Lecoq, Jerome
  • Oliver, Michael
  • Siegle, Joshua
  • Koch, Christof

Abrégé

A facility for transforming a subject data item sequence is described. The facility accesses a trained relationship model. For each of a plurality of subject items of the subject data item sequence, the facility: selects a first contiguous series of items of the subject data item sequence immediately before the subject data item; selects a second contiguous series of items of the subject data item sequence immediately after the subject data item; and applies the trained relationship model to the selected first and second contiguous series of data items to obtain a denoised version of the subject data item. The facility then assembles the obtained denoised subject data items into a denoised data item sequence.

Classes IPC  ?

  • G06T 5/70 - DébruitageLissage
  • G06T 5/50 - Amélioration ou restauration d'image utilisant plusieurs images, p. ex. moyenne ou soustraction

2.

ARTIFICIAL EXPRESSION CONSTRUCTS FOR MODULATING GENE EXPRESSION IN MOTOR NEURONS AND CEREBELLAR NEURONS

      
Numéro d'application US2025016850
Numéro de publication 2025/179180
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2025-02-21
Date de publication 2025-08-28
Propriétaire ALLEN INSTITUTE (USA)
Inventeur(s)
  • Daigle, Tanya
  • Lein, Edward, Sebastian

Abrégé

Artificial expression constructs for modulating gene expression in targeted central nervous system cell types are described. The artificial expression constructs can be used to express synthetic genes or modify gene expression in motor neurons and cerebellar neurons including upper motor neurons, lower spinal motor neurons, and deep cerebellar nuclei (DCN) neurons.

Classes IPC  ?

  • A61K 48/00 - Préparations médicinales contenant du matériel génétique qui est introduit dans des cellules du corps vivant pour traiter des maladies génétiquesThérapie génique
  • C12N 15/63 - Introduction de matériel génétique étranger utilisant des vecteursVecteurs Utilisation d'hôtes pour ceux-ciRégulation de l'expression
  • C12N 15/86 - Vecteurs viraux
  • C07K 14/005 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant de virus

3.

ARTIFICIAL EXPRESSION CONSTRUCTS FOR MODULATING GENE EXPRESSION IN THE CEREBELLUM AND A SECONDARY CELL TYPE

      
Numéro d'application 18698499
Statut En instance
Date de dépôt 2022-10-05
Date de la première publication 2025-07-24
Propriétaire Allen Institute (USA)
Inventeur(s)
  • Daigle, Tanya
  • Lein, Edward Sebastian
  • Levi, Boaz P.
  • Tasic, Bosiljka
  • Ting, Jonathan
  • Zeng, Hongkui
  • Mich, John K.

Abrégé

Artificial expression constructs for modulating gene expression in targeted central nervous system cell types are described. The artificial expression constructs can be used to express synthetic genes or modify gene expression in a cerebellar cell type and a secondary cell type.

Classes IPC  ?

  • A61K 48/00 - Préparations médicinales contenant du matériel génétique qui est introduit dans des cellules du corps vivant pour traiter des maladies génétiquesThérapie génique
  • A61K 9/00 - Préparations médicinales caractérisées par un aspect particulier
  • C12N 5/0797 - Cellules souchesCellules progénitrices
  • C12N 15/86 - Vecteurs viraux

4.

ARTIFICIAL EXPRESSION CONSTRUCTS FOR SELECTIVELY MODULATING GENE EXPRESSION IN EXCITATORY CORTICAL NEURONS

      
Numéro d'application 19007263
Statut En instance
Date de dépôt 2024-12-31
Date de la première publication 2025-07-24
Propriétaire Allen Institute (USA)
Inventeur(s)
  • Graybuck, Lucas T.
  • Tasic, Bosiljka
  • Daigle, Tanya
  • Ting, Jonathan
  • Zeng, Hongkui
  • Kalmbach, Brian Edward
  • Mich, John K.
  • Hess, Erik
  • Lein, Edward Sebastian
  • Levi, Boaz P.

Abrégé

Artificial expression constructs for selectively modulating gene expression in selected central nervous system cell types are described. The artificial expression constructs can be used to selectively express synthetic genes or modify gene expression in excitatory cortical neurons, such as primarily within cortical layers 2/3, 4, 5, and 6 and including those with extratelencephalic (ET) projections, intratelencephalic (IT) projections, and pyramidal tract (PT) projections, among others.

Classes IPC  ?

5.

ARTIFICIAL EXPRESSION CONSTRUCTS FOR SELECTIVELY MODULATING GENE EXPRESSION IN INTERNEURONS

      
Numéro d'application 19007152
Statut En instance
Date de dépôt 2024-12-31
Date de la première publication 2025-07-10
Propriétaire
  • Allen Institute (USA)
  • Seattle Children's Hospital d/b/a Seattle Children's Research Institute (USA)
Inventeur(s)
  • Ting, Jonathan
  • Levi, Boaz P.
  • Mich, John K.
  • Lein, Edward Sebastian
  • Kalume, Franck

Abrégé

Artificial expression constructs for selectively modulating gene expression in selected central nervous system cell types are described. The artificial expression constructs can be used to selectively express synthetic genes or modify gene expression in GABAergic interneurons.

Classes IPC  ?

  • C12N 15/86 - Vecteurs viraux
  • A01K 67/0278 - Vertébrés knock-in, p. ex. vertébrés humanisés
  • A61K 35/30 - NerfsCerveauYeuxCellules cornéennesLiquide céphalorachidienCellules souches neuronalesCellules précurseurs neuronalesCellules glialesOligodendrocytesCellules de SchwannAstrogliesAstrocytesPlexus choroïdeTissu de moelle épinière
  • C12N 5/0793 - Neurones

6.

ARTIFICIAL EXPRESSION CONSTRUCTS FOR MODULATING GENE EXPRESSION IN SEROTONERGIC NEURONS

      
Numéro d'application US2024061435
Numéro de publication 2025/137554
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2024-12-20
Date de publication 2025-06-26
Propriétaire ALLEN INSTITUTE (USA)
Inventeur(s)
  • Ben-Simon, Yoav
  • Opitz-Araya, Ximena
  • Lein, Edward Sebastian
  • Tasic, Bosiljka
  • Thomas, Emma
  • Ting, Jonathan

Abrégé

Artificial expression constructs for modulating gene expression in targeted central nervous system cell types are described. The artificial expression constructs can be used to express synthetic genes or modify gene expression in serotonergic neurons within the dorsal raphe nucleus and/or the median raphe nucleus.

Classes IPC  ?

  • C12N 15/67 - Méthodes générales pour favoriser l'expression
  • A61K 48/00 - Préparations médicinales contenant du matériel génétique qui est introduit dans des cellules du corps vivant pour traiter des maladies génétiquesThérapie génique
  • C12N 15/113 - Acides nucléiques non codants modulant l'expression des gènes, p. ex. oligonucléotides anti-sens
  • C12N 15/85 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes eucaryotes pour cellules animales

7.

SYSTEMS AND METHODS FOR REPRODUCIBILITY VERIFICATION

      
Numéro d'application US2024059360
Numéro de publication 2025/128556
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2024-12-10
Date de publication 2025-06-19
Propriétaire ALLEN INSTITUTE (USA)
Inventeur(s) Meijer, Paul

Abrégé

A computer implemented method of auditing a data analysis process is provided. The method includes generating a certificate of reproducibility that permits a user or auditor to exactly duplicate the various steps involved in the data analysis process, including data ingestion, data processing, and data output. The certificate of reproducibility may include a directed reproducibility graph of events that contribute to the output. The certificate of reproducibility and directed reproducibility graph may be published.

Classes IPC  ?

  • G06F 16/23 - Mise à jour
  • G06F 21/64 - Protection de l’intégrité des données, p. ex. par sommes de contrôle, certificats ou signatures
  • G06F 16/90 - Détails des fonctions des bases de données indépendantes des types de données cherchés

8.

ARTIFICIAL EXPRESSION CONSTRUCTS FOR MODULATING GENE EXPRESSION IN DOPAMINERGIC NEURONS

      
Numéro d'application 18841086
Statut En instance
Date de dépôt 2023-02-24
Date de la première publication 2025-05-22
Propriétaire Allen Institute (USA)
Inventeur(s)
  • Daigle, Tanya
  • Lein, Edward Sebastian
  • Levi, Boaz P.
  • Tasic, Bosiljka
  • Ting, Jonathan
  • Zeng, Hongkui

Abrégé

Artificial expression constructs for modulating gene expression in targeted central nervous system cell types are described. The artificial expression constructs can be used to express synthetic genes or modify gene expression in dopaminergic neurons of the central nervous system. Wherein, an artificial expression construct comprising (i) an enhancer is eHGT 888m.

Classes IPC  ?

  • C12N 15/86 - Vecteurs viraux
  • A61K 48/00 - Préparations médicinales contenant du matériel génétique qui est introduit dans des cellules du corps vivant pour traiter des maladies génétiquesThérapie génique

9.

BIOMARKERS TO PREDICT ONSET OF CLINICAL RHEUMATOID ARTHRITIS

      
Numéro d'application US2024055169
Numéro de publication 2025/101929
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2024-11-08
Date de publication 2025-05-15
Propriétaire
  • ALLEN INSTITUTE (USA)
  • THE REGENTS OF THE UNIVERSITY OF COLORADO, A BODY CORPORATE (USA)
  • BOARD OF REGENTS OF THE UNIVERSITY OF NEBRASKA (USA)
  • UNIFORMED SERVICES UNIVERSITY OF THE HEALTH SCIENCES (USA)
Inventeur(s)
  • Gillespie, Mark, Andrew
  • Li, Xiaojun
  • Savage, Adam, Kenneth
  • Zaim, Samir, Rachid
  • Deane, Kevin, Dale
  • Holers, Vernon, Michael
  • Mikuls, Ted, Richard
  • Edison, Jess, David

Abrégé

Biomarkers to predict progression from at-risk of developing rheumatoid arthritis (pre-RA) to physician-confirmed rheumatoid arthritis (i.e., Clinical RA) within defined time periods are described. The described biomarkers can be used to identify interventions to prevent, delay, or modulate future Clinical RA and to identify potential stage-specific targets for preventive interventions.

Classes IPC  ?

  • G01N 33/564 - Tests immunologiquesTests faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiquesMatériaux à cet effet pour complexes immunologiques préexistants ou maladies auto-immunes
  • G16B 25/10 - Profilage de l’expression de gènes ou de protéinesEstimation ou normalisation de ratio d’expression

10.

ARTIFICIAL EXPRESSION CONSTRUCTS FOR MODULATING GENE EXPRESSION IN NEURONS AND ASTROCYTES FOR THE ASSESSMENT AND/OR TREATMENT OF SLC6A1-RELATED DISORDERS

      
Numéro d'application US2024047232
Numéro de publication 2025/064516
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2024-09-18
Date de publication 2025-03-27
Propriétaire ALLEN INSTITUTE (USA)
Inventeur(s)
  • Gore, Bryan
  • Guo, Rong
  • Hage, Travis
  • Lein, Edward Sebastian
  • Levi, Boaz P.
  • Martinez, Refugio
  • Mich, John K.
  • Opitz-Araya, Ximena
  • Ting, Jonathan

Abrégé

Artificial expression constructs for modulating gene expression in neurons and astrocytes are described. Particular artificial expression constructs modulate gene expression in pan-brain GABAergic neurons and forebrain GABAergic neurons. The artificial expression constructs can be used in the assessment and/or treatment of SLC6A1-related disorders, such as epilepsy, seizures, autism spectrum disorder, and related disorders.

Classes IPC  ?

  • C12N 15/113 - Acides nucléiques non codants modulant l'expression des gènes, p. ex. oligonucléotides anti-sens
  • C12N 15/864 - Vecteurs parvoviraux
  • C12N 5/00 - Cellules non différenciées humaines, animales ou végétales, p. ex. lignées cellulairesTissusLeur culture ou conservationMilieux de culture à cet effet

11.

ARTIFICIAL EXPRESSION CONSTRUCTS FOR MODULATING GENE EXPRESSION IN THE BASAL GANGLIA

      
Numéro d'application US2024046735
Numéro de publication 2025/059552
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2024-09-13
Date de publication 2025-03-20
Propriétaire ALLEN INSTITUTE (USA)
Inventeur(s)
  • Bakken, Trygve
  • Daigle, Tanya
  • Levi, Boaz P.
  • Tasic, Bosiljka
  • Ting, Jonathan

Abrégé

Artificial expression constructs for modulating gene expression in targeted central nervous system cell types are described. The artificial expression constructs can be used to express synthetic genes or modify gene expression in basal ganglia neurons including striatal neurons, globus pallidus neurons, and substantia nigra neurons.

Classes IPC  ?

  • C12N 15/113 - Acides nucléiques non codants modulant l'expression des gènes, p. ex. oligonucléotides anti-sens
  • C12N 15/86 - Vecteurs viraux
  • A01K 67/0275 - Vertébrés modifiés génétiquement, p. ex. transgéniques
  • A61K 48/00 - Préparations médicinales contenant du matériel génétique qui est introduit dans des cellules du corps vivant pour traiter des maladies génétiquesThérapie génique
  • C12N 5/00 - Cellules non différenciées humaines, animales ou végétales, p. ex. lignées cellulairesTissusLeur culture ou conservationMilieux de culture à cet effet

12.

MOLECULAR SIGNATURES FOR CELL TYPING AND MONITORING IMMUNE HEALTH

      
Numéro d'application 18721154
Statut En instance
Date de dépôt 2022-12-19
Date de la première publication 2025-02-20
Propriétaire ALLEN INSTITUTE (USA)
Inventeur(s)
  • Bumol, Thomas F.
  • Li, Xiao-Jun
  • Savage, Adam
  • Skene, Peter
  • Torgerson, Troy
  • Vasaikar, Suhas

Abrégé

Provided herein are methods, devices, and systems comprising identification of a panel of gene markers useful for immune cell typing and identifying, detecting, and/or monitoring disease conditions in a subject in need thereof, including infections, cancer and autoimmune conditions. The methods also provide for assays for determining the levels of said markers prior to and after treatment of a condition in the subject, wherein the condition is impacted by one or more factors including age, occupation or environment of the subject.

Classes IPC  ?

  • C12Q 1/6886 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes pour les maladies provoquées par des altérations du matériel génétique pour le cancer
  • C12Q 1/6881 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes pour le typage de tissu ou de cellule, p. ex. sondes d’antigène leucocytaire humain [HLA]
  • C12Q 1/70 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des virus ou des bactériophages
  • G16B 20/20 - Détection d’allèles ou de variantes, p. ex. détection de polymorphisme d’un seul nucléotide

13.

ARTIFICIAL EXPRESSION CONSTRUCTS FOR MODULATING GENE EXPRESSION IN NEOCORTICAL LAYER 4 OR LAYER 5 INTRATELENCEPHALIC NEURONS

      
Numéro d'application 18717907
Statut En instance
Date de dépôt 2022-12-07
Date de la première publication 2025-02-06
Propriétaire Allen Institute (USA)
Inventeur(s)
  • Lein, Edward Sebastian
  • Levi, Boaz P.
  • Ting, Jonathan

Abrégé

Artificial expression constructs for modulating gene expression in targeted central nervous system cell types are described. The artificial expression constructs can be used to express synthetic genes or modify gene expression in neocortical layer 4 (L4) intratelencephalic (IT) neurons and/or neocortical L5 IT neurons.

Classes IPC  ?

  • A61K 48/00 - Préparations médicinales contenant du matériel génétique qui est introduit dans des cellules du corps vivant pour traiter des maladies génétiquesThérapie génique
  • C12N 15/86 - Vecteurs viraux

14.

RESCUING VOLTAGE-GATED SODIUM CHANNEL FUNCTION IN INHIBITORY NEURONS

      
Numéro d'application 18920747
Statut En instance
Date de dépôt 2024-10-18
Date de la première publication 2025-02-06
Propriétaire
  • Allen Institute (USA)
  • Seattle Children's Hospital d/b/a Seattle Children's Research Institute (USA)
Inventeur(s)
  • Mich, John K.
  • Lein, Edward Sebastian
  • Ting, Jonathan
  • Levi, Boaz P.
  • Hess, Erik
  • Kalume, Franck

Abrégé

Selectively providing voltage-gated sodium channel function sufficient to rescue impaired Nav1.1 function to inhibitory neurons is described. Provided voltage-gated sodium channel function sufficient to rescue impaired Nav1.1 function in inhibitory neurons can be used to treat disorders such as epilepsy, and more particularly, Dravet Syndrome.

Classes IPC  ?

  • A61K 38/17 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant d'animauxPeptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant d'humains
  • A61K 9/00 - Préparations médicinales caractérisées par un aspect particulier
  • A61K 48/00 - Préparations médicinales contenant du matériel génétique qui est introduit dans des cellules du corps vivant pour traiter des maladies génétiquesThérapie génique
  • C07K 14/705 - RécepteursAntigènes de surface cellulaireDéterminants de surface cellulaire
  • C12N 15/86 - Vecteurs viraux

15.

ANTISENSE OLIGONUCLEOTIDES AND ARTIFICIAL EXPRESSION CONSTRUCTS FOR EXPRESSING RNA IN INHIBITORY NEURONS

      
Numéro d'application US2024038566
Numéro de publication 2025/019685
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2024-07-18
Date de publication 2025-01-23
Propriétaire ALLEN INSTITUTE (USA)
Inventeur(s)
  • Gore, Bryan
  • Lein, Edward Sebastian
  • Levi, Boaz P.
  • Liu, Jiatai
  • Martinez, Refugio
  • Mich, John K.
  • Ting, Jonathan

Abrégé

Antisense oligonucleotides and artificial expression constructs for modulating RNA expression in targeted central nervous system cell types are described. The artificial expression constructs can be used to express RNA in GABAergic neurons. Antisense oligonucleotides and artificial expression constructs can be used to rescue sodium voltage-gated channel function to treat disorders such as epilepsy, and more particularly, Dravet Syndrome, among many other uses.

Classes IPC  ?

  • C12N 15/11 - Fragments d'ADN ou d'ARNLeurs formes modifiées
  • C12N 15/113 - Acides nucléiques non codants modulant l'expression des gènes, p. ex. oligonucléotides anti-sens
  • C12N 15/79 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes eucaryotes
  • C12N 15/10 - Procédés pour l'isolement, la préparation ou la purification d'ADN ou d'ARN
  • C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques
  • C12N 15/861 - Vecteurs adénoviraux

16.

ARTIFICIAL EXPRESSION CONSTRUCTS FOR MODULATING GENE EXPRESSION IN CARDIOMYOCYTES

      
Numéro d'application US2024035977
Numéro de publication 2025/006852
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2024-06-28
Date de publication 2025-01-02
Propriétaire ALLEN INSTITUTE (USA)
Inventeur(s)
  • Daigle, Tanya
  • Johansen, Nelson
  • Lein, Edward Sebastian

Abrégé

Artificial expression constructs for modulating gene expression in cardiomyocytes within targeted anatomical regions are described. The artificial expression constructs can be used to express synthetic genes or modify gene expression in cardiomyocytes within targeted anatomical regions including the heart atria and/or heart ventricles.

Classes IPC  ?

  • C12N 15/86 - Vecteurs viraux
  • A61K 35/76 - VirusParticules sous-viralesBactériophages
  • A61P 9/00 - Médicaments pour le traitement des troubles du système cardiovasculaire

17.

METHODS OF PREPARING AND FREEZING BIOLOGICAL SAMPLES FOR ANALYTICAL USE AND ASSOCIATED COMPOSITIONS

      
Numéro d'application US2024014861
Numéro de publication 2024/168076
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2024-02-07
Date de publication 2024-08-15
Propriétaire ALLEN INSTITUTE (USA)
Inventeur(s)
  • Skene, Peter
  • Reading, Julian

Abrégé

Provided herein are methods of preparing a biological sample for analysis. In some embodiments, the methods comprise cryopreserving the cells and assessing biological features. Also provided are methods of analyzing biological samples which have been prepared according to the steps of the present technology. In some embodiments, the methods of the present technology preserve native cell structures of biological samples relative to samples prepared by other methods.

Classes IPC  ?

  • G01N 1/28 - Préparation d'échantillons pour l'analyse
  • C12N 5/0787 - Granulocytes, p. ex. basophiles, éosinophiles, neutrophiles ou mastocytes
  • G01N 1/10 - Dispositifs pour prélever des échantillons à l'état liquide ou fluide

18.

INTEIN-MEDIATED RECONSTITUTION OF VOLTAGE-GATED SODIUM CHANNEL FUNCTION

      
Numéro d'application US2024014080
Numéro de publication 2024/163796
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2024-02-01
Date de publication 2024-08-08
Propriétaire
  • ALLEN INSTITUTE (USA)
  • SEATTLE CHILDREN'S HOSPITAL D/B/A SEATTLE CHILDREN'S RESEARCH INSTITUTE (USA)
Inventeur(s)
  • Gore, Bryan
  • Lein, Edward Sebastian
  • Levi, Boaz P.
  • Martinez, Refugio
  • Mich, John K.
  • Kalume, Franck

Abrégé

Artificial expression constructs for the rescue of voltage-gated sodium channel function using intein-mediated reconstitution of the SCN1A encoded protein, voltage-gated sodium channel alpha subunit 1 (Nav1.1) are described. Rescued voltage-gated sodium channel function can be used to treat disorders such as epilepsy, and more particularly, Dravet Syndrome.

Classes IPC  ?

  • C12N 15/86 - Vecteurs viraux
  • A61K 9/00 - Préparations médicinales caractérisées par un aspect particulier
  • A61K 48/00 - Préparations médicinales contenant du matériel génétique qui est introduit dans des cellules du corps vivant pour traiter des maladies génétiquesThérapie génique
  • C07K 14/47 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant d'animauxPeptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant d'humains provenant de vertébrés provenant de mammifères
  • C07K 14/70 - Enképhalines
  • A61P 25/08 - AntiépileptiquesAnticonvulsivants

19.

ARTIFICIAL EXPRESSION CONSTRUCTS FOR MODULATING GENE EXPRESSION IN CELLS WITHIN THE SPINAL CORD

      
Numéro d'application US2024014276
Numéro de publication 2024/163914
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2024-02-02
Date de publication 2024-08-08
Propriétaire ALLEN INSTITUTE (USA)
Inventeur(s)
  • Daigle, Tanya
  • Gao, Yuan
  • Johansen, Nelson
  • Lein, Edward Sebastian
  • Levi, Boaz P.
  • Mich, John K.
  • Tasic, Bosiljka
  • Ting, Jonathan
  • Yao, Zizhen
  • Zeng, Hongkui

Abrégé

Artificial expression constructs for modulating gene expression in targeted central nervous system cell types are described. The artificial expression constructs can be used to express synthetic genes or modify gene expression in the spinal cord spinal motor neurons including Spp1 spinal motor neurons, Parg spinal motor neurons, Ogdh1 spinal motor neurons, or ChAT spinal motor neurons; alpha motor neurons including Chodl spinal motor neurons; gamma motor neurons; spinal excitatory motor neurons including Mafa excitatory neurons, Esrrg Trhr excitatory neurons, Slc17a6 spinal cord excitatory neurons; spinal inhibitory neurons including Slc6a5 spinal cord inhibitory neurons; pan spinal neurons including Esrrg spinal motor neurons and pan spinal cord types; cerebrospinal fluid-contacting neurons including Poln spinal motor neurons; and spinal non-neuronal cells including astrocytes and oligodendrocytes.

Classes IPC  ?

  • A61K 48/00 - Préparations médicinales contenant du matériel génétique qui est introduit dans des cellules du corps vivant pour traiter des maladies génétiquesThérapie génique
  • C12N 15/86 - Vecteurs viraux
  • A61K 9/00 - Préparations médicinales caractérisées par un aspect particulier
  • C12N 15/11 - Fragments d'ADN ou d'ARNLeurs formes modifiées

20.

ARTIFICIAL EXPRESSION CONSTRUCTS FOR MODULATING GENE EXPRESSION IN NEURONS WITHIN THE THALAMUS

      
Numéro d'application 18563252
Statut En instance
Date de dépôt 2022-05-20
Date de la première publication 2024-08-01
Propriétaire ALLEN INSTITUTE (USA)
Inventeur(s)
  • Daigle, Tanya
  • Lein, Edward Sebastian
  • Levi, Boaz P.
  • Mich, John K.
  • Mitchell, Amanda
  • Tasic, Bosiljka
  • Ting, Jonathan
  • Weed, Natalie
  • Zeng, Hongkui

Abrégé

Artificial expression constructs for modulating gene expression in targeted central nervous system cell types are described. The artificial expression constructs can be used to express synthetic genes or modify gene expression in GABAergic or glutamatergic neurons within the thalamus. In some cases, the artificial constructs can also be used to express synthetic genes or modify gene expression in neurons within the thalamus as well as a secondary cell type.

Classes IPC  ?

21.

MOLECULAR SIGNATURES OF LONG-TERM COVID-19 AND TREATMENT THEREOF

      
Numéro d'application 18557406
Statut En instance
Date de dépôt 2022-04-28
Date de la première publication 2024-07-04
Propriétaire
  • ALLEN INSTITUTE (USA)
  • FRED HUTCHINSON CANCER CENTER (USA)
Inventeur(s)
  • Bumol, Thomas F.
  • Li, Xiaojun
  • Skene, Peter
  • Szeto, Gregory Lee
  • Talla, Aarthi
  • Torgerson, Troy
  • Pebworth, Mark-Phillip
  • Vasaikar, Suhas
  • Mcelrath, Juliana M.

Abrégé

In various embodiments, provided are immune response signatures that can be used for the diagnosis, monitoring, and treatment of long-term diseases and inflammatory disorders caused by viral infections. In some embodiments, the viral infection is SARS-CoV-2 infection. In some embodiments, the long-term disease is post-acute sequelae of SARS-CoV-2 infection (PASC).

Classes IPC  ?

  • G01N 33/569 - Tests immunologiquesTests faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiquesMatériaux à cet effet pour micro-organismes, p. ex. protozoaires, bactéries, virus

22.

SELECTIVE-PLANE ILLUMINATION MICROSCOPY WITH HIGH ÉTENDUE AND LONG WORKING DISTANCE OBJECTIVE LENSES

      
Numéro d'application US2023083330
Numéro de publication 2024/129575
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2023-12-11
Date de publication 2024-06-20
Propriétaire ALLEN INSTITUTE (USA)
Inventeur(s)
  • Glaser, Adam
  • Chandrashekar, Jayaram
  • Svoboda, Karel

Abrégé

An expansion-assisted selective plane illumination microscope (ExA-SPIM) has diffraction- limited and aberration-free performance over a large field of view (e.g., 85 mm2) and working distance (e.g., 35 mm). ExA-SPIM enables molecular imaging across three- dimensional samples with high imaging throughput for applications in biology and neuroscience. Combined with new tissue clearing and expansion methods, ExA-SPIM allows nanoscale imaging of centimeter-scale samples, including entire mouse brains, with diffraction-limited resolutions and high contrast without sectioning. ExA-SPIM can be used to reconstruct individual neurons across the mouse brain, image cortico-spinal neurons in the macaque motor cortex, and trace axons in human white matter.

Classes IPC  ?

  • G01N 21/63 - Systèmes dans lesquels le matériau analysé est excité de façon à ce qu'il émette de la lumière ou qu'il produise un changement de la longueur d'onde de la lumière incidente excité optiquement
  • G01N 21/64 - FluorescencePhosphorescence
  • G02B 21/06 - Moyens pour éclairer un échantillon
  • G01N 21/62 - Systèmes dans lesquels le matériau analysé est excité de façon à ce qu'il émette de la lumière ou qu'il produise un changement de la longueur d'onde de la lumière incidente
  • G02B 21/00 - Microscopes

23.

ARTIFICIAL EXPRESSION CONSTRUCTS FOR MODULATING GENE EXPRESSION IN CLAUSTRUM NEURONS

      
Numéro d'application 18285188
Statut En instance
Date de dépôt 2022-03-30
Date de la première publication 2024-06-06
Propriétaire Allen Institute (USA)
Inventeur(s)
  • Daigle, Tanya
  • Graybuck, Lucas T.
  • Sedeño Cortés, Adriana Estela
  • Tasic, Bosiljka
  • Ting, Jonathan

Abrégé

Artificial expression constructs for modulating gene expression in targeted central nervous system cell types are described. The artificial expression constructs can be used to express synthetic genes or modify gene expression in claustrum neurons including L6 IT Car3 neurons.

Classes IPC  ?

  • C12N 15/86 - Vecteurs viraux
  • A61K 48/00 - Préparations médicinales contenant du matériel génétique qui est introduit dans des cellules du corps vivant pour traiter des maladies génétiquesThérapie génique
  • C07K 14/47 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant d'animauxPeptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant d'humains provenant de vertébrés provenant de mammifères

24.

Removing independent noise using DeepInterpolation

      
Numéro d'application 17772971
Numéro de brevet 12367557
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2020-10-07
Date de la première publication 2024-05-16
Date d'octroi 2025-07-22
Propriétaire Allen Institute (USA)
Inventeur(s)
  • Lecoq, Jerome Anthony-Jean
  • Oliver, Michael David
  • Siegle, Joshua Handman
  • Koch, Christof

Abrégé

A facility for transforming a subject data item sequence is described. The facility accesses a trained relationship model. For each of a plurality of subject items of the subject data item sequence, the facility: selects a first contiguous series of items of the subject data item sequence immediately before the subject data item; selects a second contiguous series of items of the subject data item sequence immediately after the subject data item; and applies the trained relationship model to the selected first and second contiguous series of data items to obtain a denoised version of the subject data item. The facility then assembles the obtained denoised subject data items into a denoised data item sequence.

Classes IPC  ?

  • G06T 5/70 - DébruitageLissage
  • G06T 5/50 - Amélioration ou restauration d'image utilisant plusieurs images, p. ex. moyenne ou soustraction

25.

ARTIFICIAL EXPRESSION CONSTRUCTS FOR MODULATING GENE EXPRESSION IN GABAERGIC NEURONS AND ASTROCYTES

      
Numéro d'application 18263930
Statut En instance
Date de dépôt 2022-02-02
Date de la première publication 2024-04-11
Propriétaire Allen Institute (USA)
Inventeur(s)
  • Gore, Bryan
  • Lein, Edward Sebastian
  • Levi, Boaz P.
  • Machen, Deja
  • Martinez, Refugio
  • Mich, John K.
  • Ting, Jonathan

Abrégé

Artificial expression constructs for modulating gene expression in GABAergic neurons and astrocytes are described. The artificial expression constructs can be used to express SLC6A1 for the treatment of SLC6A1-associated disorders, among other uses.

Classes IPC  ?

  • C12N 15/86 - Vecteurs viraux
  • A61K 48/00 - Préparations médicinales contenant du matériel génétique qui est introduit dans des cellules du corps vivant pour traiter des maladies génétiquesThérapie génique

26.

ELECTRICAL STIMULATION ENTRAINMENT OF TARGETED NEURONAL CELL TYPES

      
Numéro d'application 18255813
Statut En instance
Date de dépôt 2021-12-02
Date de la première publication 2024-03-28
Propriétaire Allen Institute (USA)
Inventeur(s)
  • Anastassiou, Constantinos
  • Lee, Soo Yeun

Abrégé

Electrostimulating waveforms offering simultaneous and controllable cell-type-specific entrainment are described. The waveforms selectively entrain excitatory versus inhibitory cortical and hippocampal neurons including pyramidal neurons, parvalbumin neurons, and somatostatin neurons. The embodiment provides targeted electrical stimulation (ES) entrainment of excitatory versus inhibitory neurons. For example, the current disclosure provides methods of selectively entraining excitatory neurons with ES frequencies below 30 Hertz (Hz) and in particular embodiments to frequencies below 15 Hz, such as 8 Hz and 4 Hz. The current disclosure also provides methods of selectively entraining inhibitory neurons to ES frequencies of at least 30 Hz and depending on the type of inhibitory neuron, utilizing a frequency that is 30-60 Hz or a frequency that is greater than 100 Hz.

Classes IPC  ?

  • A61N 1/36 - Application de courants électriques par électrodes de contact courants alternatifs ou intermittents pour stimuler, p. ex. stimulateurs cardiaques
  • A61N 1/05 - Électrodes à implanter ou à introduire dans le corps, p. ex. électrode cardiaque

27.

ARTIFICIAL EXPRESSION CONSTRUCTS FOR MODULATING GENE EXPRESSION IN CHANDELIER CELLS

      
Numéro d'application 18252498
Statut En instance
Date de dépôt 2021-11-10
Date de la première publication 2024-01-18
Propriétaire Allen Institute (USA)
Inventeur(s)
  • Daigle, Tanya
  • Graybuck, Lucas T.
  • Kalmbach, Brian Edward
  • Lein, Edward Sebastian
  • Mich, John K.
  • Levi, Boaz P.
  • Sedeño Cortés, Adriana Estela
  • Tasic, Bosiljka
  • Ting, Jonathan
  • Zeng, Hongkui

Abrégé

Artificial expression constructs for modulating gene expression in targeted central nervous system cell types are described. The artificial expression constructs can be used to express synthetic genes or modify gene expression in chandelier cells. Chandelier cells are a subtype of GABAergic interneurons that that have been implicated in disorders such as epilepsy and schizophrenia.

Classes IPC  ?

28.

ARTIFICIAL EXPRESSION CONSTRUCTS FOR MODULATING GENE EXPRESSION IN NON-NEURONAL CENTRAL NERVOUS SYSTEM CELLS

      
Numéro d'application US2023068369
Numéro de publication 2023/245013
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2023-06-13
Date de publication 2023-12-21
Propriétaire ALLEN INSTITUTE (USA)
Inventeur(s)
  • Lein, Edward Sebastian
  • Levi, Boaz P.
  • Martinez, Refugio
  • Mich, John K.
  • Opitz-Araya, Ximena
  • Ting, Jonathan

Abrégé

To fully understand the biology of the brain, different cell types need to be distinguished and defined and, to further study them, artificial expression constructs that can label and perturb them need to be identified, in mouse, recombinase driver lines have been used to great effect to label cell populations that share marker gene expression. However, the creation, maintenance, and use of such lines that label cell types with high specificity can be costly, frequently requiring triple transgenic crosses, which yield a low frequency of experimental animals. Artificial expression constructs for modulating gene expression in targeted central nervous system cell types are described. The artificial expression constructs can be used to express synthetic genes or modify gene expression in non-neuronal cells including oligodendrocytes, microglia, astrocytes, or endothelial cells.

Classes IPC  ?

  • C12N 15/85 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes eucaryotes pour cellules animales
  • A01K 67/027 - Nouvelles races ou races modifiées de vertébrés
  • A61K 48/00 - Préparations médicinales contenant du matériel génétique qui est introduit dans des cellules du corps vivant pour traiter des maladies génétiquesThérapie génique
  • C12N 15/63 - Introduction de matériel génétique étranger utilisant des vecteursVecteurs Utilisation d'hôtes pour ceux-ciRégulation de l'expression
  • C12N 15/86 - Vecteurs viraux
  • A61P 25/28 - Médicaments pour le traitement des troubles du système nerveux des troubles dégénératifs du système nerveux central, p. ex. agents nootropes, activateurs de la cognition, médicaments pour traiter la maladie d'Alzheimer ou d'autres formes de démence
  • C12N 5/0735 - Cellules souches embryonnairesCellules germinales embryonnaires

29.

SYSTEMS, DEVICES, AND METHODS FOR COMPOUND SCREENING USING PREDICTIVE TAGGING

      
Numéro d'application 18005077
Statut En instance
Date de dépôt 2021-07-28
Date de la première publication 2023-10-26
Propriétaire ALLEN INSTITUTE (USA)
Inventeur(s)
  • Johnson, Gregory
  • Ounkomol, Chawin
  • Collman, Forrest
  • Seshamani, Sharmishtaa
  • Gaudreault, Nathalie
  • Yan, Calysta
  • Chen, Jianxu
  • Rafelski, Susanne

Abrégé

The present invention provides various methods for screening one or more compounds, suitably using non-invasive visual methods and neural networks for generating predicted fluorescence images of cells, to assess an effect of the compound on the cell, as well as to classify a compound or to determine an activity of a compound. Also provided are systems and methods for carrying out such assessments.

Classes IPC  ?

30.

ARTIFICIAL EXPRESSION CONSTRUCTS FOR MODULATING GENE EXPRESSION IN STRIATAL NEURONS

      
Numéro d'application 18040961
Statut En instance
Date de dépôt 2021-08-13
Date de la première publication 2023-09-28
Propriétaire Allen Institute (USA)
Inventeur(s)
  • Daigle, Tanya
  • Lein, Edward Sebastian
  • Levi, Boaz P.
  • Mich, John K.
  • Tasic, Bosiljka
  • Ting, Jonathan
  • Zeng, Hongkui

Abrégé

Artificial expression constructs for modulating gene expression in striatal neurons are described. The artificial expression constructs can be used to express heterologous genes in striatal neurons including in striatal medium spiny neuron-pan, striatal medium spiny neuron-indirect pathway, striatal medium spiny neuron-direct pathway, striatal interneuron-cholinergic, and Drd3+ medium spiny neurons in olfactory tubercle. The artificial expression constructs can be used for many purposes, including to research and treat movement disorders such as Parkinson's disease and Huntington's disease.

Classes IPC  ?

  • A61K 48/00 - Préparations médicinales contenant du matériel génétique qui est introduit dans des cellules du corps vivant pour traiter des maladies génétiquesThérapie génique
  • C12N 9/88 - Lyases (4.)
  • C12N 15/86 - Vecteurs viraux
  • C12N 15/113 - Acides nucléiques non codants modulant l'expression des gènes, p. ex. oligonucléotides anti-sens

31.

Systems, devices, and methods for image processing to generate an image having predictive tagging

      
Numéro d'application 18170076
Numéro de brevet 12008764
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2023-02-16
Date de la première publication 2023-09-07
Date d'octroi 2024-06-11
Propriétaire ALLEN INSTITUTE (USA)
Inventeur(s)
  • Johnson, Gregory
  • Ounkomol, Chawin
  • Collman, Forrest
  • Seshamani, Sharmishtaa

Abrégé

A computing device, method, system, and instructions in a non-transitory computer-readable medium for performing image analysis on 3D microscopy images to predict localization and/or labeling of various structures or objects of interest, by predicting the location in such images at which a dye or other marker associated with such structures would appear. The computing device, method, and system receives sets of 3D images that include unlabeled images, such as transmitted light images or electron microscope images, and labeled images, such as images captured with fluorescence tagging. The computing device trains a statistical model to associate structures in the labeled images with the same structures in the unlabeled light images. The processor further applies the statistical model to a new unlabeled image to generate a predictive labeled image that predicts the location of a structure of interest in the new image.

Classes IPC  ?

  • G06T 7/11 - Découpage basé sur les zones
  • G02B 21/00 - Microscopes
  • G06N 3/045 - Combinaisons de réseaux
  • G06N 3/08 - Méthodes d'apprentissage
  • G06N 20/20 - Techniques d’ensemble en apprentissage automatique
  • G06T 7/174 - DécoupageDétection de bords impliquant l'utilisation de plusieurs images
  • G06T 7/187 - DécoupageDétection de bords impliquant des croissances de zonesDécoupageDétection de bords impliquant des fusions de zonesDécoupageDétection de bords impliquant un étiquetage de composantes connexes
  • G06V 10/25 - Détermination d’une région d’intérêt [ROI] ou d’un volume d’intérêt [VOI]
  • G06V 10/50 - Extraction de caractéristiques d’images ou de vidéos en effectuant des opérations dans des blocs d’imagesExtraction de caractéristiques d’images ou de vidéos en utilisant des histogrammes, p. ex. l’histogramme de gradient orienté [HoG]Extraction de caractéristiques d’images ou de vidéos en utilisant l’addition des valeurs d’intensité d’imageAnalyse de projection
  • G06V 10/764 - Dispositions pour la reconnaissance ou la compréhension d’images ou de vidéos utilisant la reconnaissance de formes ou l’apprentissage automatique utilisant la classification, p. ex. des objets vidéo
  • G06V 20/69 - Objets microscopiques, p. ex. cellules biologiques ou pièces cellulaires

32.

ARTIFICIAL EXPRESSION CONSTRUCTS FOR MODULATING GENE EXPRESSION IN DOPAMINERGIC NEURONS

      
Numéro d'application US2023063259
Numéro de publication 2023/164643
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2023-02-24
Date de publication 2023-08-31
Propriétaire ALLEN INSTITUTE (USA)
Inventeur(s)
  • Daigle, Tanya
  • Lein, Edward Sebastian
  • Levi, Boaz P.
  • Tasic, Bosiljka
  • Ting, Jonathan
  • Zeng, Hongkui

Abrégé

Artificial expression constructs for modulating gene expression in targeted central nervous system cell types are described. The artificial expression constructs can be used to express synthetic genes or modify gene expression in dopaminergic neurons of the central nervous system. Wherein, an artificial expression construct comprising (i) an enhancer is eHGT 888m.

Classes IPC  ?

  • C12N 15/79 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes eucaryotes

33.

Systems, devices, and methods for quality control of cell production using predictive tagging

      
Numéro d'application 18041086
Numéro de brevet 12399100
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2021-08-11
Date de la première publication 2023-08-24
Date d'octroi 2025-08-26
Propriétaire ALLEN INSTITUTE (USA)
Inventeur(s)
  • Johnson, Gregory
  • Ounkomol, Chawin
  • Collman, Forrest
  • Seshamani, Sharmishtaa
  • Kranda, Michael

Abrégé

The present invention provides various methods for easily assessing cell quality of a cell production process, suitably using non-invasive visual methods and neural networks for generating predictive fluorescence images of cells to assess quality attributes. Also provided are systems and methods for carrying out such processes.

Classes IPC  ?

  • G01N 15/0227 - Recherche de la dimension ou de la distribution des dimensions des particules par des moyens optiques utilisant l’imagerieRecherche de la dimension ou de la distribution des dimensions des particules par des moyens optiques utilisant l’holographie
  • G01N 15/1429 - Traitement du signal
  • G01N 15/1433 - Traitement du signal utilisant la reconnaissance d’image
  • G01N 15/1434 - Dispositions optiques

34.

ARTIFICIAL EXPRESSION CONSTRUCTS FOR SELECTIVELY MODULATING GENE EXPRESSION IN INHIBITORY NEOCORTICAL NEURONS

      
Numéro d'application 18000574
Statut En instance
Date de dépôt 2021-06-04
Date de la première publication 2023-07-06
Propriétaire Allen Institute (USA)
Inventeur(s)
  • Daigle, Tanya
  • Graybuck, Lucas T.
  • Lein, Edward Sebastian
  • Levi, Boaz P.
  • Mich, John K.
  • Sedeño Cortés, Adriana Estela
  • Tasic, Bosiljka
  • Ting, Jonathan
  • Walker, Miranda
  • Zeng, Hongkui

Abrégé

Artificial expression constructs for selectively modulating gene expression in selected central nervous system cell types are described. The artificial expression constructs can be used to selectively express synthetic genes or modify gene expression in inhibitory neocortical GABAergic neurons including somatostatin GABAergic neurons, parvalbumin GABAergic neurons, vasointestinal peptide GABAergic neurons, Lamp5 GABAergic neurons, and in some instances astrocytes.

Classes IPC  ?

  • C12N 15/86 - Vecteurs viraux
  • C12N 15/11 - Fragments d'ADN ou d'ARNLeurs formes modifiées
  • A61K 9/00 - Préparations médicinales caractérisées par un aspect particulier

35.

MOLECULAR SIGNATURES FOR CELL TYPING AND MONITORING IMMUNE HEALTH

      
Numéro d'application US2022081977
Numéro de publication 2023/115065
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2022-12-19
Date de publication 2023-06-22
Propriétaire ALLEN INSTITUTE (USA)
Inventeur(s)
  • Bumol, Thomas F.
  • Li, Xiao-Jun
  • Savage, Adam
  • Skene, Peter
  • Torgerson, Troy
  • Vasaikar, Suhas

Abrégé

Provided herein are methods, devices, and systems comprising identification of a panel of gene markers useful for immune cell typing and identifying, detecting, and/or monitoring disease conditions in a subject in need thereof, including infections, cancer and autoimmune conditions. The methods also provide for assays for determining the levels of said markers prior to and after treatment of a condition in the subject, wherein the condition is impacted by one or more factors including age, occupation or environment of the subject.

Classes IPC  ?

  • C12Q 1/6883 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes pour les maladies provoquées par des altérations du matériel génétique
  • G16B 25/10 - Profilage de l’expression de gènes ou de protéinesEstimation ou normalisation de ratio d’expression
  • C12Q 1/689 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes pour la détection ou l’identification d’organismes pour les bactéries
  • C12Q 1/6893 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes pour la détection ou l’identification d’organismes pour les protozoaires
  • C12Q 1/37 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir une hydrolase faisant intervenir une peptidase ou une protéinase

36.

ARTIFICIAL EXPRESSION CONSTRUCTS FOR MODULATING GENE EXPRESSION IN NEOCORTICAL LAYER 4 OR LAYER 5 INTRATELENCEPHALIC NEURONS

      
Numéro d'application US2022081114
Numéro de publication 2023/108021
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2022-12-07
Date de publication 2023-06-15
Propriétaire ALLEN INSTITUTE (USA)
Inventeur(s)
  • Lein, Edward Sebastian
  • Levi, Boaz P.
  • Ting, Jonathan

Abrégé

Artificial expression constructs for modulating gene expression in targeted central nervous system cell types are described. The artificial expression constructs can be used to express synthetic genes or modify gene expression in neocortical layer 4 (L4) intratelencephalic (IT) neurons and/or neocortical L5 IT neurons.

Classes IPC  ?

  • C12N 15/85 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes eucaryotes pour cellules animales
  • G01N 33/569 - Tests immunologiquesTests faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiquesMatériaux à cet effet pour micro-organismes, p. ex. protozoaires, bactéries, virus
  • A61K 48/00 - Préparations médicinales contenant du matériel génétique qui est introduit dans des cellules du corps vivant pour traiter des maladies génétiquesThérapie génique
  • A61P 25/28 - Médicaments pour le traitement des troubles du système nerveux des troubles dégénératifs du système nerveux central, p. ex. agents nootropes, activateurs de la cognition, médicaments pour traiter la maladie d'Alzheimer ou d'autres formes de démence

37.

ARTIFICIAL EXPRESSION CONSTRUCTS FOR SELECTIVELY MODULATING GENE EXPRESSION IN NEOCORTICAL LAYER 5 GLUTAMATERGIC NEURONS

      
Numéro d'application 17996910
Statut En instance
Date de dépôt 2021-04-21
Date de la première publication 2023-05-25
Propriétaire ALLEN INSTITUTE (USA)
Inventeur(s)
  • Daigle, Tanya
  • Graybuck, Lucas T.
  • Kalmbach, Brian Edward
  • Lein, Edward Sebastian
  • Levi, Boaz P.
  • Mich, John K.
  • Sedeño Cortés, Adriana Estela
  • Tasic, Bosiljka
  • Ting, Jonathan
  • Zeng, Hongkui

Abrégé

Artificial expression constructs for selectively modulating gene expression in selected central nervous system cell types are described. Particularly, the artificial expression constructs can be used to selectively express synthetic genes and/or modify gene expression in neocortical glutamatergic layer 5 neurons, such as glutamatergic layer 5 extratelencephalic-projecting (L5 ET) neurons.

Classes IPC  ?

38.

ARTIFICIAL EXPRESSION CONSTRUCTS FOR SELECTIVELY MODULATING GENE EXPRESSION IN NON-NEURONAL BRAIN CELLS

      
Numéro d'application 17907385
Statut En instance
Date de dépôt 2021-03-26
Date de la première publication 2023-04-20
Propriétaire ALLEN INSTITUTE (USA)
Inventeur(s)
  • Ting, Jonathan
  • Tasic, Bosiljka
  • Levi, Boaz P.
  • Daigle, Tanya
  • Graybuck, Lucas T.
  • Lein, Edward Sebastian
  • Mich, John K.
  • Sedeño Cortés, Adriana Estela
  • Zeng, Hongkui

Abrégé

Artificial expression constructs for selectively modulating gene expression in selected central nervous system cell types are described. The artificial expression constructs can be used to selectively express synthetic genes or modify gene expression in astrocytes, oligodendrocytes, microglia, pericytes, SMC, or endothelial cells.

Classes IPC  ?

  • C12N 15/85 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes eucaryotes pour cellules animales

39.

ARTIFICIAL EXPRESSION CONSTRUCTS FOR MODULATING GENE EXPRESSION IN THE CEREBELLUM AND A SECONDARY CELL TYPE

      
Numéro d'application US2022077586
Numéro de publication 2023/060112
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2022-10-05
Date de publication 2023-04-13
Propriétaire ALLEN INSTITUTE (USA)
Inventeur(s)
  • Daigle, Tanya
  • Lein, Edward Sebastian
  • Levi, Boaz P.
  • Tasic, Bosiljka
  • Ting, Jonathan
  • Zeng, Hongkui
  • Mich, John K.

Abrégé

Artificial expression constructs for modulating gene expression in targeted central nervous system cell types are described. The artificial expression constructs can be used to express synthetic genes or modify gene expression in a cerebellar cell type and a secondary cell type.

Classes IPC  ?

  • C12N 15/63 - Introduction de matériel génétique étranger utilisant des vecteursVecteurs Utilisation d'hôtes pour ceux-ciRégulation de l'expression
  • C12N 15/67 - Méthodes générales pour favoriser l'expression
  • A61K 35/76 - VirusParticules sous-viralesBactériophages

40.

ARTIFICIAL EXPRESSION CONSTRUCTS FOR MODULATING GENE EXPRESSION IN NEURONS WITHIN THE THALAMUS

      
Numéro d'application US2022030371
Numéro de publication 2022/246276
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2022-05-20
Date de publication 2022-11-24
Propriétaire ALLEN INSTITUTE (USA)
Inventeur(s)
  • Daigle, Tanya
  • Lein, Edward Sebastian
  • Levi, Boaz P.
  • Mich, John K.
  • Mitchell, Amanda
  • Tasic, Bosiljka
  • Ting, Jonathan
  • Weed, Natalie
  • Zeng, Hongkui

Abrégé

Artificial expression constructs for modulating gene expression in targeted central nervous system cell types are described. The artificial expression constructs can be used to express synthetic genes or modify gene expression in GABAergic or glutamatergic neurons within the thalamus. In some cases, the artificial constructs can also be used to express synthetic genes or modify gene expression in neurons within the thalamus as well as a secondary cell type.

Classes IPC  ?

  • C12N 15/79 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes eucaryotes
  • C12N 15/86 - Vecteurs viraux

41.

MOLECULAR SIGNATURES OF LONG-TERM COVID-19 AND TREATMENT THEREOF

      
Numéro d'application US2022026841
Numéro de publication 2022/232463
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2022-04-28
Date de publication 2022-11-03
Propriétaire
  • ALLEN INSTITUTE (USA)
  • FRED HUTCHINSON CANCER CENTER (USA)
Inventeur(s)
  • Bumol, Thomas F.
  • Li, Xiaojun
  • Skene, Peter
  • Szeto, Gregory Lee
  • Talla, Aarthi
  • Torgerson, Troy
  • Pebworth, Mark-Phillip
  • Vasaikar, Suhas
  • Mcelrath, M. Juliana

Abrégé

In various embodiments, provided are immune response signatures that can be used for the diagnosis, monitoring, and treatment of long-term diseases and inflammatory disorders caused by viral infections. In some embodiments, the viral infection is SARS-CoV-2 infection. In some embodiments, the long-term disease is post-acute sequelae of SARS-CoV-2 infection (PASC).

Classes IPC  ?

  • A61K 39/215 - Coronaviridae, p. ex. virus de la bronchite infectieuse aviaire
  • C07K 14/165 - Coronaviridae, p. ex. virus de la bronchite infectieuse aviaire
  • C07K 14/52 - CytokinesLymphokinesInterférons
  • C07K 14/525 - Facteur de nécrose de tumeurs [TNF]
  • C07K 14/54 - Interleukines [IL]
  • C12Q 1/6883 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes pour les maladies provoquées par des altérations du matériel génétique

42.

ARTIFICIAL EXPRESSION CONSTRUCTS FOR MODULATING GENE EXPRESSION IN CLAUSTRUM NEURONS

      
Numéro d'application US2022022656
Numéro de publication 2022/212585
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2022-03-30
Date de publication 2022-10-06
Propriétaire ALLEN INSTITUTE (USA)
Inventeur(s)
  • Daigle, Tanya
  • Graybuck, Lucas T.
  • Sedeno Cortes, Adriana Estela
  • Tasic, Bosiljka
  • Ting, Jonathan

Abrégé

Artificial expression constructs for modulating gene expression in targeted central nervous system cell types are described. The artificial expression constructs can be used to express synthetic genes or modify gene expression in claustrum neurons including L6 IT Car3 neurons.

Classes IPC  ?

  • A61K 48/00 - Préparations médicinales contenant du matériel génétique qui est introduit dans des cellules du corps vivant pour traiter des maladies génétiquesThérapie génique
  • C12N 15/09 - Technologie d'ADN recombinant
  • C12N 15/11 - Fragments d'ADN ou d'ARNLeurs formes modifiées
  • C12N 15/12 - Gènes codant pour des protéines animales

43.

ARTIFICIAL EXPRESSION CONSTRUCTS FOR SELECTIVELY MODULATING GENE EXPRESSION IN SELECTED NEURONAL CELL POPULATIONS

      
Numéro d'application 17431079
Statut En instance
Date de dépôt 2020-02-14
Date de la première publication 2022-08-11
Propriétaire Allen Institute (USA)
Inventeur(s)
  • Ting, Jonathan
  • Levi, Boaz P.
  • Tasic, Bosiljka
  • Mich, John K.
  • Hess, Erik
  • Lein, Edward Sebastian
  • Graybuck, Lucas T.
  • Daigle, Tanya
  • Zeng, Hongkui

Abrégé

Artificial expression constructs for selectively modulating gene expression in selected central nervous system cell types are described. The artificial expression constructs can be used to selectively express synthetic genes or modify gene expression in GABAergic neurons generally; and/or GABAergic neuron cell types such as lysosomal associated membrane protein 5 (Lamp5) neurons; vasoactive intestinal polypeptide-expressing (Vip) neurons; somatostatin (Sst) neurons; and/or parvalbumin (Pvalb) neuron cell types. Certain artificial expression constructs additionally drive selective gene expression in Layer 4 and/or layer 5 intratelencephalic (IT) neurons, deep cerebellar nuclear neurons or cerebellar Purkinje cells.

Classes IPC  ?

  • A61K 48/00 - Préparations médicinales contenant du matériel génétique qui est introduit dans des cellules du corps vivant pour traiter des maladies génétiquesThérapie génique
  • C12N 5/0793 - Neurones
  • C12N 7/00 - Virus, p. ex. bactériophagesCompositions les contenantLeur préparation ou purification
  • C12N 15/86 - Vecteurs viraux
  • C12N 15/85 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes eucaryotes pour cellules animales
  • C12N 9/22 - Ribonucléases
  • C12N 15/11 - Fragments d'ADN ou d'ARNLeurs formes modifiées
  • A01K 67/027 - Nouvelles races ou races modifiées de vertébrés

44.

Systems and methods for using an ontology to generate database entries and access and search a database

      
Numéro d'application 17617514
Numéro de brevet 11914631
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2020-07-15
Date de la première publication 2022-08-11
Date d'octroi 2024-02-27
Propriétaire Allen Institute (USA)
Inventeur(s) Acharya, Gautham Bhat

Abrégé

A system, apparatus and methods for generating database entries and tools for accessing and searching a database from an Ontology. Starting with an Ontology used to represent data and relationships between data, the system and methods described enable that data to be stored in a desired type of database and accessed using an API and search query generated from the Ontology. Embodiments provide a structure and process to implement a data access system or framework that can be used to unify and better understand information across an organization's entire set of data. Such a framework can help enable and improve the organization and discovery of knowledge, increase the value of existing data, and reduce complexity when developing next-generation applications.

Classes IPC  ?

  • G06F 16/36 - Création d’outils sémantiques, p. ex. ontologie ou thésaurus
  • G06F 16/25 - Systèmes d’intégration ou d’interfaçage impliquant les systèmes de gestion de bases de données
  • G06F 16/242 - Formulation des requêtes
  • G06F 16/901 - IndexationStructures de données à cet effetStructures de stockage

45.

ARTIFICIAL EXPRESSION CONSTRUCTS FOR MODULATING GENE EXPRESSION IN GABAERGIC NEURONS AND ASTROCYTES

      
Numéro d'application US2022014956
Numéro de publication 2022/169884
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2022-02-02
Date de publication 2022-08-11
Propriétaire ALLEN INSTITUTE (USA)
Inventeur(s)
  • Gore, Bryan
  • Lein, Edward Sebastian
  • Levi, Boaz P.
  • Machen, Deja
  • Martinez, Refugio
  • Mich, John K.
  • Ting, Jonathan

Abrégé

Artificial expression constructs for modulating gene expression in GABAergic neurons and astrocytes are described. The artificial expression constructs can be used to express SLC6A1 for the treatment of SLC6A1-associated disorders, among other uses.

Classes IPC  ?

  • A61K 31/7088 - Composés ayant au moins trois nucléosides ou nucléotides
  • A61K 31/712 - Acides nucléiques ou oligonucléotides ayant des sucres modifiés, c.-à-d. autres que le ribose ou le 2'-désoxyribose
  • A61K 31/7105 - Acides ribonucléiques naturels, c.-à-d. contenant uniquement des riboses liés à l'adénine, la guanine, la cytosine ou l'uracile et ayant des liaisons 3'-5' phosphodiester
  • A61K 31/7125 - Acides nucléiques ou oligonucléotides ayant des liaisons internucléosides modifiées, c.-à-d. autres que des liaisons 3'-5' phosphodiester
  • A61K 31/7115 - Acides nucléiques ou oligonucléotides ayant des bases modifiées, c.-à-d. autres que l'adénine, la guanine, la cytosine, l'uracile ou la thymine

46.

ELECTRICAL STIMULATION ENTRAINMENT OF TARGETED NEURONAL CELL TYPES

      
Numéro d'application US2021061592
Numéro de publication 2022/120035
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2021-12-02
Date de publication 2022-06-09
Propriétaire ALLEN INSTITUTE (USA)
Inventeur(s)
  • Anastassiou, Constantinos
  • Lee, Soo Yeun

Abrégé

Electrostimulating waveforms offering simultaneous and controllable cell-type-specific entrainment are described. The waveforms selectively entrain excitatory versus inhibitory cortical and hippocampal neurons including pyramidal neurons, parvalbumin neurons, and somatostatin neurons. The embodiment provides targeted electrical stimulation (ES) entrainment of excitatory versus inhibitory neurons. For example, the current disclosure provides methods of selectively entraining excitatory neurons with ES frequencies below 30 Hertz (Hz) and in particular embodiments to frequencies below 15 Hz, such as 8 Hz and 4 Hz. The current disclosure also provides methods of selectively entraining inhibitory neurons to ES frequencies of at least 30 Hz and depending on the type of inhibitory neuron, utilizing a frequency that is 30-60 Hz or a frequency that is greater than 100 Hz.

Classes IPC  ?

  • A61N 1/36 - Application de courants électriques par électrodes de contact courants alternatifs ou intermittents pour stimuler, p. ex. stimulateurs cardiaques
  • A61M 21/00 - Autres dispositifs ou méthodes pour amener un changement dans l'état de conscienceDispositifs pour provoquer ou arrêter le sommeil par des moyens mécaniques, optiques ou acoustiques, p. ex. pour mettre en état d'hypnose
  • A61N 1/00 - ÉlectrothérapieCircuits à cet effet
  • A61N 1/18 - Application de courants électriques par électrodes de contact

47.

ARTIFICIAL EXPRESSION CONSTRUCTS FOR MODULATING GENE EXPRESSION IN CHANDELIER CELLS

      
Numéro d'application US2021058812
Numéro de publication 2022/103859
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2021-11-10
Date de publication 2022-05-19
Propriétaire ALLEN INSTITUTE (USA)
Inventeur(s)
  • Daigle, Tanya
  • Graybuck, Lucas T.
  • Kalmbach, Brian Edward
  • Lein, Edward Sebastian
  • Levi, Boaz P.
  • Mich, John K.
  • Sedeno Cortes, Adriana Estela
  • Tasic, Bosiljka
  • Ting, Jonathan
  • Zeng, Hongkui

Abrégé

Artificial expression constructs for modulating gene expression in targeted central nervous system cell types are described. The artificial expression constructs can be used to express synthetic genes or modify gene expression in chandelier cells. Chandelier cells are a subtype of GABAergic interneurons that that have been implicated in disorders such as epilepsy and schizophrenia.

Classes IPC  ?

48.

SYSTEMS, DEVICES, AND METHODS FOR QUALITY CONTROL OF CELL PRODUCTION USING PREDICTIVE TAGGING

      
Numéro d'application US2021045561
Numéro de publication 2022/035973
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2021-08-11
Date de publication 2022-02-17
Propriétaire ALLEN INSTITUTE (USA)
Inventeur(s)
  • Johnson, Gregory
  • Ounkomol, Chawin
  • Collman, Forrest
  • Seshamani, Sharmishtaa
  • Kranda, Michael

Abrégé

The present invention provides various methods for easily assessing cell quality of a cell production process, suitably using non-invasive visual methods and neural networks for generating predictive fluorescence images of cells to assess quality attributes. Also provided are systems and methods for carrying out such processes.

Classes IPC  ?

49.

ARTIFICIAL EXPRESSION CONSTRUCTS FOR MODULATING GENE EXPRESSION IN STRIATAL NEURONS

      
Numéro d'application US2021045995
Numéro de publication 2022/036255
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2021-08-13
Date de publication 2022-02-17
Propriétaire ALLEN INSTITUTE (USA)
Inventeur(s)
  • Daigle, Tanya
  • Lein, Edward Sebastian
  • Levi, Boaz P.
  • Mich, John K.
  • Tasic, Bosiljka
  • Ting, Jonathan
  • Zeng, Hongkui

Abrégé

Artificial expression constructs for modulating gene expression in striatal neurons are described. The artificial expression constructs can be used to express heterologous genes in striatal neurons including in striatal medium spiny neuron-pan, striatal medium spiny neuron-indirect pathway, striatal medium spiny neuron-direct pathway, striatal interneuron-cholinergic, and Drd3+ medium spiny neurons in olfactory tubercle. The artificial expression constructs can be used for many purposes, including to research and treat movement disorders such as Parkinson's disease and Huntington's disease.

Classes IPC  ?

  • C12N 15/11 - Fragments d'ADN ou d'ARNLeurs formes modifiées
  • C12N 15/63 - Introduction de matériel génétique étranger utilisant des vecteursVecteurs Utilisation d'hôtes pour ceux-ciRégulation de l'expression
  • C12N 15/67 - Méthodes générales pour favoriser l'expression
  • C12N 15/85 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes eucaryotes pour cellules animales

50.

SYSTEMS, DEVICES, AND METHODS FOR COMPOUND SCREENING USING PREDICTIVE TAGGING

      
Numéro d'application US2021043430
Numéro de publication 2022/026532
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2021-07-28
Date de publication 2022-02-03
Propriétaire ALLEN INSTITUTE (USA)
Inventeur(s)
  • Johnson, Gregory
  • Ounkomol, Chawin
  • Collman, Forrest
  • Seshamani, Sharmishtaa
  • Gaudreault, Nathalie
  • Yan, Calysta
  • Chen, Jianxu
  • Rafelski, Susanne

Abrégé

The present invention provides various methods for screening one or more compounds, suitably using non-invasive visual methods and neural networks for generating predicted fluorescence images of cells, to assess an effect of the compound on the cell, as well as to classify a compound or to determine an activity of a compound. Also provided are systems and methods for carrying out such assessments.

Classes IPC  ?

51.

ARTIFICIAL EXPRESSION CONSTRUCTS FOR SELECTIVELY MODULATING GENE EXPRESSION IN EXCITATORY CORTICAL NEURONS

      
Numéro d'application 17291584
Statut En instance
Date de dépôt 2019-11-05
Date de la première publication 2021-12-23
Propriétaire Allen Institute (USA)
Inventeur(s)
  • Graybuck, Lucas T.
  • Tasic, Bosiljka
  • Daigle, Tanya
  • Ting, Jonathan
  • Zeng, Hongkui
  • Kalmbach, Brian Edward
  • Mich, John K.
  • Hess, Erik
  • Lein, Edward Sebastian
  • Levi, Boaz P.

Abrégé

Artificial expression constructs for selectively modulating gene expression in selected central nervous system cell types are described. The artificial expression constructs can be used to selectively express synthetic genes or modify gene expression in excitatory cortical neurons, such as primarily within cortical layers 2/3, 4, 5, and 6 and including those with extratelencephalic (ET) projections, intratelencephalic (IT) projections, and pyramidal tract (PT) projections, among others.

Classes IPC  ?

52.

ARTIFICIAL EXPRESSION CONSTRUCTS FOR SELECTIVELY MODULATING GENE EXPRESSION IN INHIBITORY NEOCORTICAL NEURONS

      
Numéro d'application US2021036028
Numéro de publication 2021/248085
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2021-06-04
Date de publication 2021-12-09
Propriétaire ALLEN INSTITUTE (USA)
Inventeur(s)
  • Daigle, Tanya
  • Graybuck, Lucas T.
  • Lein, Edward Sebastian
  • Levi, Boaz P.
  • Mich, John K.
  • Sedeno Cortes, Adriana Estela
  • Tasic, Bosiljka
  • Ting, Jonathan
  • Walker, Miranda
  • Zeng, Hongkui

Abrégé

Lamp5Lamp5 GABAergic neurons, and in some instances astrocytes.

Classes IPC  ?

  • C12N 15/09 - Technologie d'ADN recombinant
  • C12N 15/11 - Fragments d'ADN ou d'ARNLeurs formes modifiées
  • C12N 15/63 - Introduction de matériel génétique étranger utilisant des vecteursVecteurs Utilisation d'hôtes pour ceux-ciRégulation de l'expression
  • C12N 15/67 - Méthodes générales pour favoriser l'expression

53.

Miscellaneous Design

      
Numéro de série 97151186
Statut Enregistrée
Date de dépôt 2021-12-01
Date d'enregistrement 2023-01-03
Propriétaire Allen Institute, DBA ALLEN INSTITUTE FOR BRAIN SCIENCE; ALLEN INSTITUTE FOR CELL SCIENCE; ALLEN INSTITUTE FOR IMMUNOLOGY; ALLEN INSTITUTE FOR NEURAL DYNAMICS; PAUL G. ALLEN FRONTIERS GROUP ()
Classes de Nice  ? 41 - Éducation, divertissements, activités sportives et culturelles

Produits et services

Educational services, namely, providing classes, seminars, workshops and conferences in the fields of neuroscience and cell biology research, and distribution of informational materials therewith

54.

Artificial expression constructs for selectively modulating gene expression in interneurons

      
Numéro d'application 17283232
Numéro de brevet 12467064
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2019-10-03
Date de la première publication 2021-11-11
Date d'octroi 2025-11-11
Propriétaire
  • Allen Institute (USA)
  • Seattle Children's Hospital (USA)
Inventeur(s)
  • Ting, Jonathan
  • Levi, Boaz P.
  • Mich, John K.
  • Lein, Edward Sebastian
  • Kalume, Franck

Abrégé

Artificial expression constructs for selectively modulating gene expression in selected central nervous system cell types are described. The artificial expression constructs can be used to selectively express synthetic genes or modify gene expression in GABAergic interneurons.

Classes IPC  ?

  • C12N 15/86 - Vecteurs viraux
  • A01K 67/0278 - Vertébrés knock-in, p. ex. vertébrés humanisés
  • A61K 35/30 - NerfsCerveauYeuxCellules cornéennesLiquide céphalorachidienCellules souches neuronalesCellules précurseurs neuronalesCellules glialesOligodendrocytesCellules de SchwannAstrogliesAstrocytesPlexus choroïdeTissu de moelle épinière
  • C12N 5/0793 - Neurones

55.

ARTIFICIAL EXPRESSION CONSTRUCTS FOR SELECTIVELY MODULATING GENE EXPRESSION IN NEOCORTICAL LAYER 5 GLUTAMATERGIC NEURONS

      
Numéro d'application US2021028489
Numéro de publication 2021/216778
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2021-04-21
Date de publication 2021-10-28
Propriétaire ALLEN INSTITUTE (USA)
Inventeur(s)
  • Daigle, Tanya
  • Graybuck, Lucas T.
  • Kalmbach, Brian Edward
  • Lein, Edward Sebastian
  • Levi, Boaz P.
  • Mich, John K.
  • Sedeno Cortes, Adriana Estela
  • Tasic, Bosiljka
  • Ting, Jonathan
  • Zeng, Hongkui

Abrégé

Artificial expression constructs for selectively modulating gene expression in selected central nervous system cell types are described. Particularly, the artificial expression constructs can be used to selectively express synthetic genes and / or modify gene expression in neocortical glutamatergic layer 5 neurons, such as glutamatergic layer 5 extratelencephalic-projecting (L5 ET) neurons.

Classes IPC  ?

56.

ARTIFICIAL EXPRESSION CONSTRUCTS FOR SELECTIVELY MODULATING GENE EXPRESSION IN NON-NEURONAL BRAIN CELLS

      
Numéro d'application US2021024525
Numéro de publication 2021/195591
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2021-03-26
Date de publication 2021-09-30
Propriétaire ALLEN INSTITUTE (USA)
Inventeur(s)
  • Ting, Jonathan
  • Tasic, Bosiljka
  • Levi, Boaz P.
  • Daigle, Tanya
  • Graybuck, Lucas T.
  • Lein, Edward Sebastian
  • Mich, John K.
  • Sedeno Cortes, Adriana Estela
  • Zeng, Hongkui

Abrégé

Artificial expression constructs for selectively modulating gene expression in selected central nervous system cell types are described. The artificial expression constructs can be used to selectively express synthetic genes or modify gene expression in astrocytes, oligodendrocytes, microglia, pericytes, SMC, or endothelial cells.

Classes IPC  ?

  • C12N 15/67 - Méthodes générales pour favoriser l'expression
  • C12N 15/85 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes eucaryotes pour cellules animales
  • A61K 48/00 - Préparations médicinales contenant du matériel génétique qui est introduit dans des cellules du corps vivant pour traiter des maladies génétiquesThérapie génique

57.

Systems, devices, and methods for image processing to generate an image having predictive tagging

      
Numéro d'application 17148192
Numéro de brevet 11614610
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2021-01-13
Date de la première publication 2021-06-10
Date d'octroi 2023-03-28
Propriétaire ALLEN INSTITUTE (USA)
Inventeur(s)
  • Johnson, Gregory
  • Ounkomol, Chawin
  • Collman, Forrest
  • Seshamani, Sharmishtaa

Abrégé

A computing device, method, system, and instructions in a non-transitory computer-readable medium for performing image analysis on 3D microscopy images to predict localization and/or labeling of various structures or objects of interest, by predicting the location in such images at which a dye or other marker associated with such structures would appear. The computing device, method, and system receives sets of 3D images that include unlabeled images, such as transmitted light images or electron microscope images, and labeled images, such as images captured with fluorescence tagging. The computing device trains a statistical model to associate structures in the labeled images with the same structures in the unlabeled light images. The processor further applies the statistical model to a new unlabeled image to generate a predictive labeled image that predicts the location of a structure of interest in the new image.

Classes IPC  ?

  • G02B 21/00 - Microscopes
  • G06T 7/187 - DécoupageDétection de bords impliquant des croissances de zonesDécoupageDétection de bords impliquant des fusions de zonesDécoupageDétection de bords impliquant un étiquetage de composantes connexes
  • G06T 7/11 - Découpage basé sur les zones
  • G06T 7/174 - DécoupageDétection de bords impliquant l'utilisation de plusieurs images
  • G06N 20/20 - Techniques d’ensemble en apprentissage automatique
  • G06N 3/04 - Architecture, p. ex. topologie d'interconnexion
  • G06N 3/08 - Méthodes d'apprentissage

58.

REMOVING INDEPENDENT NOISE USING DEEPINTERPOLATION

      
Numéro d'application US2020054605
Numéro de publication 2021/086562
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2020-10-07
Date de publication 2021-05-06
Propriétaire ALLEN INSTITUTE (USA)
Inventeur(s)
  • Lecoq, Jerome, Anthony-Jean
  • Oliver, Michael, David
  • Siegle, Joshua, Handman
  • Koch, Christof

Abrégé

A facility for transforming a subject data item sequence is described. The facility accesses a trained relationship model. For each of a plurality of subject items of the subject data item sequence, the facility: selects a first contiguous series of items of the subject data item sequence immediately before the subject data item; selects a second contiguous series of items of the subject data item sequence immediately after the subject data item; and applies the trained relationship model to the selected first and second contiguous series of data items to obtain a denoised version of the subject data item. The facility then assembles the obtained denoised subject data items into a denoised data item sequence.

Classes IPC  ?

  • H04N 5/21 - Circuits pour la suppression ou la diminution de perturbations, p. ex. moiré ou halo
  • H04N 7/01 - Conversion des normes
  • G06N 20/00 - Apprentissage automatique
  • G06T 5/00 - Amélioration ou restauration d'image

59.

BUILDING COMPUTATIONAL TRANSFER FUNCTIONS ON 3D LIGHT MICROSCOPY IMAGES USING DEEP LEARNING

      
Numéro d'application US2020053644
Numéro de publication 2021/067507
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2020-09-30
Date de publication 2021-04-08
Propriétaire
  • ALLEN INSTITUTE (USA)
  • UNIVERSITY OF NOTRE DAME DU LAC (USA)
Inventeur(s)
  • Chen, Jianxu
  • Viana, Matheus Palhares
  • Rafelski, Susanne Marie
  • Wang, Hongxiao
  • Chen, Danny Ziyi
  • Frick, Christopher Lee
  • Sluzewski, Filip

Abrégé

An image transformation facility is described. The facility accesses a machine learning model trained to transform three-dimensional microscopy images in an imaging domain of a source image type into three-dimensional images in an imaging domain of a target image type. The facility also accesses a subject microscopy image in the imaging domain of the source image type. The facility applies the trained machine learning model to the subject microscopy image to obtain a transfer result image in the imaging domain of the target image type.

Classes IPC  ?

  • G06T 3/00 - Transformations géométriques de l'image dans le plan de l'image
  • G06T 7/30 - Détermination des paramètres de transformation pour l'alignement des images, c.-à-d. recalage des images
  • G06T 15/50 - Effets de lumière
  • G06N 3/08 - Méthodes d'apprentissage

60.

Rescuing voltage-gated sodium channel function in inhibitory neurons

      
Numéro d'application 17044232
Numéro de brevet 12121563
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2019-04-09
Date de la première publication 2021-01-21
Date d'octroi 2024-10-22
Propriétaire
  • Allen Institute (USA)
  • Seattle Children's Hospital (USA)
Inventeur(s)
  • Mich, John K.
  • Lein, Edward Sebastian
  • Ting, Jonathan
  • Levi, Boaz P.
  • Hess, Erik
  • Kalume, Franck

Abrégé

Selectively providing voltage-gated sodium channel function sufficient to rescue impaired Nav1.1 function to inhibitory neurons is described. Provided voltage-gated sodium channel function sufficient to rescue impaired Nav1.1 function in inhibitory neurons can be used to treat disorders such as epilepsy, and more particularly, Dravet Syndrome.

Classes IPC  ?

  • A61K 38/17 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant d'animauxPeptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant d'humains
  • A61K 9/00 - Préparations médicinales caractérisées par un aspect particulier
  • A61K 48/00 - Préparations médicinales contenant du matériel génétique qui est introduit dans des cellules du corps vivant pour traiter des maladies génétiquesThérapie génique
  • C07K 14/705 - RécepteursAntigènes de surface cellulaireDéterminants de surface cellulaire
  • C12N 15/86 - Vecteurs viraux

61.

SYSTEMS AND METHODS FOR USING AN ONTOLOGY TO GENERATE DATABASE ENTRIES AND ACCESS AND SEARCH A DATABASE

      
Numéro d'application US2020042186
Numéro de publication 2021/011691
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2020-07-15
Date de publication 2021-01-21
Propriétaire ALLEN INSTITUTE (USA)
Inventeur(s) Acharya, Gautham Bhat

Abrégé

A system, apparatus and methods for generating database entries and tools for accessing and searching a database from an Ontology. Starting with an Ontology used to represent data and relationships between data, the system and methods described enable that data to be stored in a desired type of database and accessed using an API and search query generated from the Ontology. Embodiments provide a structure and process to implement a data access system or framework that can be used to unify and better understand information across an organization's entire set of data. Such a framework can help enable and improve the organization and discovery of knowledge, increase the value of existing data, and reduce complexity when developing next-generation applications.

Classes IPC  ?

  • G06F 7/00 - Procédés ou dispositions pour le traitement de données en agissant sur l'ordre ou le contenu des données maniées
  • G06F 16/00 - Recherche d’informationsStructures de bases de données à cet effetStructures de systèmes de fichiers à cet effet

62.

Systems, apparatuses and methods for simultaneous multi-plane imaging

      
Numéro d'application 16900279
Numéro de brevet 11307143
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2020-06-12
Date de la première publication 2020-10-01
Date d'octroi 2022-04-19
Propriétaire Allen Institute (USA)
Inventeur(s)
  • Tsyboulski, Dmitri
  • Orlova, Natalia
  • Lecoq, Jerome Anthony
  • Saggau, Peter

Abrégé

A system includes a light source to generate an optical signal having a set of pulses at a first repetition rate. The system also includes a multiplexer circuit to generate a multiplexed optical signal from the optical signal n sets of pulses at a second repetition rate, where the n sets of pulses have different polarization states and are at the first repetition rate. The system also includes a focusing unit to split the multiplexed optical signal into n excitation signals to excite a sample. The system also includes an objective to receive the n excitation signals and to illuminate the sample. The objective and the focusing unit collectively focus each excitation signal of the n excitation signals on a different focal plane of the sample to generate a response signal. The system also includes a demultiplexer circuit to generate n emission signals based on the response signal.

Classes IPC  ?

63.

ARTIFICIAL EXPRESSION CONSTRUCTS FOR SELECTIVELY MODULATING GENE EXPRESSION IN SELECTED NEURONAL CELL POPULATIONS

      
Numéro d'application US2020018416
Numéro de publication 2020/168279
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2020-02-14
Date de publication 2020-08-20
Propriétaire ALLEN INSTITUTE (USA)
Inventeur(s)
  • Ting, Jonathan
  • Levi, Boaz P.
  • Tasic, Bosiljka
  • Mich, John K.
  • Hess, Erik
  • Lein, Edward Sebastian
  • Graybuck, Lucas T.
  • Daigle, Tanya
  • Zeng, Hongkui

Abrégé

Artificial expression constructs for selectively modulating gene expression in selected central nervous system cell types are described. The artificial expression constructs can be used to selectively express synthetic genes or modify gene expression in GABAergic neurons generally; and/or GABAergic neuron cell types such as lysosomal associated membrane protein 5 (Lamp5) neurons; vasoactive intestinal polypeptide-expressing (Vip) neurons; somatostatin (Sst) neurons; and/or parvalbumin (Pvalb) neuron cell types. Certain artificial expression constructs additionally drive selective gene expression in Layer 4 and/or layer 5 intratelencephalic (IT) neurons, deep cerebellar nuclear neurons or cerebellar Purkinje cells.

Classes IPC  ?

  • A61K 48/00 - Préparations médicinales contenant du matériel génétique qui est introduit dans des cellules du corps vivant pour traiter des maladies génétiquesThérapie génique
  • C12N 15/09 - Technologie d'ADN recombinant
  • C12N 15/11 - Fragments d'ADN ou d'ARNLeurs formes modifiées
  • C12N 15/63 - Introduction de matériel génétique étranger utilisant des vecteursVecteurs Utilisation d'hôtes pour ceux-ciRégulation de l'expression
  • C12N 15/67 - Méthodes générales pour favoriser l'expression
  • C12N 15/85 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes eucaryotes pour cellules animales

64.

ARTIFICIAL EXPRESSION CONSTRUCTS FOR SELECTIVELY MODULATING GENE EXPRESSION IN EXCITATORY CORTICAL NEURONS

      
Numéro d'application US2019059927
Numéro de publication 2020/097121
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2019-11-05
Date de publication 2020-05-14
Propriétaire ALLEN INSTITUTE (USA)
Inventeur(s)
  • Graybuck, Lucas T.
  • Tasic, Bosiljka
  • Daigle, Tanya
  • Ting, Jonathan
  • Zeng, Hongkui
  • Kalmbach, Brian Edward
  • Mich, John K.
  • Hess, Erik
  • Lein, Edward Sebastian
  • Levi, Boaz P.

Abrégé

Artificial expression constructs for selectively modulating gene expression in selected central nervous system cell types are described. The artificial expression constructs can be used to selectively express synthetic genes or modify gene expression in excitatory cortical neurons, such as primarily within cortical layers 2/3, 4, 5, and 6 and including those with extratelencephalic (ET) projections, intratelencephalic (IT) projections, and pyramidal tract (PT) projections, among others.

Classes IPC  ?

  • C12N 15/67 - Méthodes générales pour favoriser l'expression
  • C12N 15/85 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes eucaryotes pour cellules animales
  • C12N 5/0793 - Neurones
  • A61K 48/00 - Préparations médicinales contenant du matériel génétique qui est introduit dans des cellules du corps vivant pour traiter des maladies génétiquesThérapie génique

65.

SEGMENTING 3D INTRACELLULAR STRUCTURES IN MICROSCOPY IMAGES USING AN ITERATIVE DEEP LEARNING WORKFLOW THAT INCORPORATES HUMAN CONTRIBUTIONS

      
Numéro d'application US2019058894
Numéro de publication 2020/092590
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2019-10-30
Date de publication 2020-05-07
Propriétaire ALLEN INSTITUTE (USA)
Inventeur(s)
  • Chen, Jianxu
  • Ding, Liya
  • Viana, Matheus Palhares
  • Rafelski, Susanne Marie

Abrégé

A facility for identifying the boundaries of 3-dimensional structures in 3-dimensional images is described. For each of multiple 3-dimensional images, the facility receives results of a first attempt to identify boundaries of structures in the 3-dimensional image, and causes the results of the first attempt to be presented to a person. For each of a number of 3-dimensional images, the facility receives input generated by the person providing feedback on the results of the first attempt. The facility then uses the following to train a deep-learning network to identify boundaries of 3-dimensional structures in 3-dimensional images: at least a portion of the plurality of 3-dimensional images, at least a portion of the received results, and at least a portion of provided feedback.

Classes IPC  ?

  • G06T 7/11 - Découpage basé sur les zones
  • G06T 3/00 - Transformations géométriques de l'image dans le plan de l'image
  • G06T 5/00 - Amélioration ou restauration d'image
  • G06T 5/20 - Amélioration ou restauration d'image utilisant des opérateurs locaux

66.

Segmenting 3D intracellular structures in microscopy images using an iterative deep learning workflow that incorporates human contributions

      
Numéro d'application 16669089
Numéro de brevet 11501446
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2019-10-30
Date de la première publication 2020-04-30
Date d'octroi 2022-11-15
Propriétaire Allen Institute (USA)
Inventeur(s)
  • Chen, Jianxu
  • Ding, Liya
  • Viana, Matheus Palhares
  • Rafelski, Susanne Marie

Abrégé

A facility for identifying the boundaries of 3-dimensional structures in 3-dimensional images is described. For each of multiple 3-dimensional images, the facility receives results of a first attempt to identify boundaries of structures in the 3-dimensional image, and causes the results of the first attempt to be presented to a person. For each of a number of 3-dimensional images, the facility receives input generated by the person providing feedback on the results of the first attempt. The facility then uses the following to train a deep-learning network to identify boundaries of 3-dimensional structures in 3-dimensional images: at least a portion of the plurality of 3-dimensional images, at least a portion of the received results, and at least a portion of provided feedback.

Classes IPC  ?

67.

ARTIFICIAL EXPRESSION CONSTRUCTS FOR SELECTIVELY MODULATING GENE EXPRESSION IN INTERNEURONS

      
Numéro d'application US2019054539
Numéro de publication 2020/076614
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2019-10-03
Date de publication 2020-04-16
Propriétaire
  • ALLEN INSTITUTE (USA)
  • SEATTLE CHILDREN'S HOSPITAL (D/B/A SEATTLE CHILDREN'S RESEARCH INSTITUTE) (USA)
Inventeur(s)
  • Ting, Jonathan
  • Levi, Boaz P.
  • Mich, John K.
  • Lein, Edward Sebastian
  • Kalume, Franck

Abrégé

Artificial expression constructs for selectively modulating gene expression in selected central nervous system cell types are described. The artificial expression constructs can be used to selectively express synthetic genes or modify gene expression in GABAergic interneurons.

Classes IPC  ?

  • C12N 15/09 - Technologie d'ADN recombinant
  • C12N 15/63 - Introduction de matériel génétique étranger utilisant des vecteursVecteurs Utilisation d'hôtes pour ceux-ciRégulation de l'expression
  • C12N 15/86 - Vecteurs viraux
  • C12N 15/864 - Vecteurs parvoviraux

68.

Systems, devices, and methods for image processing to generate an image having predictive tagging

      
Numéro d'application 16304021
Numéro de brevet 10935773
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2018-08-08
Date de la première publication 2019-12-19
Date d'octroi 2021-03-02
Propriétaire Allen Institute (USA)
Inventeur(s)
  • Johnson, Gregory
  • Ounkomol, Chawin
  • Collman, Forrest
  • Seshamani, Sharmishtaa

Abrégé

A computing device, method, system, and instructions in a non-transitory computer-readable medium for performing image analysis on 3D microscopy images to predict localization and/or labeling of various structures or objects of interest, by predicting the location in such images at which a dye or other marker associated with such structures would appear. The computing device, method, and system receives sets of 3D images that include unlabeled images, such as transmitted light images or electron microscope images, and labeled images, such as images captured with fluorescence tagging. The computing device trains a statistical model to associate structures in the labeled images with the same structures in the unlabeled light images. The processor further applies the statistical model to a new unlabeled image to generate a predictive labeled image that predicts the location of a structure of interest in the new image.

Classes IPC  ?

  • G02B 21/00 - Microscopes
  • G06T 7/187 - DécoupageDétection de bords impliquant des croissances de zonesDécoupageDétection de bords impliquant des fusions de zonesDécoupageDétection de bords impliquant un étiquetage de composantes connexes
  • G06T 7/11 - Découpage basé sur les zones
  • G06T 7/174 - DécoupageDétection de bords impliquant l'utilisation de plusieurs images
  • G06N 20/20 - Techniques d’ensemble en apprentissage automatique
  • G06N 3/04 - Architecture, p. ex. topologie d'interconnexion
  • G06N 3/08 - Méthodes d'apprentissage

69.

STEM CELL LINES CONTAINING ENDOGENOUS, DIFFERENTIALLY-EXPRESSED TAGGED PROTEINS, METHODS OF PRODUCTION, AND USE THEREOF

      
Numéro d'application US2019035852
Numéro de publication 2019/236893
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2019-06-06
Date de publication 2019-12-12
Propriétaire ALLEN INSTITUTE (USA)
Inventeur(s) Roberts, Brock

Abrégé

The present invention provides stably tagged cells, including stem cells and methods for producing such cells comprising one or more tagged, differentially-expressed proteins using a gene editing system. The methods described herein enable the insertion of large fluorescent tags into a plurality of genomic loci to generate stem cells that are phenotypically and functional similar to the un-modified parent population. Stem cells produced by the methods described herein additionally retain the capacity to self-renew and differentiate into specialized cell types and can be used in assays and visualization of three-dimensional live cell imaging.

Classes IPC  ?

  • C12N 15/63 - Introduction de matériel génétique étranger utilisant des vecteursVecteurs Utilisation d'hôtes pour ceux-ciRégulation de l'expression
  • C12N 9/22 - Ribonucléases
  • A61K 48/00 - Préparations médicinales contenant du matériel génétique qui est introduit dans des cellules du corps vivant pour traiter des maladies génétiquesThérapie génique

70.

RESCUING VOLTAGE-GATED SODIUM CHANNEL FUNCTION IN INHIBITORY NEURONS

      
Numéro d'application US2019026638
Numéro de publication 2019/199867
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2019-04-09
Date de publication 2019-10-17
Propriétaire
  • ALLEN INSTITUTE (USA)
  • SEATTLE CHILDREN'S HOSPITAL D/B/A SEATTLE CHILDREN'S RESEARCH INSTITUTE (USA)
Inventeur(s)
  • Mich, John K.
  • Lein, Edward Sebastian
  • Ting, Jonathan
  • Levi, Boaz P.
  • Hess, Erik
  • Kalume, Franck

Abrégé

Selectively providing voltage-gated sodium channel function sufficient to rescue impaired Nav1.1 function to inhibitory neurons is described. Provided voltage-gated sodium channel function sufficient to rescue impaired Nav1.1 function in inhibitory neurons can be used to treat disorders such as epilepsy, and more particularly, Dravet Syndrome.

Classes IPC  ?

  • A61K 31/7088 - Composés ayant au moins trois nucléosides ou nucléotides
  • A61K 31/7105 - Acides ribonucléiques naturels, c.-à-d. contenant uniquement des riboses liés à l'adénine, la guanine, la cytosine ou l'uracile et ayant des liaisons 3'-5' phosphodiester
  • A61K 31/7115 - Acides nucléiques ou oligonucléotides ayant des bases modifiées, c.-à-d. autres que l'adénine, la guanine, la cytosine, l'uracile ou la thymine
  • A61K 31/712 - Acides nucléiques ou oligonucléotides ayant des sucres modifiés, c.-à-d. autres que le ribose ou le 2'-désoxyribose
  • A61K 31/7125 - Acides nucléiques ou oligonucléotides ayant des liaisons internucléosides modifiées, c.-à-d. autres que des liaisons 3'-5' phosphodiester

71.

Miscellaneous Design

      
Numéro de série 88657292
Statut Enregistrée
Date de dépôt 2019-10-16
Date d'enregistrement 2020-07-28
Propriétaire Allen Institute, DBA Allen Institute for Brain Science; Allen Institute for Cell Science; Allen Institute for Immunology; Paul G. Allen Frontiers Group ()
Classes de Nice  ?
  • 09 - Appareils et instruments scientifiques et électriques
  • 41 - Éducation, divertissements, activités sportives et culturelles

Produits et services

Downloadable computer software for accessing medical and scientific research results Educational services, namely, providing classes, seminars, workshops and conferences in the fields of neuroscience and cell biology research, and distribution of informational materials therewith

72.

Miscellaneous Design

      
Numéro de série 88657295
Statut Enregistrée
Date de dépôt 2019-10-16
Date d'enregistrement 2020-03-31
Propriétaire Allen Institute, DBA ALLEN INSTITUTE FOR BRAIN SCIENCE; ALLEN INSTITUTE FOR CELL SCIENCE; ALLEN INSTITUTE FOR IMMUNOLOGY; PAUL G. ALLEN FRONTIERS GROUP ()
Classes de Nice  ? 41 - Éducation, divertissements, activités sportives et culturelles

Produits et services

Educational services, namely, providing classes, seminars, workshops and conferences in the fields of neuroscience and cell biology research, and distribution of informational materials therewith

73.

Miscellaneous Design

      
Numéro de série 88605850
Statut Enregistrée
Date de dépôt 2019-09-05
Date d'enregistrement 2020-07-28
Propriétaire Allen Institute, DBA Allen Institute for Brain Science; Allen Institute for Cell Science; Allen Institute for Immunology; Paul G. Allen Frontiers Group ()
Classes de Nice  ?
  • 41 - Éducation, divertissements, activités sportives et culturelles
  • 42 - Services scientifiques, technologiques et industriels, recherche et conception

Produits et services

Educational services, namely, providing training, classes, workshops, seminars, symposia and conferences in the fields of human and animal biology research, and distributing informational materials in connection therewith Scientific and technological services, namely, science research information in the fields of science and medicine

74.

SYSTEMS, APPARATUSES, AND METHODS FOR SIMULTANEOUS MULTI-PLANE IMAGING

      
Numéro d'application US2018064909
Numéro de publication 2019/118433
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2018-12-11
Date de publication 2019-06-20
Propriétaire ALLEN INSTITUTE (USA)
Inventeur(s)
  • Tsyboulski, Dmitri
  • Orlova, Natalia
  • Lecoq, Jérôme, Anthony
  • Saggau, Peter

Abrégé

A system includes a light source to generate an optical signal having a set of pulses at a first repetition rate. The system also includes a multiplexer circuit to generate a multiplexed optical signal from the optical signal n sets of pulses at a second repetition rate, where the n sets of pulses have different polarization states and are at the first repetition rate. The system also includes a focusing unit to split the multiplexed optical signal into n excitation signals to excite a sample. The system also includes an objective to receive the n excitation signals and to illuminate the sample. The objective and the focusing unit collectively focus each excitation signal of the n excitation signals on a different focal plane of the sample to generate a response signal. The system also includes a demultiplexer circuit to generate n emission signals based on the response signal.

Classes IPC  ?

  • G02B 21/00 - Microscopes
  • G02B 21/18 - Aménagements avec plus d'un parcours de lumière, p. ex. pour comparer deux échantillons
  • G02B 27/28 - Systèmes ou appareils optiques non prévus dans aucun des groupes , pour polariser

75.

SYSTEMS, DEVICES, AND METHODS FOR IMAGE PROCESSING TO GENERATE AN IMAGE HAVING PREDICTIVE TAGGING

      
Numéro d'application US2018045840
Numéro de publication 2019/032723
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2018-08-08
Date de publication 2019-02-14
Propriétaire ALLEN INSTITUTE (USA)
Inventeur(s)
  • Johnson, Gregory
  • Ounkomol, Chawin
  • Collman, Forrest
  • Seshamani, Sharmishtaa

Abrégé

A computing device, method, system, and instructions in a non-transitory computerreadable medium for performing image analysis on 3D microscopy images to predict localization and/or labeling of various structures or objects of interest, by predicting the location in such images at which a dye or other marker associated with such structures would appear. The computing device, method, and system receives sets of 3D images that include unlabeled images, such as transmitted light images or electron microscope images, and labeled images, such as images captured with fluorescence tagging. The computing device trains a statistical model to associate structures in the labeled images with the same structures in the unlabeled light images. The processor further applies the statistical model to a new unlabeled image to generate a predictive labeled image that predicts the location of a structure of interest in the new image.

Classes IPC  ?

  • A61B 5/0275 - Mesure du débit sanguin utilisant des marqueurs, p. ex. dilution de colorant
  • G06K 9/66 - Méthodes ou dispositions pour la reconnaissance utilisant des moyens électroniques utilisant des comparaisons ou corrélations simultanées de signaux images avec une pluralité de références, p.ex. matrice de résistances avec des références réglables par une méthode adaptative, p.ex. en s'instruisant

76.

GENETICALLY-TAGGED STEM CELL LINES AND METHODS OF USE

      
Numéro d'application US2018017708
Numéro de publication 2018/148603
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2018-02-09
Date de publication 2018-08-16
Propriétaire ALLEN INSTITUTE (USA)
Inventeur(s)
  • Gunawardane, Ruwanthi
  • Roberts, Brock
  • Haupt, Amanda
  • Horwitz, Rick
  • Wiegraebe, Winfried
  • Gaudreault, Nathalie
  • Bialy, Nikki
  • Rafelski, Susanne
  • Johnson, Graham
  • Mueller, Irina
  • Hookway, Caroline
  • Tucker, Andrew

Abrégé

The present invention provides stably tagged stem cells and methods for producing stem cells comprising one or more tagged proteins using a gene editing system. The methods described herein enable the insertion of large fluorescent tags into a plurality of genomic loci to generate stem cells that are phenotypically and functional similar to the un-modified parent population. Stem cells produced by the methods described herein additionally retain the capacity to self-renew and differentiate into specialized cell types and can be used in assays and visualization of three- dimensional live cell imaging.

Classes IPC  ?

  • A61K 38/46 - Hydrolases (3)
  • C12N 9/22 - Ribonucléases
  • C12N 15/85 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes eucaryotes pour cellules animales
  • C12N 15/90 - Introduction stable d'ADN étranger dans le chromosome

77.

Miscellaneous Design

      
Numéro de série 87264037
Statut Enregistrée
Date de dépôt 2016-12-09
Date d'enregistrement 2018-02-27
Propriétaire Allen Institute, DBA Allen Institute for Brain Science; Allen Institute for Cell Science ()
Classes de Nice  ?
  • 09 - Appareils et instruments scientifiques et électriques
  • 41 - Éducation, divertissements, activités sportives et culturelles
  • 42 - Services scientifiques, technologiques et industriels, recherche et conception

Produits et services

Computer software for accessing medical and scientific research results downloadable via the internet Educational services, namely, providing training, classes, workshops, seminars and conferences in the field of cell biology research, and distributing informational materials in connection therewith Medical and scientific research, namely, providing temporary use of non-downloadable computer software for accessing medical and scientific research results

78.

ALLEN INSTITUTE FOR CELL SCIENCE

      
Numéro de série 87264025
Statut Enregistrée
Date de dépôt 2016-12-09
Date d'enregistrement 2018-02-27
Propriétaire Allen Institute, DBA Allen Institute for Brain Science, Allen Institute for Cell Science ()
Classes de Nice  ?
  • 09 - Appareils et instruments scientifiques et électriques
  • 41 - Éducation, divertissements, activités sportives et culturelles
  • 42 - Services scientifiques, technologiques et industriels, recherche et conception

Produits et services

Computer software for accessing medical and scientific research results downloadable via the internet Educational services, namely, providing training, classes, workshops, seminars and conferences in the field of cell biology research, and distributing informational materials in connection therewith Medical and scientific research, namely, providing temporary use of non-downloadable computer software for accessing medical and scientific research results

79.

ALLEN INSTITUTE

      
Numéro de série 87264038
Statut Enregistrée
Date de dépôt 2016-12-09
Date d'enregistrement 2017-08-08
Propriétaire Allen Institute, DBA Allen Institute for Brain Science; Allen Institute for Cell Science ()
Classes de Nice  ?
  • 09 - Appareils et instruments scientifiques et électriques
  • 41 - Éducation, divertissements, activités sportives et culturelles
  • 42 - Services scientifiques, technologiques et industriels, recherche et conception

Produits et services

Computer software for accessing medical and scientific research results downloadable via the internet Educational services, namely, providing classes, seminars, workshops and conferences in the fields of neuroscience and cell biology research, and distribution of informational materials therewith Medical and scientific research, namely, providing temporary use of non-downloadable software for accessing medical and scientific results

80.

METHODS TO ISOLATE HIGH QUALITY RNA FROM FIXED SAMPLES

      
Numéro d'application US2016025077
Numéro de publication 2016/161023
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2016-03-30
Date de publication 2016-10-06
Propriétaire
  • PRESIDENT AND FELLOWS OF HARVARD COLLEGE (USA)
  • ALLEN INSTITUTE (USA)
Inventeur(s)
  • Jang, Sumin
  • Thomsen, Elliot, R.
  • Doyle, Adele, M.
  • Levi, Boaz, P.
  • Ramanathan, Sharad

Abrégé

Some aspects of this disclosure provide compositions, methods, and kits for isolating RNA from fixed biological samples. Such compositions, methods, and kits are useful for isolating intact (e.g., not degraded or fragmented) RNA, for example, RNA having an RNA integrity number (RIN) ≥ 8.0.

Classes IPC  ?

  • C12N 15/10 - Procédés pour l'isolement, la préparation ou la purification d'ADN ou d'ARN
  • C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques
  • G01N 1/28 - Préparation d'échantillons pour l'analyse
  • G01N 1/30 - TeintureImprégnation

81.

Miscellaneous Design

      
Numéro de série 85582032
Statut Enregistrée
Date de dépôt 2012-03-28
Date d'enregistrement 2012-11-13
Propriétaire ALLEN INSTITUTE, DBA ALLEN INSTITUTE FOR BRAIN SCIENCE; ALLEN INSTITUTE FOR CELL SCIENCE; ALLEN INSTITUTE FOR IMMUNOLOGY; ALLEN INSTITUTE FOR NEURAL DYNAMICS; PAUL G. ALLEN FRONTIERS GROUP ()
Classes de Nice  ?
  • 09 - Appareils et instruments scientifiques et électriques
  • 42 - Services scientifiques, technologiques et industriels, recherche et conception

Produits et services

Computer software for accessing medical and scientific research results downloadable via the internet Medical and scientific research, namely, providing temporary use of non-downloadable software for accessing medical and scientific results

82.

ALLEN

      
Numéro de série 77809537
Statut Enregistrée
Date de dépôt 2009-08-20
Date d'enregistrement 2010-03-02
Propriétaire ALLEN INSTITUTE, DBA ALLEN INSTITUTE FOR BRAIN SCIENCE; ALLEN INSTITUTE FOR CELL SCIENCE ()
Classes de Nice  ? 42 - Services scientifiques, technologiques et industriels, recherche et conception

Produits et services

A house mark for medical and scientific research, namely, providing temporary use of non-downloadable computer software for accessing medical and scientific research results

83.

ALLEN

      
Numéro de série 77807910
Statut Enregistrée
Date de dépôt 2009-08-19
Date d'enregistrement 2010-03-02
Propriétaire ALLEN INSTITUTE, DBA ALLEN INSTITUTE FOR BRAIN SCIENCE; ALLEN INSTITUTE FOR CELL SCIENCE ()
Classes de Nice  ? 42 - Services scientifiques, technologiques et industriels, recherche et conception

Produits et services

A house mark for medical and scientific research, namely, providing temporary use of non-downloadable computer software for accessing medical and scientific research results

84.

ALLEN INSTITUTE FOR BRAIN SCIENCE

      
Numéro de série 77789337
Statut Enregistrée
Date de dépôt 2009-07-24
Date d'enregistrement 2010-03-02
Propriétaire ALLEN INSTITUTE, DBA ALLEN INSTITUTE FOR BRAIN SCIENCE; ALLEN INSTITUTE FOR CELL SCIENCE; ALLEN INSTITUTE FOR IMMUNOLOGY; PAUL G. ALLEN FRONTIERS GROUP ()
Classes de Nice  ?
  • 09 - Appareils et instruments scientifiques et électriques
  • 42 - Services scientifiques, technologiques et industriels, recherche et conception

Produits et services

Computer software for accessing medical and scientific research results downloadable via the internet Medical and scientific research, namely, providing temporary use of non-downloadable software for accessing medical and scientific results

85.

ALLEN INSTITUTE FOR BRAIN SCIENCE

      
Numéro de série 77786266
Statut Enregistrée
Date de dépôt 2009-07-21
Date d'enregistrement 2010-03-02
Propriétaire ALLEN INSTITUTE, DBA ALLEN INSTITUTE FOR BRAIN SCIENCE; ALLEN INSTITUTE FOR CELL SCIENCE ()
Classes de Nice  ?
  • 09 - Appareils et instruments scientifiques et électriques
  • 42 - Services scientifiques, technologiques et industriels, recherche et conception

Produits et services

Computer software for accessing medical and scientific research results downloadable via the internet Medical and scientific research, namely, providing temporary use of non-downloadable software for accessing medical and scientific search results

86.

BRAIN EXPLORER

      
Numéro de série 78913896
Statut Enregistrée
Date de dépôt 2006-06-21
Date d'enregistrement 2007-12-25
Propriétaire ALLEN INSTITUTE, DBA ALLEN INSTITUTE FOR BRAIN SCIENCE; ALLEN INSTITUTE FOR CELL SCIENCE ()
Classes de Nice  ? 09 - Appareils et instruments scientifiques et électriques

Produits et services

computer software for accessing medical and scientific research results downloadable via the Internet