The disclosure provides methods and systems for sample screening which may involve screening samples in presence and/or absence of effectors (e.g., encoded effector/compound libraries) for their potential effects on the sample or a target, in some cases, a sample comprising a cell or constituent of a cell, a target (e.g., an enzyme) in a cell or a target in a cell-free sample (e.g., in a biochemical assay with a purified target extracted from a cell). The disclosure further provides methods and systems for computational screening and predictive analysis.
C40B 20/04 - Identification des éléments d'une bibliothèque au moyen d'une étiquette, d'un marqueur ou d'un autre identificateur lisible ou détectable, p. ex. procédés de décodage
C40B 30/04 - Procédés de criblage des bibliothèques en mesurant l'aptitude spécifique à se lier à une molécule cible, p. ex. liaison anticorps-antigène, liaison récepteur-ligand
C40B 50/16 - Synthèse en phase solide, c.-à-d. dans laquelle au moins un bloc servant à créer la bibliothèque est lié à un support solide au cours de la création de la bibliothèqueProcédés particuliers de clivage à partir du support solide comprenant des étapes de codage
The disclosure provides methods and systems for sample screening which may involve screening samples in presence and/or absence of effectors (e.g., encoded effector/compound libraries) for their potential effects on the sample and/or a target, in some cases, a sample comprising a cell or constituent of a cell, an enzyme in a cell or a target in a cell-free sample. The methods and systems presented herein can comprise miniaturized systems for high-throughput sample screening with vast applications including but not limited to cell screening and cell perturbation analysis including encoded effector library screening.
B01L 3/00 - Récipients ou ustensiles pour laboratoires, p. ex. verrerie de laboratoireCompte-gouttes
C40B 20/04 - Identification des éléments d'une bibliothèque au moyen d'une étiquette, d'un marqueur ou d'un autre identificateur lisible ou détectable, p. ex. procédés de décodage
G01N 33/50 - Analyse chimique de matériau biologique, p. ex. de sang ou d'urineTest par des méthodes faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiques par ligandsTest immunologique
3.
METHODS AND SYSTEMS FOR ENCODED EFFECTOR SCREENING
The disclosure provides methods and systems for sample screening which may involve screening samples in presence and/or absence of effectors (e.g., encoded effector/compound libraries) for their potential effects on the sample or a target, in some cases, a sample comprising a cell or constituent of a cell, a target (e.g., an enzyme) in a cell or a target in a cell-free sample (e.g., in a biochemical assay with a purified target extracted from a cell). A variety of encoding modalities including nucleic acid barcodes and optical barcodes are disclosed. The methods and systems presented herein can comprise miniaturized systems for high-throughput sample screening with vast applications including but not limited to cell screening and cell perturbation analysis such as encoded effector library screening.
C40B 60/02 - Appareils intégrés spécialement adaptés à la création, au criblage de bibliothèques et à l'identification des éléments des bibliothèques
B01L 3/00 - Récipients ou ustensiles pour laboratoires, p. ex. verrerie de laboratoireCompte-gouttes
C07H 21/00 - Composés contenant au moins deux unités mononucléotide comportant chacune des groupes phosphate ou polyphosphate distincts liés aux radicaux saccharide des groupes nucléoside, p. ex. acides nucléiques
C07K 17/08 - Peptides immobilisés sur, ou dans, un support organique le support étant un polymère synthétique
C08F 257/02 - Composés macromoléculaires obtenus par polymérisation de monomères sur des polymères de monomères aromatiques tels que définis dans le groupe sur des polymères de styrène ou de styrène substitué par des groupes alkyle
C08F 283/06 - Composés macromoléculaires obtenus par polymérisation de monomères sur des polymères prévus par la sous-classe sur des polyéthers, des polyoxyméthylènes ou des polyacétals
C12N 15/10 - Procédés pour l'isolement, la préparation ou la purification d'ADN ou d'ARN
C40B 20/04 - Identification des éléments d'une bibliothèque au moyen d'une étiquette, d'un marqueur ou d'un autre identificateur lisible ou détectable, p. ex. procédés de décodage
C40B 30/04 - Procédés de criblage des bibliothèques en mesurant l'aptitude spécifique à se lier à une molécule cible, p. ex. liaison anticorps-antigène, liaison récepteur-ligand
Provided are methods and systems useful for screening large libraries of effector molecules. Such methods and systems are particularly useful in microfluidic systems and devices. The methods and systems provided herein utilize encoded effectors to screen large libraries of effectors.
C12Q 1/6876 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes
C40B 50/06 - Procédés biochimiques, p. ex. utilisant des enzymes ou des micro-organismes viables entiers
C40B 50/16 - Synthèse en phase solide, c.-à-d. dans laquelle au moins un bloc servant à créer la bibliothèque est lié à un support solide au cours de la création de la bibliothèqueProcédés particuliers de clivage à partir du support solide comprenant des étapes de codage
Provided are methods and systems useful for screening large libraries of effector molecules. Such methods and systems are particularly useful in microfluidic systems and devices. The methods and systems provided herein utilize encoded effectors to screen large libraries of effectors.
C12Q 1/6876 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes
C40B 50/06 - Procédés biochimiques, p. ex. utilisant des enzymes ou des micro-organismes viables entiers
C40B 50/16 - Synthèse en phase solide, c.-à-d. dans laquelle au moins un bloc servant à créer la bibliothèque est lié à un support solide au cours de la création de la bibliothèqueProcédés particuliers de clivage à partir du support solide comprenant des étapes de codage
Provided are methods and systems useful for screening large libraries of effector molecules. Such methods and systems are particularly useful in microfluidic systems and devices. The methods and systems provided herein utilize encoded effectors to screen large libraries of effectors.
C12Q 1/6876 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes
C40B 50/06 - Procédés biochimiques, p. ex. utilisant des enzymes ou des micro-organismes viables entiers
C40B 50/16 - Synthèse en phase solide, c.-à-d. dans laquelle au moins un bloc servant à créer la bibliothèque est lié à un support solide au cours de la création de la bibliothèqueProcédés particuliers de clivage à partir du support solide comprenant des étapes de codage
Provided are methods and systems useful for screening large libraries of effector molecules. Such methods and systems are particularly useful in microfluidic systems and devices. The methods and systems provided herein utilize encoded effectors to screen large libraries of effectors.
B01L 3/00 - Récipients ou ustensiles pour laboratoires, p. ex. verrerie de laboratoireCompte-gouttes
C12N 15/10 - Procédés pour l'isolement, la préparation ou la purification d'ADN ou d'ARN
C40B 50/06 - Procédés biochimiques, p. ex. utilisant des enzymes ou des micro-organismes viables entiers
C40B 50/16 - Synthèse en phase solide, c.-à-d. dans laquelle au moins un bloc servant à créer la bibliothèque est lié à un support solide au cours de la création de la bibliothèqueProcédés particuliers de clivage à partir du support solide comprenant des étapes de codage
Provided are methods and systems useful for screening large libraries of effector molecules. Such methods and systems are particularly useful in microfluidic systems and devices. The methods and systems provided herein utilize encoded effectors to screen large libraries of effectors.
C12Q 1/6876 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes
C40B 50/06 - Procédés biochimiques, p. ex. utilisant des enzymes ou des micro-organismes viables entiers
C40B 50/16 - Synthèse en phase solide, c.-à-d. dans laquelle au moins un bloc servant à créer la bibliothèque est lié à un support solide au cours de la création de la bibliothèqueProcédés particuliers de clivage à partir du support solide comprenant des étapes de codage
Provided are methods and systems useful for screening large libraries of effector molecules. Such methods and systems are particularly useful in microfluidic systems and devices. The methods and systems provided herein utilize encoded effectors to screen large libraries of effectors.
C12Q 1/6876 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes
C40B 50/06 - Procédés biochimiques, p. ex. utilisant des enzymes ou des micro-organismes viables entiers
C40B 50/16 - Synthèse en phase solide, c.-à-d. dans laquelle au moins un bloc servant à créer la bibliothèque est lié à un support solide au cours de la création de la bibliothèqueProcédés particuliers de clivage à partir du support solide comprenant des étapes de codage
Provided are methods and systems useful for screening large libraries of effector molecules. Such methods and systems are particularly useful in microfluidic systems and devices. The methods and systems provided herein utilize encoded effectors to screen large libraries of effectors.
C40B 50/06 - Procédés biochimiques, p. ex. utilisant des enzymes ou des micro-organismes viables entiers
C40B 50/16 - Synthèse en phase solide, c.-à-d. dans laquelle au moins un bloc servant à créer la bibliothèque est lié à un support solide au cours de la création de la bibliothèqueProcédés particuliers de clivage à partir du support solide comprenant des étapes de codage
C40B 20/04 - Identification des éléments d'une bibliothèque au moyen d'une étiquette, d'un marqueur ou d'un autre identificateur lisible ou détectable, p. ex. procédés de décodage
C40B 30/08 - Procédés de criblage des bibliothèques en mesurant l'activité catalytique
C12Q 1/6876 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes
Provided are methods and systems useful for screening large libraries of effector molecules. Such methods and systems are particularly useful in microfluidic systems and devices. The methods and systems provided herein utilize encoded effectors to screen large libraries of effectors.
B01L 3/00 - Récipients ou ustensiles pour laboratoires, p. ex. verrerie de laboratoireCompte-gouttes
C12N 15/10 - Procédés pour l'isolement, la préparation ou la purification d'ADN ou d'ARN
C40B 50/06 - Procédés biochimiques, p. ex. utilisant des enzymes ou des micro-organismes viables entiers
C40B 50/16 - Synthèse en phase solide, c.-à-d. dans laquelle au moins un bloc servant à créer la bibliothèque est lié à un support solide au cours de la création de la bibliothèqueProcédés particuliers de clivage à partir du support solide comprenant des étapes de codage
C40B 20/04 - Identification des éléments d'une bibliothèque au moyen d'une étiquette, d'un marqueur ou d'un autre identificateur lisible ou détectable, p. ex. procédés de décodage
C40B 30/08 - Procédés de criblage des bibliothèques en mesurant l'activité catalytique
C12Q 1/686 - Réaction en chaine par polymérase [PCR]
Provided are methods and systems useful for screening large libraries of effector molecules. Such methods and systems are particularly useful in microfluidic systems and devices. The methods and systems provided herein utilize encoded effectors to screen large libraries of effectors.
A61K 47/64 - Conjugués médicament-peptide, médicament-protéine ou médicament-acide polyaminé, c.-à-d. l’agent de modification étant un peptide, une protéine ou un acide polyaminé lié par covalence ou complexé à un agent thérapeutiquement actif
C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques
C12Q 1/6876 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes
C40B 20/04 - Identification des éléments d'une bibliothèque au moyen d'une étiquette, d'un marqueur ou d'un autre identificateur lisible ou détectable, p. ex. procédés de décodage
C40B 30/04 - Procédés de criblage des bibliothèques en mesurant l'aptitude spécifique à se lier à une molécule cible, p. ex. liaison anticorps-antigène, liaison récepteur-ligand
Provided are methods and systems useful for screening large libraries of effector molecules. Such methods and systems are particularly useful in microfluidic systems and devices. The methods and systems provided herein utilize encoded effectors to screen large libraries of effectors.
C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques
C12Q 1/6811 - Méthodes de sélection pour la production ou l’élaboration d’oligonucléotides spécifiques cibles ou de molécules de liaison
C12M 1/34 - Mesure ou test par des moyens de mesure ou de détection des conditions du milieu, p. ex. par des compteurs de colonies
C12N 15/10 - Procédés pour l'isolement, la préparation ou la purification d'ADN ou d'ARN
C40B 20/04 - Identification des éléments d'une bibliothèque au moyen d'une étiquette, d'un marqueur ou d'un autre identificateur lisible ou détectable, p. ex. procédés de décodage
C40B 30/00 - Procédés de criblage des bibliothèques
C40B 30/04 - Procédés de criblage des bibliothèques en mesurant l'aptitude spécifique à se lier à une molécule cible, p. ex. liaison anticorps-antigène, liaison récepteur-ligand
C40B 30/06 - Procédés de criblage des bibliothèques en mesurant les effets sur des cellules, des tissus ou des organismes vivants
C40B 50/10 - Synthèse en phase liquide, c.-à-d. dans laquelle tous les blocs servant à créer la bibliothèque sont en phase liquide ou en solution au cours de la création de la bibliothèqueProcédés particuliers de clivage à partir du support liquide comprenant des étapes de codage
C40B 70/00 - Étiquettes ["tags"] ou marqueurs ["labels"] spécialement adaptés à la chimie combinatoire ou aux chimiothèques, p. ex. "tags" fluorescents ou codes-barres
G01N 33/50 - Analyse chimique de matériau biologique, p. ex. de sang ou d'urineTest par des méthodes faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiques par ligandsTest immunologique
Provided are methods and systems useful for screening large libraries of effector molecules. Such methods and systems are particularly useful in microfluidic systems and devices. The methods and systems provided herein utilize encoded effectors to screen large libraries of effectors.
C12Q 1/686 - Réaction en chaine par polymérase [PCR]
C12Q 1/6876 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes
C40B 20/04 - Identification des éléments d'une bibliothèque au moyen d'une étiquette, d'un marqueur ou d'un autre identificateur lisible ou détectable, p. ex. procédés de décodage
C40B 30/08 - Procédés de criblage des bibliothèques en mesurant l'activité catalytique
C40B 50/06 - Procédés biochimiques, p. ex. utilisant des enzymes ou des micro-organismes viables entiers
C40B 50/16 - Synthèse en phase solide, c.-à-d. dans laquelle au moins un bloc servant à créer la bibliothèque est lié à un support solide au cours de la création de la bibliothèqueProcédés particuliers de clivage à partir du support solide comprenant des étapes de codage
Provided are methods and systems useful for screening large libraries of effector molecules. Such methods and systems are particularly useful in microfluidic systems and devices. The methods and systems provided herein utilize encoded effectors to screen large libraries of effectors.
C40B 50/06 - Procédés biochimiques, p. ex. utilisant des enzymes ou des micro-organismes viables entiers
C40B 50/16 - Synthèse en phase solide, c.-à-d. dans laquelle au moins un bloc servant à créer la bibliothèque est lié à un support solide au cours de la création de la bibliothèqueProcédés particuliers de clivage à partir du support solide comprenant des étapes de codage
C40B 20/04 - Identification des éléments d'une bibliothèque au moyen d'une étiquette, d'un marqueur ou d'un autre identificateur lisible ou détectable, p. ex. procédés de décodage
C40B 30/08 - Procédés de criblage des bibliothèques en mesurant l'activité catalytique
C12Q 1/6876 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes
Provided are methods and systems useful for screening large libraries of effector molecules. Such methods and systems are particularly useful in microfluidic systems and devices. The methods and systems provided herein utilize encoded effectors to screen large libraries of effectors.
C12Q 1/6876 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes
C40B 50/06 - Procédés biochimiques, p. ex. utilisant des enzymes ou des micro-organismes viables entiers
C40B 50/16 - Synthèse en phase solide, c.-à-d. dans laquelle au moins un bloc servant à créer la bibliothèque est lié à un support solide au cours de la création de la bibliothèqueProcédés particuliers de clivage à partir du support solide comprenant des étapes de codage
C40B 20/04 - Identification des éléments d'une bibliothèque au moyen d'une étiquette, d'un marqueur ou d'un autre identificateur lisible ou détectable, p. ex. procédés de décodage
C40B 30/08 - Procédés de criblage des bibliothèques en mesurant l'activité catalytique
brevets
